RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000042857.13

Satb2-201, Transcript of DNA-binding protein SATB2, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Satb2, Length 6,277 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Satb2-201ENSMUST00000042857 Klhl41A2AUC9 606 aa14.9□□□□□ -0.02
Satb2-201ENSMUST00000042857 Prpf38aQ4FK66 312 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
Satb2-201ENSMUST00000042857 Q6PD19 689 aa14.9□□□□□ -0.02
Satb2-201ENSMUST00000042857 Nlrp4aQ8BU40 982 aa14.9□□□□□ -0.02
Satb2-201ENSMUST00000042857 Arhgap29Q8CGF1 1266 aa14.9□□□□□ -0.02
Satb2-201ENSMUST00000042857 Appl2Q8K3G9 662 aa14.9□□□□□ -0.02
Satb2-201ENSMUST00000042857 Lzts2Q91YU6 671 aa14.9□□□□□ -0.02
Satb2-201ENSMUST00000042857 AacsQ9D2R0 672 aa14.9□□□□□ -0.02
Satb2-201ENSMUST00000042857 Zfyve19Q9DAZ9 389 aa14.9□□□□□ -0.02
Satb2-201ENSMUST00000042857 Caln1Q9JJG7 219 aa14.9□□□□□ -0.02
Satb2-201ENSMUST00000042857 Col15a1O35206 1367 aa14.9□□□□□ -0.02
Satb2-201ENSMUST00000042857 Cyp2c23E9Q5K4 494 aa14.9□□□□□ -0.02
Satb2-201ENSMUST00000042857 Rtel1Q0VGM9 1203 aa14.9□□□□□ -0.02
Satb2-201ENSMUST00000042857 Fam228bQ497Q6 232 aa14.9□□□□□ -0.02
Satb2-201ENSMUST00000042857 CgasQ8C6L5 507 aa14.9□□□□□ -0.02
Satb2-201ENSMUST00000042857 Trim52Q8CDV4 233 aa14.9□□□□□ -0.02
Satb2-201ENSMUST00000042857 Nde1Q9CZA6 344 aa14.9□□□□□ -0.02
Satb2-201ENSMUST00000042857 Syf2Q9D198 242 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
Satb2-201ENSMUST00000042857 Adgrb3Q80ZF8 1522 aa14.9□□□□□ -0.02
Satb2-201ENSMUST00000042857 Gm28961A0A087WPA5 222 aa14.9□□□□□ -0.02
Satb2-201ENSMUST00000042857 Gm21858A0A087WQ24 222 aa14.9□□□□□ -0.02
Satb2-201ENSMUST00000042857 Gm43738A0A0G2JEA5 862 aa14.9□□□□□ -0.02
Satb2-201ENSMUST00000042857 Dnajb6O54946 365 aa14.9□□□□□ -0.02
Satb2-201ENSMUST00000042857 Foxp1P58462 705 aa14.9□□□□□ -0.02
Satb2-201ENSMUST00000042857 Patl1Q3TC46 770 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
Satb2-201ENSMUST00000042857 Trim56Q80VI1 734 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
Satb2-201ENSMUST00000042857 Habp4Q9JKS5 411 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
Satb2-201ENSMUST00000042857 MafgO54790 162 aa14.9□□□□□ -0.02
Satb2-201ENSMUST00000042857 Nck2O55033 380 aa14.9□□□□□ -0.02
Satb2-201ENSMUST00000042857 Pfdn6Q03958 127 aa14.9□□□□□ -0.02
Satb2-201ENSMUST00000042857 Ces3aQ63880 571 aa14.9□□□□□ -0.02
Satb2-201ENSMUST00000042857 MtbpQ8BJS8 894 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
Satb2-201ENSMUST00000042857 Ces3bQ8VCU1 571 aa14.9□□□□□ -0.02
Satb2-201ENSMUST00000042857 Tceal1Q921P9 165 aa14.9□□□□□ -0.02
Satb2-201ENSMUST00000042857 Erbb4Q61527 1308 aa14.89□□□□□ -0.03
Satb2-201ENSMUST00000042857 Tcp11x2A2AEI7 503 aa14.89□□□□□ -0.03
Satb2-201ENSMUST00000042857 Ttc17E9PVB5 1198 aa14.89□□□□□ -0.03
Satb2-201ENSMUST00000042857 Skap2Q3UND0 358 aa14.89□□□□□ -0.03
Satb2-201ENSMUST00000042857 Ncoa7Q6DFV7 943 aa14.89□□□□□ -0.03
Satb2-201ENSMUST00000042857 Zfp113Q8C689 439 aa14.89□□□□□ -0.03
Satb2-201ENSMUST00000042857 Pcsk1nQ9QXV0 258 aa14.89□□□□□ -0.03
Satb2-201ENSMUST00000042857 Gm28042B7ZCM9 1014 aa14.89□□□□□ -0.03
Satb2-201ENSMUST00000042857 DffaO54786 331 aa14.89□□□□□ -0.03
Satb2-201ENSMUST00000042857 Lmnb2P21619 596 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Satb2-201ENSMUST00000042857 Pbxip1Q3TVI8 727 aa14.89□□□□□ -0.03
Satb2-201ENSMUST00000042857 Hace1Q3U0D9 909 aa14.89□□□□□ -0.03
Satb2-201ENSMUST00000042857 FtoQ8BGW1 502 aa14.89□□□□□ -0.03
Satb2-201ENSMUST00000042857 Styxl1Q9DAR2 321 aa14.89□□□□□ -0.03
