RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP25.37■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 ARSHQ5FYA8 562 aa25.37■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 DNM3Q9UQ16 869 aa25.37■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa25.37■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 RIPK3Q9Y572 518 aa25.37■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 PHIPQ8WWQ0 1821 aa25.36■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 ADKP55263 362 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 RPS6P62753 249 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 SETQ01105 290 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 PSMD2Q13200 908 aa25.36■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 LRRC41Q15345 812 aa25.36■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 TMX1Q9H3N1 280 aa25.36■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 GAS7O60861 476 aa25.35■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 FDX1P10109 184 aa25.35■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 PPP2R5CQ13362 524 aa25.35■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 CENPPQ6IPU0 288 aa25.35■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 TC2NQ8N9U0 490 aa25.35■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 DSG3P32926 999 aa25.35■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 REPS2Q8NFH8 660 aa25.35■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 TAAR1Q96RJ0 339 aa25.35■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa25.35■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 PARP14Q460N5 1801 aa25.34■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 VGLL4Q14135 290 aa25.34■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 SULF1Q8IWU6 871 aa25.34■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 HSD17B14Q9BPX1 270 aa25.34■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 TMOD4Q9NZQ9 345 aa25.34■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa25.34■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 CEP135Q66GS9 1140 aa25.34■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC65Q8IXS2 484 aa25.34■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa25.34■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 WDR11Q9BZH6 1224 aa25.34■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 TBC1D7Q9P0N9 293 aa25.34■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 NRDCO43847 1150 aa25.33■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 COG2Q14746 738 aa25.33■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 FAM26FQ5R3K3 315 aa25.33■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 NSMFQ6X4W1 530 aa25.33■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 RNF207Q6ZRF8 634 aa25.33■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa25.33■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 DYDC2Q96IM9 177 aa25.33■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 UNC45AQ9H3U1 944 aa25.33■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 PNMA2Q9UL42 364 aa25.33■■□□□ 1.65
VSTM4-201ENST00000298454 SLITRK3O94933 977 aa25.32■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 KRT18P05783 430 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM139Q8IV31 216 aa25.32■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC112Q8NEF3 446 aa25.32■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 RNF146Q9NTX7 359 aa25.32■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 PKD2L1Q9P0L9 805 aa25.32■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa25.32■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 MAP3K9P80192 1104 aa25.32■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 RBL2Q08999 1139 aa25.32■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 TPH2Q8IWU9 490 aa25.32■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 BHMT2Q9H2M3 363 aa25.32■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 KCNH7Q9NS40 1196 aa25.32■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa25.32■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 RLFQ13129 1914 aa25.32■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM132BQ14DG7 1078 aa25.31■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 PCNX4Q63HM2 1172 aa25.31■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 KRT26Q7Z3Y9 468 aa25.31■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa25.31■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 TEKT3Q9BXF9 490 aa25.31■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 TUFT1Q9NNX1 390 aa25.31■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 GIT2Q14161 759 aa25.31■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 B3GNT9Q6UX72 402 aa25.31■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 SAMD3Q8N6K7 520 aa25.31■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 PIGOQ8TEQ8 1089 aa25.31■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 CPLX3Q8WVH0 158 aa25.31■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 ZHX3Q9H4I2 956 aa25.31■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa25.31■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 FRMPD4Q14CM0 1322 aa25.3■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 FRMD3A2A2Y4 597 aa25.3■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 BCRP11274 1271 aa25.3■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 UBXN1Q04323 297 aa25.3■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 PGM5Q15124 567 aa25.3■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 TKFCQ3LXA3 575 aa25.3■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 MYOCDQ8IZQ8 938 aa25.3■■□□□ 1.64
VSTM4-201ENST00000298454 ITIH6Q6UXX5 1313 aa25.3■■□□□ 1.64
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