RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592576.5

EFTUD2-223, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-223	ENST00000592576	TEC	P42680	631 aa		10.35	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		10.35	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		10.35	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	10.35	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		10.35	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		10.35	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	10.35	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		10.35	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	ASB14	A6NK59	587 aa		10.35	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	10.35	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	TBX3	O15119	743 aa		10.35	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	CUTA	O60888	179 aa		10.35	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	STAM2	O75886	525 aa		10.35	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	HOXC6	P09630	235 aa		10.35	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	CYP2B6	P20813	491 aa		10.35	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	SHC4	Q6S5L8	630 aa		10.35	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	ARMCX2	Q7L311	632 aa		10.35	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		10.35	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		10.35	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		10.35	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		10.35	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	CDC25A	P30304	524 aa		10.35	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	SEMA3F	Q13275	785 aa		10.35	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	KIF22	Q14807	665 aa		10.35	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		10.35	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	USP49	Q70CQ1	688 aa		10.35	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		10.35	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		10.35	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	MORC4	Q8TE76	937 aa		10.35	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	GPRASP2	Q96D09	838 aa		10.35	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM20A	Q96MK3	541 aa		10.35	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		10.34	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	ATP9A	O75110	1047 aa		10.34	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	RGS2	P41220	211 aa		10.34	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		10.34	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	NLRX1	Q86UT6	975 aa		10.34	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	TINF2	Q9BSI4	451 aa		10.34	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		10.34	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576		A0A1W2PQ27	194 aa		10.34	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576		A0A1W2PQ64	194 aa		10.34	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576		A0A1W2PQD8	194 aa		10.34	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	POTEM	A6NI47	508 aa		10.34	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	PP2D1	A8MPX8	630 aa		10.34	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	CCL14	Q16627	93 aa		10.34	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		10.34	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	GPT2	Q8TD30	523 aa		10.34	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC5A5	Q92911	643 aa		10.34	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	EPSTI1	Q96J88	318 aa		10.34	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	WBP1L	Q9NX94	342 aa		10.34	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	GABRQ	Q9UN88	632 aa		10.34	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	BRCA2	P51587	3418 aa		10.34	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	MGAM	O43451	1857 aa		10.34	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576		A0A1B0GVL5	298 aa		10.34	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	CMA1	P23946	247 aa		10.34	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	FLT3LG	P49771	235 aa		10.34	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	10.34	□□□□□ -0.75	5e-7	■■■■□ 26.7
EFTUD2-223	ENST00000592576	PRKCZ	Q05513	592 aa		10.34	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		10.34	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		10.34	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		10.34	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	APBA2	Q99767	749 aa		10.34	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		10.34	□□□□□ -0.75
EFTUD2-223	ENST00000592576	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		10.33	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	MAFG	O15525	162 aa		10.33	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	GAS7	O60861	476 aa		10.33	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	PSMD10	O75832	226 aa		10.33	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	RESP18	Q5W5W9	173 aa		10.33	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	FSIP1	Q8NA03	581 aa		10.33	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	CDHR1	Q96JP9	859 aa		10.33	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		10.33	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	VAV3	Q9UKW4	847 aa		10.33	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		10.33	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	FKTN	O75072	461 aa		10.33	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	LIG1	P18858	919 aa		10.33	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	SP2	Q02086	613 aa		10.33	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		10.33	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		10.33	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	10.32	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	KCNA2	P16389	499 aa		10.32	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	PDIA5	Q14554	519 aa		10.32	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		10.32	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	RIT2	Q99578	217 aa		10.32	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	RAB34	Q9BZG1	259 aa		10.32	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		10.32	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		10.32	□□□□□ -0.76
EFTUD2-223	ENST00000592576	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		10.32	□□□□□ -0.76

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms