RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000188376.9

SLC25A3-201, Transcript of solute carrier family 25 member 3, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC25A3, Length 1,909 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A3-201ENST00000188376 IDEP14735 1019 aa21.51■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 STK4Q13043 487 aa21.51■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 PPP2R5CQ13362 524 aa21.51■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 STIM1Q13586 685 aa21.51■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 ARHGEF16Q5VV41 709 aa21.51■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 UNC13DQ70J99 1090 aa21.51■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 OPTNQ96CV9 577 aa21.51■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 PDCD2LQ9BRP1 358 aa21.51■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 ACAD9Q9H845 621 aa21.51■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 PKD2L1Q9P0L9 805 aa21.51■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa21.51■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 CXCL11O14625 94 aa21.51■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 PEX10O60683 326 aa21.51■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 TPM3P06753 285 aa21.51■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 BCRP11274 1271 aa21.51■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 PSMC6P62333 389 aa21.51■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 TKFCQ3LXA3 575 aa21.51■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 CNNM4Q6P4Q7 775 aa21.51■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa21.51■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 ZNF408Q9H9D4 720 aa21.51■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 RGL1Q9NZL6 768 aa21.51■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa21.51■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 TRAF5O00463 557 aa21.5■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 CBFA2T2O43439 604 aa21.5■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 PPIL2Q13356 520 aa21.5■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 NIPA1Q7RTP0 329 aa21.5■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 TEKT3Q9BXF9 490 aa21.5■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 KCNF1Q9H3M0 494 aa21.5■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 KCNH4Q9UQ05 1017 aa21.5■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 DNM3Q9UQ16 869 aa21.5■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 TRIM49BA6NDI0 452 aa21.49■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 MTMR1Q13613 665 aa21.49■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 LBX2Q6XYB7 198 aa21.49■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 GPBP1Q86WP2 473 aa21.49■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 DNAJC19Q96DA6 116 aa21.49■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 UNC45AQ9H3U1 944 aa21.49■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 SLC39A2Q9NP94 309 aa21.49■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 JADE2Q9NQC1 790 aa21.49■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 A0A0G2JMZ2 1700 aa21.49■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 PSMA7O14818 248 aa21.49■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 SLC12A3P55017 1021 aa21.49■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP21.49■■□□□ 1.038e-28■■■□□ 16.2
SLC25A3-201ENST00000188376 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 CDKAL1Q5VV42 579 aa21.49■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 KIAA0895Q8NCT3 520 aa21.49■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 RIT2Q99578 217 aa21.49■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 HSD17B14Q9BPX1 270 aa21.49■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 CYP39A1Q9NYL5 469 aa21.49■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 BTBD7Q9P203 1132 aa21.49■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 PMS1P54277 932 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 TMC6Q7Z403 805 aa21.48■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 DYDC2Q96IM9 177 aa21.48■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa21.47■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 CYP11B2P19099 503 aa21.47■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa21.47■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 LDLRAD1Q5T700 205 aa21.47■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 TPH2Q8IWU9 490 aa21.47■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 SLITRK3O94933 977 aa21.47■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 B3GNT9Q6UX72 402 aa21.47■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 MB21D1Q8N884 522 aa21.47■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 TUFT1Q9NNX1 390 aa21.47■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 PANK4Q9NVE7 773 aa21.47■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 INTS13Q9NVM9 706 aa21.47■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa21.47■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 EHHADHQ08426 723 aa21.46■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 COASYQ13057 564 aa21.46■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 PTPN21Q16825 1174 aa21.46■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 ARSHQ5FYA8 562 aa21.46■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
SLC25A3-201ENST00000188376 DHX15O43143 795 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
SLC25A3-201ENST00000188376 KRT18P05783 430 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
SLC25A3-201ENST00000188376 NR3C2P08235 984 aa21.45■■□□□ 1.02
SLC25A3-201ENST00000188376 CCND2P30279 289 aa21.45■■□□□ 1.02
SLC25A3-201ENST00000188376 GJA5P36382 358 aa21.45■■□□□ 1.02
SLC25A3-201ENST00000188376 ARID5BQ14865 1188 aa21.45■■□□□ 1.02
SLC25A3-201ENST00000188376 VSIG10LQ86VR7 867 aa21.45■■□□□ 1.02
SLC25A3-201ENST00000188376 CHST13Q8NET6 341 aa21.45■■□□□ 1.02
SLC25A3-201ENST00000188376 PAGR1Q9BTK6 254 aa21.45■■□□□ 1.02
SLC25A3-201ENST00000188376 BHMT2Q9H2M3 363 aa21.45■■□□□ 1.02
SLC25A3-201ENST00000188376 PPP1R2P41236 205 aa21.45■■□□□ 1.02
SLC25A3-201ENST00000188376 HERVK_113P62684 666 aa21.45■■□□□ 1.02
SLC25A3-201ENST00000188376 LRMPQ12912 555 aa21.45■■□□□ 1.02
SLC25A3-201ENST00000188376 MOGSQ13724 837 aa21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms