RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000198767.10

RRN3-201, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RRN3, Length 3,762 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-201ENST00000198767 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP9.71□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 KSR1Q8IVT5 923 aa9.71□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 SPATA20Q8TB22 786 aa9.71□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 AKT1S1Q96B36 256 aa9.71□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 SCLT1Q96NL6 688 aa9.71□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 ZIM3Q96PE6 472 aa9.71□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 GSDMAQ96QA5 445 aa9.71□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa9.71□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 SLC39A2Q9NP94 309 aa9.71□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 MYH15Q9Y2K3 1946 aa9.7□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 SCP2P22307 547 aa9.7□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 ECE1P42892 770 aa9.7□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP9.7□□□□□ -0.862e-8■■□□□ 12.8
RRN3-201ENST00000198767 LRRC41Q15345 812 aa9.7□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 POTEDQ86YR6 584 aa9.7□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 RAB34Q9BZG1 259 aa9.7□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 CXorf56Q9H5V9 222 aa9.7□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 HAUS4Q9H6D7 363 aa9.7□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 EPB41L5Q9HCM4 733 aa9.7□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 PLCH1Q4KWH8 1693 aa9.7□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 GRIN2DO15399 1336 aa9.7□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 NWD2Q9ULI1 1742 aa9.7□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 MEIS1O00470 390 aa9.7□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 OR52Z1P0C646 297 aa9.7□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 CDAN1Q8IWY9 1227 aa9.7□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 FBXL16Q8N461 479 aa9.7□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 SPATA4Q8NEY3 305 aa9.7□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 LRRC15Q8TF66 581 aa9.7□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 PCDHA6Q9UN73 950 aa9.7□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa9.7□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 LAMB4A4D0S4 1761 aa9.7□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa9.7□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP9.7□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 GLI1P08151 1106 aa9.7□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 RPSAP08865 295 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 CDC25CP30307 473 aa9.7□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 SPA17Q15506 151 aa9.7□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 SPRED3Q2MJR0 410 aa9.7□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 NBPF9Q3BBW0 867 aa9.7□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 NSMFQ6X4W1 530 aa9.7□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 RRAGAQ7L523 313 aa9.7□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 NELFCDQ8IXH7 590 aa9.7□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 BARHL2Q9NY43 387 aa9.7□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 RASSF10A6NK89 507 aa9.69□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 SMIM23A6NLE4 172 aa9.69□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 E7EVH7 732 aa9.69□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 TMOD1P28289 359 aa9.69□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 QRICH1Q2TAL8 776 aa9.69□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 FAM83BQ5T0W9 1011 aa9.69□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa9.69□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 ACER1Q8TDN7 264 aa9.69□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 LZTS2Q9BRK4 669 aa9.69□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 TAOK3Q9H2K8 898 aa9.69□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa9.69□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 EPS15P42566 896 aa9.69□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 STK4Q13043 487 aa9.69□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 PPFIA1Q13136 1202 aa9.69□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 CREG2Q8IUH2 290 aa9.69□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 KRT12Q99456 494 aa9.69□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 TRIM31Q9BZY9 425 aa9.69□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 HSF2BPO75031 334 aa9.69□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 RPS6KA5O75582 802 aa9.69□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 PLCG1P19174 1290 aa9.69□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 ANKRD40Q6AI12 368 aa9.69□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 CIAPIN1Q6FI81 312 aa9.69□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 C8orf74Q6P047 294 aa9.69□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 PDXDC2PQ6P474 469 aa9.69□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 FBXO11Q86XK2 927 aa9.69□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 GLIS3Q8NEA6 775 aa9.69□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 ZNF408Q9H9D4 720 aa9.69□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 FBXO28Q9NVF7 368 aa9.69□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 RWDD2AQ9UIY3 292 aa9.69□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 FAM184BQ9ULE4 1060 aa9.69□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 PCDHA12Q9UN75 941 aa9.69□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 ABCA3Q99758 1704 aa9.69□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 STXBP3O00186 592 aa9.68□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 ALAS1P13196 640 aa9.68□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 ASPRV1Q53RT3 343 aa9.68□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 DACT2Q5SW24 774 aa9.68□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 CCDC17Q96LX7 622 aa9.68□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP9.68□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 SLC24A3Q9HC58 644 aa9.68□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 SWAP70Q9UH65 585 aa9.68□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 ATRNO75882 1429 aa9.68□□□□□ -0.86
RRN3-201ENST00000198767 LGALS16A8MUM7 142 aa9.68□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.1 ms