RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP24.07■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 NID2Q14112 1375 aa24.06■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 UFL1O94874 794 aa24.06■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 GUCY1A2P33402 732 aa24.06■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 CCNG1P51959 295 aa24.06■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 QPCTQ16769 361 aa24.06■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 KRT40Q6A162 431 aa24.06■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 MED15Q96RN5 788 aa24.06■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 LRRC1Q9BTT6 524 aa24.06■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 SLC26A6Q9BXS9 759 aa24.06■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 TRIM10Q9UDY6 481 aa24.06■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 CCND1P24385 295 aa24.06■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 NT5DC1Q5TFE4 455 aa24.06■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 HDAC7Q8WUI4 952 aa24.06■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 UBAC1Q9BSL1 405 aa24.06■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP24.06■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa24.05■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 FGRP09769 529 aa24.05■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 DIXDC1Q155Q3 683 aa24.05■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 LONRF3Q496Y0 759 aa24.05■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 NUGGCQ68CJ6 796 aa24.05■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 ZNF654Q8IZM8 581 aa24.05■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 CCDC82Q8N4S0 544 aa24.05■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 MREGQ8N565 214 aa24.05■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 TRIML1Q8N9V2 468 aa24.05■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa24.05■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 ASB3Q9Y575 518 aa24.05■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 STYK1Q6J9G0 422 aa24.05■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 TEKT4Q8WW24 435 aa24.05■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 MTA3Q9BTC8 594 aa24.05■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa24.05■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 SLX4Q8IY92 1834 aa24.05■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 LRRD1A4D1F6 860 aa24.04■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 ATP2C2O75185 946 aa24.04■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 NDUFA10O95299 355 aa24.04■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 MYL1P05976 194 aa24.04■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 LDHBP07195 334 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 IFNAR1P17181 557 aa24.04■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 MORC3Q14149 939 aa24.04■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 RTN1Q16799 776 aa24.04■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa24.04■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa24.04■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 ZNF804AQ7Z570 1209 aa24.04■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 WDR66Q8TBY9 1149 aa24.04■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 STIM2Q9P246 746 aa24.04■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 WDR35Q9P2L0 1181 aa24.04■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 PLCD1P51178 756 aa24.04■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 MAATS1Q7Z4T9 603 aa24.04■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 POLLQ9UGP5 575 aa24.04■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 SLC12A4Q9UP95 1085 aa24.04■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 CLTAP09496 248 aa24.03■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 KCNA3P22001 575 aa24.03■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 TRIM4Q9C037 500 aa24.03■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 CD209Q9NNX6 404 aa24.03■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP24.03■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 DPPA5A6NC42 116 aa24.03■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 ZNF185O15231 689 aa24.03■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 ALDH3A1P30838 453 aa24.03■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 SP8Q8IXZ3 490 aa24.03■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 KCNMB3Q9NPA1 279 aa24.03■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa24.03■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 VIMP08670 466 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 KIF5BP33176 963 aa24.02■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 SARSP49591 514 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 TRIM14Q14142 442 aa24.02■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 TMTC2Q8N394 836 aa24.02■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 FANCBQ8NB91 859 aa24.02■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 SLX1AQ9BQ83 275 aa24.02■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 GGA1Q9UJY5 639 aa24.02■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa24.02■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 CCT8L1PA6NM43 557 aa24.02■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 PAEPP09466 180 aa24.02■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 USP17L8P0C7I0 530 aa24.02■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 PANK4Q9NVE7 773 aa24.02■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa24.02■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 STK36Q9NRP7 1315 aa24.02■■□□□ 1.44
PITX1-201ENST00000265340 C6orf229H3BNL8 230 aa24.01■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 VAV2P52735 878 aa24.01■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 MXRA7P84157 204 aa24.01■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
PITX1-201ENST00000265340 PAK2Q13177 524 aa24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms