RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324444.7

SYNE4-201, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SYNE4, Length 1,354 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-201ENST00000324444 WDR78Q5VTH9 848 aa20.3■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 CEP57L1Q8IYX8 460 aa20.3■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 KCTD17Q8N5Z5 321 aa20.3■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 CNNM3Q8NE01 707 aa20.3■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 RASSF8Q8NHQ8 419 aa20.3■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 ERMNQ8TAM6 284 aa20.3■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 CALML4Q96GE6 196 aa20.3■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 TAAR1Q96RJ0 339 aa20.3■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 PDCD2LQ9BRP1 358 aa20.3■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 CUEDC2Q9H467 287 aa20.3■□□□□ 0.84
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SYNE4-201ENST00000324444 FAM86B2P0C5J1 330 aa20.29■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 KRT79Q5XKE5 535 aa20.29■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 ABRAQ8N0Z2 381 aa20.29■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 TRIB2Q92519 343 aa20.29■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 WDR11Q9BZH6 1224 aa20.29■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 MAGEF1Q9HAY2 307 aa20.29■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa20.29■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 CEP290O15078 2479 aa20.29■□□□□ 0.84
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SYNE4-201ENST00000324444 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa20.28■□□□□ 0.84
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SYNE4-201ENST00000324444 GRIN1Q05586 938 aa20.28■□□□□ 0.84
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SYNE4-201ENST00000324444 MORN1Q5T089 497 aa20.28■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 KRBA2Q6ZNG9 492 aa20.28■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 VSIG10LQ86VR7 867 aa20.28■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 ETNPPLQ8TBG4 499 aa20.28■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 USP6NLQ92738 828 aa20.28■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 HAS1Q92839 578 aa20.28■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 MMP19Q99542 508 aa20.28■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 RIT2Q99578 217 aa20.28■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP20.28■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 JADE2Q9NQC1 790 aa20.28■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa20.28■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa20.27■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa20.27■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
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SYNE4-201ENST00000324444 SLFN14P0C7P3 912 aa20.27■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
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SYNE4-201ENST00000324444 HAUS3Q68CZ6 603 aa20.27■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa20.27■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 CABP7Q86V35 215 aa20.27■□□□□ 0.84
SYNE4-201ENST00000324444 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
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SYNE4-201ENST00000324444 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa20.27■□□□□ 0.84
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SYNE4-201ENST00000324444 STXBP2Q15833 593 aa20.26■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 RRAGBQ5VZM2 374 aa20.26■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 SASS6Q6UVJ0 657 aa20.26■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 LRSAM1Q6UWE0 723 aa20.26■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 SLC5A5Q92911 643 aa20.26■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 APBA2Q99767 749 aa20.26■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF577Q9BSK1 485 aa20.26■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 NT5C3AQ9H0P0 336 aa20.26■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 ASTN1O14525 1302 aa20.25■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 MSH4O15457 936 aa20.25■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 MYL1P05976 194 aa20.25■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 CCDC192P0DO97 292 aa20.25■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 MTMR1Q13613 665 aa20.25■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 CCL14Q16627 93 aa20.25■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 FAM133AQ8N9E0 248 aa20.25■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 TEKT3Q9BXF9 490 aa20.25■□□□□ 0.83
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SYNE4-201ENST00000324444 DISC1Q9NRI5 854 aa20.25■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 SLC5A4Q9NY91 659 aa20.25■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 SYCE3A1L190 88 aa20.24■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 SLC15A5A6NIM6 579 aa20.24■□□□□ 0.83
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SYNE4-201ENST00000324444 CAVIN2O95810 425 aa20.24■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 CAPN2P17655 700 aa20.24■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 STAT6P42226 847 aa20.24■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 MAP2K5Q13163 448 aa20.24■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 GRB14Q14449 540 aa20.24■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 CAMK4Q16566 473 aa20.24■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 LRCH2Q5VUJ6 765 aa20.24■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 FGD4Q96M96 766 aa20.24■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa20.24■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 STK17AQ9UEE5 414 aa20.24■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 ITGB5P18084 799 aa20.23■□□□□ 0.83
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