RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588667.5

ATG4D-208, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATG4D, Length 1,619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-208ENST00000588667 KLHDC9Q8NEP7 349 aa22.96■■□□□ 1.27
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ATG4D-208ENST00000588667 RTEL1Q9NZ71 1219 aa22.96■■□□□ 1.27
ATG4D-208ENST00000588667 M0R2N6 131 aa22.95■■□□□ 1.26
ATG4D-208ENST00000588667 ICAM3P32942 547 aa22.95■■□□□ 1.26
ATG4D-208ENST00000588667 ARHGAP4P98171 946 aa22.95■■□□□ 1.26
ATG4D-208ENST00000588667 CLEC17AQ6ZS10 378 aa22.95■■□□□ 1.26
ATG4D-208ENST00000588667 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
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ATG4D-208ENST00000588667 MYADML2A6NDP7 307 aa22.94■■□□□ 1.26
ATG4D-208ENST00000588667 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
ATG4D-208ENST00000588667 FIBPO43427 364 aa22.94■■□□□ 1.26
ATG4D-208ENST00000588667 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
ATG4D-208ENST00000588667 PTGS1P23219 599 aa22.94■■□□□ 1.26
ATG4D-208ENST00000588667 TRIM29Q14134 588 aa22.94■■□□□ 1.26
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ATG4D-208ENST00000588667 NLRX1Q86UT6 975 aa22.94■■□□□ 1.26
ATG4D-208ENST00000588667 CRYGNQ8WXF5 182 aa22.94■■□□□ 1.26
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ATG4D-208ENST00000588667 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa22.94■■□□□ 1.26
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ATG4D-208ENST00000588667 COL6A1P12109 1028 aa22.93■■□□□ 1.26
ATG4D-208ENST00000588667 OR6J1Q8NGC5 347 aa22.93■■□□□ 1.26
ATG4D-208ENST00000588667 COPS5Q92905 334 aa22.93■■□□□ 1.26
ATG4D-208ENST00000588667 CDHR1Q96JP9 859 aa22.93■■□□□ 1.26
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ATG4D-208ENST00000588667 C11orf49Q9H6J7 331 aa22.93■■□□□ 1.26
ATG4D-208ENST00000588667 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa22.93■■□□□ 1.26
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ATG4D-208ENST00000588667 BRMS1Q9HCU9 246 aa22.93■■□□□ 1.26
ATG4D-208ENST00000588667 PHF24Q9UPV7 400 aa22.93■■□□□ 1.26
ATG4D-208ENST00000588667 DOCK5Q9H7D0 1870 aa22.93■■□□□ 1.26
ATG4D-208ENST00000588667 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
ATG4D-208ENST00000588667 MOXD2PA6NHM9 499 aa22.92■■□□□ 1.26
ATG4D-208ENST00000588667 CYP3A4P08684 503 aa22.92■■□□□ 1.26
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ATG4D-208ENST00000588667 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
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ATG4D-208ENST00000588667 JADE2Q9NQC1 790 aa22.92■■□□□ 1.26
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ATG4D-208ENST00000588667 ARHGAP1Q07960 439 aa22.91■■□□□ 1.26
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ATG4D-208ENST00000588667 H3BQV1 296 aa22.9■■□□□ 1.26
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ATG4D-208ENST00000588667 SP2Q02086 613 aa22.9■■□□□ 1.26
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ATG4D-208ENST00000588667 GGPS1O95749 300 aa22.89■■□□□ 1.25
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ATG4D-208ENST00000588667 NEDD9Q14511 834 aa22.89■■□□□ 1.25
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ATG4D-208ENST00000588667 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa22.88■■□□□ 1.25
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ATG4D-208ENST00000588667 CIITAP33076 1130 aa22.88■■□□□ 1.25
ATG4D-208ENST00000588667 USP11P51784 963 aa22.88■■□□□ 1.25
ATG4D-208ENST00000588667 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
ATG4D-208ENST00000588667 MYSM1Q5VVJ2 828 aa22.88■■□□□ 1.25
ATG4D-208ENST00000588667 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
ATG4D-208ENST00000588667 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
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