RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264896.7

SCARB2-201, Transcript of scavenger receptor class B member 2, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCARB2, Length 4,792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2-201ENST00000264896 PCK1P35558 622 aa19.16■□□□□ 0.66
SCARB2-201ENST00000264896 GRM4Q14833 912 aa19.16■□□□□ 0.66
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF653Q96CK0 615 aa19.16■□□□□ 0.66
SCARB2-201ENST00000264896 AP3B2Q13367 1082 aa19.16■□□□□ 0.66
SCARB2-201ENST00000264896 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
SCARB2-201ENST00000264896 PAGR1Q9BTK6 254 aa19.16■□□□□ 0.66
SCARB2-201ENST00000264896 POTEMA6NI47 508 aa19.16■□□□□ 0.66
SCARB2-201ENST00000264896 HSPA6P17066 643 aa19.16■□□□□ 0.66
SCARB2-201ENST00000264896 PHBP35232 272 aa19.16■□□□□ 0.66
SCARB2-201ENST00000264896 PSMC4P43686 418 aa19.16■□□□□ 0.66
SCARB2-201ENST00000264896 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
SCARB2-201ENST00000264896 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
SCARB2-201ENST00000264896 CCDC13Q8IYE1 715 aa19.16■□□□□ 0.66
SCARB2-201ENST00000264896 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa19.16■□□□□ 0.66
SCARB2-201ENST00000264896 RASSF2P50749 326 aa19.16■□□□□ 0.66
SCARB2-201ENST00000264896 PPP2R5AQ15172 486 aa19.16■□□□□ 0.66
SCARB2-201ENST00000264896 PROM2Q8N271 834 aa19.16■□□□□ 0.66
SCARB2-201ENST00000264896 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa19.15■□□□□ 0.66
SCARB2-201ENST00000264896 GUCY1A2P33402 732 aa19.15■□□□□ 0.66
SCARB2-201ENST00000264896 MAN1A1P33908 653 aa19.15■□□□□ 0.66
SCARB2-201ENST00000264896 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
SCARB2-201ENST00000264896 VPS52Q8N1B4 723 aa19.15■□□□□ 0.66
SCARB2-201ENST00000264896 PCIF1Q9H4Z3 704 aa19.15■□□□□ 0.66
SCARB2-201ENST00000264896 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
SCARB2-201ENST00000264896 UTYO14607 1347 aa19.15■□□□□ 0.66
SCARB2-201ENST00000264896 ZBTB5O15062 677 aa19.15■□□□□ 0.66
SCARB2-201ENST00000264896 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP19.15■□□□□ 0.66
SCARB2-201ENST00000264896 BFSP1Q12934 665 aa19.15■□□□□ 0.66
SCARB2-201ENST00000264896 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
SCARB2-201ENST00000264896 TXNRD1Q16881 649 aa19.15■□□□□ 0.66
SCARB2-201ENST00000264896 TMEM179Q6ZVK1 233 aa19.15■□□□□ 0.66
SCARB2-201ENST00000264896 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa19.15■□□□□ 0.66
SCARB2-201ENST00000264896 MXI1P50539 228 aa19.15■□□□□ 0.66
SCARB2-201ENST00000264896 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
SCARB2-201ENST00000264896 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa19.15■□□□□ 0.66
SCARB2-201ENST00000264896 BARHL2Q9NY43 387 aa19.15■□□□□ 0.66
SCARB2-201ENST00000264896 TAF6LQ9Y6J9 622 aa19.15■□□□□ 0.66
SCARB2-201ENST00000264896 CCDC160A6NGH7 325 aa19.15■□□□□ 0.66
SCARB2-201ENST00000264896 SORBS3O60504 671 aa19.15■□□□□ 0.66
SCARB2-201ENST00000264896 RNF8O76064 485 aa19.15■□□□□ 0.66
SCARB2-201ENST00000264896 CSF1RP07333 972 aa19.15■□□□□ 0.66
SCARB2-201ENST00000264896 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
SCARB2-201ENST00000264896 PLTPP55058 493 aa19.15■□□□□ 0.66
SCARB2-201ENST00000264896 SEMA3FQ13275 785 aa19.15■□□□□ 0.66
SCARB2-201ENST00000264896 MIS12Q9H081 205 aa19.15■□□□□ 0.66
SCARB2-201ENST00000264896 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa19.15■□□□□ 0.66
SCARB2-201ENST00000264896 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
SCARB2-201ENST00000264896 ANO9A1A5B4 782 aa19.14■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 STAM2O75886 525 aa19.14■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 YARSP54577 528 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 EMBQ6PCB8 327 aa19.14■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 TRIM11Q96F44 468 aa19.14■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 CEP95Q96GE4 821 aa19.14■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 KMT5AQ9NQR1 393 aa19.14■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 ANAPC4Q9UJX5 808 aa19.14■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 SLC7A3Q8WY07 619 aa19.14■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 NPR1P16066 1061 aa19.14■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 PIK3CAP42336 1068 aa19.14■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 BAG6P46379 1132 aa19.14■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 ALS2CLQ60I27 953 aa19.14■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP19.14■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 WHAMMQ8TF30 809 aa19.14■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 MXD3Q9BW11 206 aa19.14■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa19.14■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 NRXN1Q9ULB1 1477 aa19.14■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 MAPK4P31152 587 aa19.13■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 GRM1Q13255 1194 aa19.13■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 LMNTD2Q8IXW0 634 aa19.13■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 FAM81BQ96LP2 452 aa19.13■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF408Q9H9D4 720 aa19.13■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 IQGAP1P46940 1657 aa19.13■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 LMNB2Q03252 620 aa19.13■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 TBC1D9BQ66K14 1250 aa19.13■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 CEP170P1Q96L14 293 aa19.13■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 ADPGKQ9BRR6 497 aa19.13■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 BCS1LQ9Y276 419 aa19.13■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 TTC26A0AVF1 554 aa19.13■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 ATP2A3Q93084 1043 aa19.13■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 KCNF1Q9H3M0 494 aa19.13■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 PTPN22Q9Y2R2 807 aa19.13■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 TERF2Q15554 542 aa19.13■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 SCYL2Q6P3W7 929 aa19.13■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 FAM160B2Q86V87 743 aa19.13■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 PDIA6Q15084 440 aa19.12■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 SLC7A5Q01650 507 aa19.12■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 PPP2R5DQ14738 602 aa19.12■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 CAPN12Q6ZSI9 719 aa19.12■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa19.12■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa19.12■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 KRT81Q14533 505 aa19.12■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
SCARB2-201ENST00000264896 DPF2Q92785 391 aa19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.6 ms