RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283228.6

PTPRR-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 3,529 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-201ENST00000283228 PLAGL2Q9UPG8 496 aa12.46□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 LAMA4Q16363 1823 aa12.46□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 RASSF10A6NK89 507 aa12.45□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 SNAP23O00161 211 aa12.45□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 STXBP3O00186 592 aa12.45□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 GHRP10912 638 aa12.45□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 CCND1P24385 295 aa12.45□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 CCNE1P24864 410 aa12.45□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 COPB2P35606 906 aa12.45□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 PHKA1P46020 1223 aa12.45□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 LRRC41Q15345 812 aa12.45□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 USP38Q8NB14 1042 aa12.45□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 DISC1Q9NRI5 854 aa12.45□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 MST1RQ04912 1400 aa12.45□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 DPPA5A6NC42 116 aa12.45□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 SPDYE3A6NKU9 549 aa12.45□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 KRT16P08779 473 aa12.45□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 SLMAPQ14BN4 828 aa12.45□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 TTI2Q6NXR4 508 aa12.45□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 VSIG1Q86XK7 387 aa12.45□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 TMTC2Q8N394 836 aa12.45□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 FAM129AQ9BZQ8 928 aa12.45□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 HOMER3Q9NSC5 361 aa12.45□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa12.45□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 RNF14Q9UBS8 474 aa12.45□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 A0A0G2JS52 829 aa12.45□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 ITGA4P13612 1032 aa12.45□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 GBP1P32455 592 aa12.45□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 CUL1Q13616 776 aa12.45□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 MUM1Q2TAK8 710 aa12.45□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 SDR42E1Q8WUS8 393 aa12.45□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP12.45□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa12.45□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa12.45□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 PNMA3Q9UL41 463 aa12.45□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 ITGA6P23229 1130 aa12.44□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 VWA3BQ502W6 1294 aa12.44□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 TMEM154Q6P9G4 183 aa12.44□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 PEX26Q7Z412 305 aa12.44□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 MREGQ8N565 214 aa12.44□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 FAM133AQ8N9E0 248 aa12.44□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 ACSBG1Q96GR2 724 aa12.44□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa12.44□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 FMO2Q99518 471 aa12.44□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 PIDD1Q9HB75 910 aa12.44□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 ETNK1Q9HBU6 452 aa12.44□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa12.44□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 SPDYE5A6NIY4 337 aa12.44□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 LINGO3P0C6S8 592 aa12.44□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 TNFRSF8P28908 595 aa12.44□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 KRT28Q7Z3Y7 464 aa12.44□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 PRPHP41219 470 aa12.44□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 MSH2P43246 934 aa12.44□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 AGBL2Q5U5Z8 902 aa12.44□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 ESR2Q92731 530 aa12.44□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 TBC1D7Q9P0N9 293 aa12.44□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa12.43□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 TCP11X1B4DZS4 312 aa12.43□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 SUN1O94901 812 aa12.43□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 SLC52A2Q9HAB3 445 aa12.43□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 SNX24Q9Y343 169 aa12.43□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 C2CD2Q9Y426 696 aa12.43□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 SMIM22K7EJ46 135 aa12.43□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 TRAF5O00463 557 aa12.43□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 LLGL1Q15334 1064 aa12.43□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 TRIM7Q9C029 511 aa12.43□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 MTFR1LQ9H019 292 aa12.43□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 SLC5A4Q9NY91 659 aa12.43□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 H7C1W4 665 aa12.42□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 FERP16591 822 aa12.42□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 BLMHQ13867 455 aa12.42□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 IL17AQ16552 155 aa12.42□□□□□ -0.42
PTPRR-201ENST00000283228 INF2Q27J81 1249 aa12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms