RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216420.11

CGRRF1-201, Transcript of cell growth regulator with ring finger domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CGRRF1, Length 2,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGRRF1-201ENST00000216420 MFN1Q8IWA4 741 aa20.2■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 TTLL11Q8NHH1 800 aa20.2■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 ITFG2Q969R8 447 aa20.2■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 C7orf25Q9BPX7 421 aa20.2■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 TXLNGYQ9BZA5 131 aa20.2■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 PLEKHA8P1O95397 391 aa20.2■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 SERPING1P05155 500 aa20.2■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 LINGO3P0C6S8 592 aa20.2■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 PEX19P40855 299 aa20.2■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 RPS6KA3P51812 740 aa20.2■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 SLC5A9Q2M3M2 681 aa20.2■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 HOOK3Q86VS8 718 aa20.2■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 TAF4BQ92750 862 aa20.2■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa20.2■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 ARMT1Q9H993 441 aa20.2■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 AXIN2Q9Y2T1 843 aa20.2■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 PPFIA2O75334 1257 aa20.19■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 WFS1O76024 890 aa20.19■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 DDAH1O94760 285 aa20.19■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 KCNA6P17658 529 aa20.19■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 NCALDP61601 193 aa20.19■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 GALNTL6Q49A17 601 aa20.19■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa20.19■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 CATIPQ7Z7H3 387 aa20.19■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 ESR2Q92731 530 aa20.19■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 ZBTB10Q96DT7 871 aa20.19■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 PGM2Q96G03 612 aa20.19■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 FAM210AQ96ND0 272 aa20.19■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 MMRN2Q9H8L6 949 aa20.19■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 SAMD15Q9P1V8 674 aa20.19■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa20.19■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP20.18■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 FERP16591 822 aa20.18■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 KLRC1P26715 233 aa20.18■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 EHHADHQ08426 723 aa20.18■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 MAP3K12Q12852 859 aa20.18■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 CMPK2Q5EBM0 449 aa20.18■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 FOXR2Q6PJQ5 311 aa20.18■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 FAM114A2Q9NRY5 505 aa20.18■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 ZFATQ9P243 1243 aa20.18■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 AGAP1Q9UPQ3 857 aa20.18■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 MMEP08473 750 aa20.18■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 RARAP10276 462 aa20.18■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 NEFHP12036 1026 aa20.18■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 USP11P51784 963 aa20.18■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 PDE4DQ08499 809 aa20.18■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 TROAPQ12815 778 aa20.18■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 STK4Q13043 487 aa20.18■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 CCDC38Q502W7 563 aa20.18■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 DTHD1Q6ZMT9 781 aa20.18■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 TRIM9Q9C026 710 aa20.18■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 MEGF6O75095 1541 aa20.17■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 ENO4A6NNW6 628 aa20.17■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 OAS1P00973 400 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 NUDT17P0C025 328 aa20.17■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 FLT3P36888 993 aa20.17■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 RPS6KA1Q15418 735 aa20.17■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 SEMA6BQ9H3T3 888 aa20.17■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 CEP72Q9P209 647 aa20.17■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 DUOX1Q9NRD9 1551 aa20.17■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa20.17■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 STXBP3O00186 592 aa20.17■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 KIF4AO95239 1232 aa20.17■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa20.17■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 CHN1P15882 459 aa20.17■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 ITGA6P23229 1130 aa20.17■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 PHKA1P46020 1223 aa20.17■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 SLC18A3Q16572 532 aa20.17■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 CNNM4Q6P4Q7 775 aa20.17■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP20.17■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 MAGEB6Q8N7X4 407 aa20.17■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 MDM1Q8TC05 714 aa20.17■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 ANKS1AQ92625 1134 aa20.17■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 ADAM7Q9H2U9 754 aa20.17■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 ATAD5Q96QE3 1844 aa20.16■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 LAD1O00515 517 aa20.16■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 AP1G2O75843 785 aa20.16■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 SCG2P13521 617 aa20.16■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 CALML3P27482 149 aa20.16■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 UBA7P41226 1012 aa20.16■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 ABL2P42684 1182 aa20.16■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 NLRP5P59047 1200 aa20.16■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 SLC30A9Q6PML9 568 aa20.16■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 TMC4Q7Z404 712 aa20.16■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 LRRC34Q8IZ02 419 aa20.16■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 ARHGEF3Q9NR81 526 aa20.16■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 MYH4Q9Y623 1939 aa20.16■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 ATP8B3O60423 1300 aa20.16■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
CGRRF1-201ENST00000216420 PRKAB2O43741 272 aa20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.8 ms