Satb2-201ENSMUST00000042857 Usp42B2RQC2 1324 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Satb2-201ENSMUST00000042857 ErmardE9Q048 622 aa14.89□□□□□ -0.03
Satb2-201ENSMUST00000042857 Kmt5aQ2YDW7 349 aa14.89□□□□□ -0.03
Satb2-201ENSMUST00000042857 Spc25Q3UA16 226 aa14.89□□□□□ -0.03
Satb2-201ENSMUST00000042857 Fkbp3Q62446 224 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Satb2-201ENSMUST00000042857 Ddx31Q6NZQ2 687 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Satb2-201ENSMUST00000042857 Zfp418Q8BFS8 652 aa14.89□□□□□ -0.03
Satb2-201ENSMUST00000042857 Bag5Q8CI32 447 aa14.89□□□□□ -0.03
Satb2-201ENSMUST00000042857 Ppp1r16bQ8VHQ3 568 aa14.89□□□□□ -0.03
Satb2-201ENSMUST00000042857 Slc12a7Q9WVL3 1083 aa14.89□□□□□ -0.03
Satb2-201ENSMUST00000042857 Olfr247E9PVJ7 320 aa14.89□□□□□ -0.03
Satb2-201ENSMUST00000042857 Elmsan1E9Q2I4 1089 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Satb2-201ENSMUST00000042857 Olfr819K7N727 320 aa14.89□□□□□ -0.03
Satb2-201ENSMUST00000042857 Casp14O89094 257 aa14.89□□□□□ -0.03
Satb2-201ENSMUST00000042857 Slc27a1Q60714 646 aa14.89□□□□□ -0.03
Satb2-201ENSMUST00000042857 Csgalnact2Q8C1F4 542 aa14.89□□□□□ -0.03
Satb2-201ENSMUST00000042857 StrbpQ91WM1 672 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Satb2-201ENSMUST00000042857 Mroh6V9GX81 722 aa14.89□□□□□ -0.03
Satb2-201ENSMUST00000042857 XlrP05531 208 aa14.89□□□□□ -0.03
Satb2-201ENSMUST00000042857 Cd22P35329 862 aa14.89□□□□□ -0.03
Satb2-201ENSMUST00000042857 Agap2Q3UHD9 1186 aa14.89□□□□□ -0.03
Satb2-201ENSMUST00000042857 Mfap3Q922T2 349 aa14.89□□□□□ -0.03
Satb2-201ENSMUST00000042857 Fam84aQ9D650 292 aa14.89□□□□□ -0.03
Satb2-201ENSMUST00000042857 Cyp3a57D3YYZ0 503 aa14.88□□□□□ -0.03
Satb2-201ENSMUST00000042857 Myo1fP70248 1099 aa14.88□□□□□ -0.03
Satb2-201ENSMUST00000042857 Nuak1Q641K5 658 aa14.88□□□□□ -0.03
Satb2-201ENSMUST00000042857 Afg3l1Q920A7 789 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
Satb2-201ENSMUST00000042857 Angptl3Q9R182 455 aa14.88□□□□□ -0.03
Satb2-201ENSMUST00000042857 Gfpt2Q9Z2Z9 682 aa14.88□□□□□ -0.03
Satb2-201ENSMUST00000042857 Spata31d1bE9QA57 1361 aa14.88□□□□□ -0.03
Satb2-201ENSMUST00000042857 Kcna1P16388 495 aa14.88□□□□□ -0.03
Satb2-201ENSMUST00000042857 Arhgef9Q3UTH8 516 aa14.88□□□□□ -0.03
Satb2-201ENSMUST00000042857 Rhpn1Q61085 643 aa14.88□□□□□ -0.03
Satb2-201ENSMUST00000042857 Epc1Q8C9X6 813 aa14.88□□□□□ -0.03
Satb2-201ENSMUST00000042857 Riox2Q8CD15 465 aa14.88□□□□□ -0.03
Satb2-201ENSMUST00000042857 Ints9Q8K114 658 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
Satb2-201ENSMUST00000042857 Gm21962L7N280 338 aa14.88□□□□□ -0.03
Satb2-201ENSMUST00000042857 Ccdc87Q8CDL9 855 aa14.88□□□□□ -0.03
Satb2-201ENSMUST00000042857 Il7P10168 154 aa14.88□□□□□ -0.03
Satb2-201ENSMUST00000042857 SftpbP50405 377 aa14.88□□□□□ -0.03
Satb2-201ENSMUST00000042857 C87499Q3UX49 493 aa14.88□□□□□ -0.03
Satb2-201ENSMUST00000042857 Gemin5Q8BX17 1502 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
Satb2-201ENSMUST00000042857 Vmn2r68L7N2B3 851 aa14.88□□□□□ -0.03
Satb2-201ENSMUST00000042857 Surf1P09925 306 aa14.88□□□□□ -0.03
Satb2-201ENSMUST00000042857 Serpind1P49182 478 aa14.88□□□□□ -0.03
Satb2-201ENSMUST00000042857 Nek9Q8K1R7 984 aa14.88□□□□□ -0.03
Satb2-201ENSMUST00000042857 HibadhQ99L13 335 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
Satb2-201ENSMUST00000042857 Deaf1Q9Z1T5 566 aa14.88□□□□□ -0.03
Satb2-201ENSMUST00000042857 Kif6E9PX57 802 aa14.87□□□□□ -0.03
Satb2-201ENSMUST00000042857 Ppargc1aO70343 797 aa14.87□□□□□ -0.03
Satb2-201ENSMUST00000042857 Kdm8Q9CXT6 414 aa14.87□□□□□ -0.03
Satb2-201ENSMUST00000042857 Tfap4Q9JIZ5 338 aa14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 101.4 ms