RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027367.13

Ctdsp1-201, Transcript of Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctdsp1, Length 2,876 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Acat1Q8QZT1 424 aa22.27■■□□□ 1.16
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Znrd1-asQ8R0E5 213 aa22.27■■□□□ 1.16
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Cnbd1B1AWM0 430 aa22.27■■□□□ 1.16
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Pls1Q3V0K9 630 aa22.27■■□□□ 1.16
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 LdhdQ7TNG8 484 aa22.27■■□□□ 1.16
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Phldb2Q8K1N2 1249 aa22.27■■□□□ 1.16
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Ces4aQ8R0W5 563 aa22.27■■□□□ 1.16
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Mis12Q9CY25 206 aa22.27■■□□□ 1.16
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Knop1Q9Z2Q2 478 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Akr1b1P45376 316 aa22.26■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 D130040H23RikQ8BII3 405 aa22.26■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Ttc26Q8BS45 554 aa22.26■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Ttc6G3UYY4 1857 aa22.26■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Gm3409A0A0G2JE67 319 aa22.26■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Cap1P40124 474 aa22.26■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Pdrg1P59048 133 aa22.26■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Psen2Q61144 448 aa22.26■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Sp4Q62445 782 aa22.26■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Sap130Q8BIH0 1057 aa22.26■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Morc2bQ8C5W4 1022 aa22.26■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Kbtbd13Q8C828 458 aa22.26■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 CnstQ8CBC4 711 aa22.26■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Shtn1Q8K2Q9 631 aa22.26■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Spata4Q8K3V1 295 aa22.26■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Ccdc12Q8R344 166 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Snapc2Q91XA5 359 aa22.26■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Gbp7Q91Z40 638 aa22.26■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Coa7Q921H9 231 aa22.26■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Pabpc6Q9D4E6 643 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Tgm5Q9D7I9 724 aa22.26■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2310002L09RikQ9D7L5 217 aa22.26■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 BcamQ9R069 622 aa22.26■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 C87977A2A958 498 aa22.25■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Spocd1B1ASB6 936 aa22.25■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Gm28042B7ZCM9 1014 aa22.25■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 ByslO54825 436 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 RaraP11416 462 aa22.25■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Krt14Q61781 484 aa22.25■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Ncoa7Q6DFV7 943 aa22.25■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Herc4Q6PAV2 1057 aa22.25■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Ccdc57Q6PHN1 1016 aa22.25■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Fbxo10Q7TQF2 950 aa22.25■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 P2ry10Q8BFU7 328 aa22.25■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Tbx18Q9EPZ6 613 aa22.25■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Zmym1Q3TJB1 983 aa22.25■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Wdr70Q3TWF6 657 aa22.25■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Tsg101Q61187 391 aa22.25■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Eif3j2Q66JS6 263 aa22.25■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Csgalnact2Q8C1F4 542 aa22.25■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Ppm1fQ8CGA0 452 aa22.25■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Ago4Q8CJF8 861 aa22.25■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Q9CYI0 393 aa22.25■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Cmtr1Q9DBC3 837 aa22.25■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Gm4985A2ALC6 410 aa22.24■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Gm3095E9Q058 166 aa22.24■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Grik5Q61626 979 aa22.24■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 B4galnt4Q766D5 1034 aa22.24■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Armcx3Q8BHS6 379 aa22.24■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Ndfip2Q91ZP6 311 aa22.24■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Ndst4Q9EQW8 872 aa22.24■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Gm1993A6X8I0 212 aa22.24■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 SlxD3Z347 212 aa22.24■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Apol10bG3X9K7 334 aa22.24■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Krt86P97861 486 aa22.24■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Defb15Q8R2I5 79 aa22.24■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Tex21Q9R0U9 575 aa22.24■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Zfp341Q6PGC9 846 aa22.24■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Gprasp2Q8BUY8 826 aa22.24■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Tmem192Q9CXT7 266 aa22.24■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Lypla2Q9WTL7 231 aa22.24■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Exoc3l2D3YUP5 789 aa22.23■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Slc18a1Q8R090 521 aa22.23■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Dqx1Q924H9 718 aa22.23■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 SufuQ9Z0P7 484 aa22.23■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Vmn2r79E9Q067 851 aa22.23■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Kifap3P70188 793 aa22.23■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 MtrrQ8C1A3 696 aa22.23■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Rfc4Q99J62 364 aa22.23■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Rsrc2A2RTL5 376 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Mcm5P49718 733 aa22.22■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 EregQ61521 162 aa22.22■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 March6Q6ZQ89 909 aa22.22■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Nek5Q7TSC3 627 aa22.22■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Drd5Q8BLD9 478 aa22.22■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Def6Q8C2K1 630 aa22.22■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Atp1a1Q8VDN2 1023 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 CrygnQ8VHL5 183 aa22.22■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 AurkbO70126 345 aa22.22■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Parp2O88554 559 aa22.22■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Tnfaip8l3Q3TBL6 204 aa22.22■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Gprc5cQ8K3J9 440 aa22.22■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Ears2Q9CXJ1 523 aa22.22■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 CsadQ9DBE0 493 aa22.22■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Pdcd6ipQ9WU78 869 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Krt36B1AQ75 473 aa22.21■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Nova2D3YVV7 556 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Arhgap6O54834 987 aa22.21■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Tgfb2P27090 414 aa22.21■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Bace1P56818 501 aa22.21■■□□□ 1.15
Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 Hspa4Q61316 841 aa22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 19.4 ms