RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296031.4

CXCL2-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CXCL2, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2-201ENST00000296031 GALNT17Q6IS24 598 aa28.48■■■□□ 2.15
CXCL2-201ENST00000296031 WASF1Q92558 559 aa28.48■■■□□ 2.15
CXCL2-201ENST00000296031 KAT2BQ92831 832 aa28.48■■■□□ 2.15
CXCL2-201ENST00000296031 TRPV6Q9H1D0 765 aa28.48■■■□□ 2.15
CXCL2-201ENST00000296031 KCNH7Q9NS40 1196 aa28.48■■■□□ 2.15
CXCL2-201ENST00000296031 B4GALT4O60513 344 aa28.47■■■□□ 2.15
CXCL2-201ENST00000296031 CYP3A4P08684 503 aa28.47■■■□□ 2.15
CXCL2-201ENST00000296031 RAG1P15918 1043 aa28.47■■■□□ 2.15
CXCL2-201ENST00000296031 XBP1P17861 261 aa28.47■■■□□ 2.15
CXCL2-201ENST00000296031 NFRKBQ6P4R8 1299 aa28.47■■■□□ 2.15
CXCL2-201ENST00000296031 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
CXCL2-201ENST00000296031 BADQ92934 168 aa28.47■■■□□ 2.15
CXCL2-201ENST00000296031 TBX21Q9UL17 535 aa28.47■■■□□ 2.15
CXCL2-201ENST00000296031 MEIS1O00470 390 aa28.46■■■□□ 2.15
CXCL2-201ENST00000296031 FDPSP14324 419 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
CXCL2-201ENST00000296031 ITGB8P26012 769 aa28.46■■■□□ 2.15
CXCL2-201ENST00000296031 BLIDQ8IZY5 108 aa28.46■■■□□ 2.15
CXCL2-201ENST00000296031 DAGLBQ8NCG7 672 aa28.46■■■□□ 2.15
CXCL2-201ENST00000296031 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
CXCL2-201ENST00000296031 TBC1D32Q96NH3 1257 aa28.46■■■□□ 2.15
CXCL2-201ENST00000296031 GPR20Q99678 358 aa28.46■■■□□ 2.15
CXCL2-201ENST00000296031 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
CXCL2-201ENST00000296031 KCNJ14Q9UNX9 436 aa28.46■■■□□ 2.15
CXCL2-201ENST00000296031 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
CXCL2-201ENST00000296031 F2P00734 622 aa28.45■■■□□ 2.14
CXCL2-201ENST00000296031 BMP8BP34820 402 aa28.45■■■□□ 2.14
CXCL2-201ENST00000296031 PSEN2P49810 448 aa28.45■■■□□ 2.14
CXCL2-201ENST00000296031 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.14
CXCL2-201ENST00000296031 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
CXCL2-201ENST00000296031 NIPA1Q7RTP0 329 aa28.45■■■□□ 2.14
CXCL2-201ENST00000296031 ALG1Q9BT22 464 aa28.45■■■□□ 2.14
CXCL2-201ENST00000296031 PHF20Q9BVI0 1012 aa28.45■■■□□ 2.14
CXCL2-201ENST00000296031 KATNAL1Q9BW62 490 aa28.45■■■□□ 2.14
CXCL2-201ENST00000296031 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
CXCL2-201ENST00000296031 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa28.44■■■□□ 2.14
CXCL2-201ENST00000296031 FAM86B1E9PN63 330 aa28.44■■■□□ 2.14
CXCL2-201ENST00000296031 FAM86B2P0C5J1 330 aa28.44■■■□□ 2.14
CXCL2-201ENST00000296031 ARP10275 920 aa28.44■■■□□ 2.14
CXCL2-201ENST00000296031 ST3GAL1Q11201 340 aa28.44■■■□□ 2.14
CXCL2-201ENST00000296031 MFSD10Q14728 455 aa28.44■■■□□ 2.14
CXCL2-201ENST00000296031 NPY5RQ15761 445 aa28.44■■■□□ 2.14
CXCL2-201ENST00000296031 TELO2Q9Y4R8 837 aa28.44■■■□□ 2.14
CXCL2-201ENST00000296031 M0R2N6 131 aa28.43■■■□□ 2.14
CXCL2-201ENST00000296031 JAK2O60674 1132 aa28.43■■■□□ 2.14
CXCL2-201ENST00000296031 KIAA0753Q2KHM9 967 aa28.43■■■□□ 2.14
CXCL2-201ENST00000296031 CCDC83Q8IWF9 413 aa28.43■■■□□ 2.14
CXCL2-201ENST00000296031 IL27Q8NEV9 243 aa28.43■■■□□ 2.14
CXCL2-201ENST00000296031 C16orf70Q9BSU1 422 aa28.43■■■□□ 2.14
CXCL2-201ENST00000296031 BACH2Q9BYV9 841 aa28.43■■■□□ 2.14
CXCL2-201ENST00000296031 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa28.43■■■□□ 2.14
