RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590367.5

EFTUD2-218, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 3,638 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-218ENST00000590367 STK38Q15208 465 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 ADALQ6DHV7 355 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 IRGCQ6NXR0 463 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 ZNF554Q86TJ5 538 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 DPF2Q92785 391 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 IQCDQ96DY2 449 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 CARD9Q9H257 536 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 LEMD3Q9Y2U8 911 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 C4BP0C0L5 1744 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 LRRC10BA6NIK2 292 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 NQO1P15559 274 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 PHEXP78562 749 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 TNNI3KQ59H18 835 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 ODF2Q5BJF6 829 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 PI16Q6UXB8 463 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 SH2D3CQ8N5H7 860 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 CAVIN3Q969G5 261 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 SLC35B4Q969S0 331 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 HIC2Q96JB3 615 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 RMND1Q9NWS8 449 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 C5orf60A6NFR6 353 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 ATP6V1C1P21283 382 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 SP100P23497 879 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 HDAC4P56524 1084 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 RUFY4Q6ZNE9 571 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 STAG2Q8N3U4 1231 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 HAUS1Q96CS2 278 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 PIDD1Q9HB75 910 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 PDP2Q9P2J9 529 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 CROTQ9UKG9 612 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 CASZ1Q86V15 1759 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 SOWAHDA6NJG2 315 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 SLC27A2O14975 620 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 ZMYND10O75800 440 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 WFS1O76024 890 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 PDHA1P08559 390 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 STIP1P31948 543 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 MAP3K12Q12852 859 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 PDIA6Q15084 440 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 TPTE2Q6XPS3 522 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 CD302Q8IX05 232 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 PLBD2Q8NHP8 589 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 WDR60Q8WVS4 1066 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 EXOC1Q9NV70 894 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 RABL2BQ9UNT1 228 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 SUPT3HO75486 399 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 TM4SF1P30408 202 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 FLT3P36888 993 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 AMPD2Q01433 879 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 TMEM62Q0P6H9 643 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 CFAP157Q5JU67 520 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 GRAMD4Q6IC98 578 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 ANO7Q6IWH7 933 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 TRIML1Q8N9V2 468 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 KCNG4Q8TDN1 519 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 KAZALD1Q96I82 304 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 MAML3Q96JK9 1138 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 CLMNQ96JQ2 1002 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 CATSPER2Q96P56 530 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 SMC6Q96SB8 1091 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 SAMD15Q9P1V8 674 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 ITM2BQ9Y287 266 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 TRAPPC3O43617 180 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 MYBL1P10243 752 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 GSTT1P30711 240 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 ZNF131P52739 623 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 OXCT1P55809 520 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 ARPC4P59998 168 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 ITIH4Q14624 930 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 TTC39AQ5SRH9 613 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 ZIM3Q96PE6 472 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 PANK4Q9NVE7 773 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 PXDNLA1KZ92 1463 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 PAPPAQ13219 1627 aa8.47□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms