RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 PCP11498 1178 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 ID4P47928 161 aa9.19□□□□□ -0.94
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PGGT1B-201ENST00000296642 ADAM15Q13444 863 aa9.19□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
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PGGT1B-201ENST00000296642 TTBK2Q6IQ55 1244 aa9.19□□□□□ -0.94
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PGGT1B-201ENST00000296642 LOC730098B7Z3J9 87 aa9.18□□□□□ -0.94
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PGGT1B-201ENST00000296642 NOVP48745 357 aa9.18□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF543Q08ER8 600 aa9.18□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 MBTPS1Q14703 1052 aa9.18□□□□□ -0.94
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PGGT1B-201ENST00000296642 TRAF7Q6Q0C0 670 aa9.18□□□□□ -0.94
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PGGT1B-201ENST00000296642 NLRC5Q86WI3 1866 aa9.18□□□□□ -0.94
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PGGT1B-201ENST00000296642 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM47Q9BQJ4 181 aa9.18□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 USP26Q9BXU7 913 aa9.18□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 INCENPQ9NQS7 918 aa9.18□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM86C1Q9NVL1 165 aa9.18□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
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PGGT1B-201ENST00000296642 TTC41PQ6P2S7 1318 aa9.17□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 H0Y858 1186 aa9.17□□□□□ -0.94
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PGGT1B-201ENST00000296642 NR3C2P08235 984 aa9.17□□□□□ -0.94
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PGGT1B-201ENST00000296642 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa9.17□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 PANK1Q8TE04 598 aa9.17□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa9.17□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 NEK1Q96PY6 1258 aa9.17□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 TAAR1Q96RJ0 339 aa9.17□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 FTHL17Q9BXU8 183 aa9.17□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 TLR9Q9NR96 1032 aa9.17□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 AAASQ9NRG9 546 aa9.17□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 GGPS1O95749 300 aa9.16□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa9.16□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa9.16□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 TIE1P35590 1138 aa9.16□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 RRP1P56182 461 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 UBE3AQ05086 875 aa9.16□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 CTDSPL2Q05D32 466 aa9.16□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 NEDD9Q14511 834 aa9.16□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 PTPN21Q16825 1174 aa9.16□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 MYSM1Q5VVJ2 828 aa9.16□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 IQCA1Q86XH1 822 aa9.16□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 MSLNLQ96KJ4 702 aa9.16□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 TLE6Q9H808 572 aa9.16□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 PXMP2Q9NR77 195 aa9.16□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa9.16□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 PLAGL2Q9UPG8 496 aa9.16□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 TECTAO75443 2155 aa9.16□□□□□ -0.94
PGGT1B-201ENST00000296642 NRCAMQ92823 1304 aa9.15□□□□□ -0.94
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