CXCL2-201ENST00000296031 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
CXCL2-201ENST00000296031 GJB4Q9NTQ9 266 aa28.43■■■□□ 2.14
CXCL2-201ENST00000296031 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa28.42■■■□□ 2.14
CXCL2-201ENST00000296031 HAS3O00219 553 aa28.42■■■□□ 2.14
CXCL2-201ENST00000296031 ST18O60284 1047 aa28.42■■■□□ 2.14
CXCL2-201ENST00000296031 TIMP1P01033 207 aa28.42■■■□□ 2.14
CXCL2-201ENST00000296031 LGALS2P05162 132 aa28.42■■■□□ 2.14
CXCL2-201ENST00000296031 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa28.42■■■□□ 2.14
CXCL2-201ENST00000296031 PLA2G4DQ86XP0 818 aa28.42■■■□□ 2.14
CXCL2-201ENST00000296031 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
CXCL2-201ENST00000296031 CIITAP33076 1130 aa28.41■■■□□ 2.14
CXCL2-201ENST00000296031 USP11P51784 963 aa28.41■■■□□ 2.14
CXCL2-201ENST00000296031 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
CXCL2-201ENST00000296031 SESTD1Q86VW0 696 aa28.41■■■□□ 2.14
CXCL2-201ENST00000296031 C7orf31Q8N865 590 aa28.41■■■□□ 2.14
CXCL2-201ENST00000296031 SDF4Q9BRK5 362 aa28.41■■■□□ 2.14
CXCL2-201ENST00000296031 H3BRB1 525 aa28.4■■■□□ 2.14
CXCL2-201ENST00000296031 TBCKQ8TEA7 893 aa28.4■■■□□ 2.14
CXCL2-201ENST00000296031 SEPT1Q8WYJ6 367 aa28.4■■■□□ 2.14
CXCL2-201ENST00000296031 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
CXCL2-201ENST00000296031 HIPK3Q9H422 1215 aa28.4■■■□□ 2.14
CXCL2-201ENST00000296031 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
CXCL2-201ENST00000296031 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
CXCL2-201ENST00000296031 HDAC6Q9UBN7 1215 aa28.4■■■□□ 2.14
CXCL2-201ENST00000296031 NOD1Q9Y239 953 aa28.4■■■□□ 2.14
CXCL2-201ENST00000296031 NFASCO94856 1347 aa28.4■■■□□ 2.14
CXCL2-201ENST00000296031 A0A1W2PPC1 479 aa28.39■■■□□ 2.14
CXCL2-201ENST00000296031 CYP2C9P11712 490 aa28.39■■■□□ 2.14
CXCL2-201ENST00000296031 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
CXCL2-201ENST00000296031 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
CXCL2-201ENST00000296031 TRIM50Q86XT4 487 aa28.39■■■□□ 2.14
CXCL2-201ENST00000296031 SLC9A2Q9UBY0 812 aa28.39■■■□□ 2.14
CXCL2-201ENST00000296031 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa28.38■■■□□ 2.13
CXCL2-201ENST00000296031 EDIL3O43854 480 aa28.38■■■□□ 2.13
CXCL2-201ENST00000296031 CYP2C18P33260 490 aa28.38■■■□□ 2.13
CXCL2-201ENST00000296031 FOSBP53539 338 aa28.38■■■□□ 2.13
CXCL2-201ENST00000296031 SETQ01105 290 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
CXCL2-201ENST00000296031 PRR16Q569H4 304 aa28.38■■■□□ 2.13
CXCL2-201ENST00000296031 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
CXCL2-201ENST00000296031 KRT25Q7Z3Z0 450 aa28.38■■■□□ 2.13
CXCL2-201ENST00000296031 UIMC1Q96RL1 719 aa28.38■■■□□ 2.13
CXCL2-201ENST00000296031 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
CXCL2-201ENST00000296031 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa28.38■■■□□ 2.13
CXCL2-201ENST00000296031 UMODL1Q5DID0 1318 aa28.38■■■□□ 2.13
CXCL2-201ENST00000296031 FPGSQ05932 587 aa28.37■■■□□ 2.13
CXCL2-201ENST00000296031 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP28.37■■■□□ 2.13
CXCL2-201ENST00000296031 PTGISQ16647 500 aa28.37■■■□□ 2.13
CXCL2-201ENST00000296031 MFSD5Q6N075 450 aa28.37■■■□□ 2.13
CXCL2-201ENST00000296031 TDHQ8IZJ6 230 aa28.37■■■□□ 2.13
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms