RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586654.5

EFTUD2-206, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 585 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-206	ENST00000586654	MFSD5	Q6N075	450 aa		11.22	□□□□□ -0.61
EFTUD2-206	ENST00000586654	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		11.22	□□□□□ -0.61
EFTUD2-206	ENST00000586654	SCFD2	Q8WU76	684 aa		11.22	□□□□□ -0.61
EFTUD2-206	ENST00000586654	PHKB	Q93100	1093 aa		11.22	□□□□□ -0.61
EFTUD2-206	ENST00000586654	MTMR8	Q96EF0	704 aa		11.22	□□□□□ -0.61
EFTUD2-206	ENST00000586654	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
EFTUD2-206	ENST00000586654	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		11.22	□□□□□ -0.61
EFTUD2-206	ENST00000586654	AMN	Q9BXJ7	453 aa		11.22	□□□□□ -0.61
EFTUD2-206	ENST00000586654	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
EFTUD2-206	ENST00000586654	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		11.22	□□□□□ -0.61
EFTUD2-206	ENST00000586654	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
EFTUD2-206	ENST00000586654	COL20A1	Q9P218	1284 aa		11.22	□□□□□ -0.61
EFTUD2-206	ENST00000586654	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		11.22	□□□□□ -0.61
EFTUD2-206	ENST00000586654	ZBTB5	O15062	677 aa		11.21	□□□□□ -0.61
EFTUD2-206	ENST00000586654	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
EFTUD2-206	ENST00000586654	CPT1A	P50416	773 aa		11.21	□□□□□ -0.61
EFTUD2-206	ENST00000586654	KRT85	P78386	507 aa		11.21	□□□□□ -0.61
EFTUD2-206	ENST00000586654	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
EFTUD2-206	ENST00000586654	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	11.21	□□□□□ -0.61	1e-7	■□□□□ 9.4
EFTUD2-206	ENST00000586654	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
EFTUD2-206	ENST00000586654	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		11.21	□□□□□ -0.61
EFTUD2-206	ENST00000586654	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		11.21	□□□□□ -0.61
EFTUD2-206	ENST00000586654	FERMT3	Q86UX7	667 aa		11.21	□□□□□ -0.61
EFTUD2-206	ENST00000586654	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
EFTUD2-206	ENST00000586654	COPS5	Q92905	334 aa		11.21	□□□□□ -0.61
EFTUD2-206	ENST00000586654	RMDN3	Q96TC7	470 aa		11.21	□□□□□ -0.61
EFTUD2-206	ENST00000586654	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		11.21	□□□□□ -0.61
EFTUD2-206	ENST00000586654	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		11.21	□□□□□ -0.61
EFTUD2-206	ENST00000586654	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		11.21	□□□□□ -0.61
EFTUD2-206	ENST00000586654	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		11.21	□□□□□ -0.61
EFTUD2-206	ENST00000586654	SZT2	Q5T011	3432 aa		11.21	□□□□□ -0.62
EFTUD2-206	ENST00000586654	OPLAH	O14841	1288 aa		11.2	□□□□□ -0.62
EFTUD2-206	ENST00000586654	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
EFTUD2-206	ENST00000586654	B4GALT4	O60513	344 aa		11.2	□□□□□ -0.62
EFTUD2-206	ENST00000586654	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
EFTUD2-206	ENST00000586654	PPFIA3	O75145	1194 aa		11.2	□□□□□ -0.62
EFTUD2-206	ENST00000586654	ARIH2	O95376	493 aa		11.2	□□□□□ -0.62
EFTUD2-206	ENST00000586654	CFB	P00751	764 aa		11.2	□□□□□ -0.62
EFTUD2-206	ENST00000586654	MYL3	P08590	195 aa		11.2	□□□□□ -0.62
EFTUD2-206	ENST00000586654	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
EFTUD2-206	ENST00000586654	CSF2RA	P15509	400 aa		11.2	□□□□□ -0.62
EFTUD2-206	ENST00000586654	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
EFTUD2-206	ENST00000586654	GHRHR	Q02643	423 aa		11.2	□□□□□ -0.62
EFTUD2-206	ENST00000586654	REST	Q13127	1097 aa		11.2	□□□□□ -0.62
EFTUD2-206	ENST00000586654	TTLL4	Q14679	1199 aa		11.2	□□□□□ -0.62
EFTUD2-206	ENST00000586654	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	11.2	□□□□□ -0.62
EFTUD2-206	ENST00000586654	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
EFTUD2-206	ENST00000586654	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
EFTUD2-206	ENST00000586654	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		11.2	□□□□□ -0.62
EFTUD2-206	ENST00000586654	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
EFTUD2-206	ENST00000586654	TMEM199	Q8N511	208 aa		11.2	□□□□□ -0.62
EFTUD2-206	ENST00000586654	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		11.2	□□□□□ -0.62
EFTUD2-206	ENST00000586654	FAM161B	Q96MY7	647 aa		11.2	□□□□□ -0.62
EFTUD2-206	ENST00000586654	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
EFTUD2-206	ENST00000586654	IWS1	Q96ST2	819 aa		11.2	□□□□□ -0.62
EFTUD2-206	ENST00000586654	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	11.2	□□□□□ -0.62	4e-10	■□□□□ 10.5
EFTUD2-206	ENST00000586654	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
EFTUD2-206	ENST00000586654	HIPK3	Q9H422	1215 aa		11.2	□□□□□ -0.62
EFTUD2-206	ENST00000586654	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		11.2	□□□□□ -0.62
EFTUD2-206	ENST00000586654	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		11.2	□□□□□ -0.62
EFTUD2-206	ENST00000586654	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		11.19	□□□□□ -0.62
EFTUD2-206	ENST00000586654		A6NJR5	290 aa		11.19	□□□□□ -0.62
EFTUD2-206	ENST00000586654	CYTH3	O43739	400 aa		11.19	□□□□□ -0.62
EFTUD2-206	ENST00000586654	KPNA6	O60684	536 aa		11.19	□□□□□ -0.62
EFTUD2-206	ENST00000586654	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		11.19	□□□□□ -0.62
EFTUD2-206	ENST00000586654	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
EFTUD2-206	ENST00000586654	CYP2C18	P33260	490 aa		11.19	□□□□□ -0.62
EFTUD2-206	ENST00000586654	HSD17B4	P51659	736 aa		11.19	□□□□□ -0.62
EFTUD2-206	ENST00000586654	GUCY1B3	Q02153	619 aa		11.19	□□□□□ -0.62
EFTUD2-206	ENST00000586654	STXBP2	Q15833	593 aa		11.19	□□□□□ -0.62
EFTUD2-206	ENST00000586654	TMEM240	Q5SV17	173 aa		11.19	□□□□□ -0.62
EFTUD2-206	ENST00000586654	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		11.19	□□□□□ -0.62
EFTUD2-206	ENST00000586654	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		11.19	□□□□□ -0.62
EFTUD2-206	ENST00000586654	BRAP	Q7Z569	592 aa		11.19	□□□□□ -0.62
EFTUD2-206	ENST00000586654	HOMER1	Q86YM7	354 aa		11.19	□□□□□ -0.62
EFTUD2-206	ENST00000586654	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		11.19	□□□□□ -0.62
EFTUD2-206	ENST00000586654	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		11.19	□□□□□ -0.62
EFTUD2-206	ENST00000586654	GUCD1	Q96NT3	240 aa		11.19	□□□□□ -0.62
EFTUD2-206	ENST00000586654	PIGS	Q96S52	555 aa		11.19	□□□□□ -0.62
EFTUD2-206	ENST00000586654	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		11.19	□□□□□ -0.62
EFTUD2-206	ENST00000586654	PXMP2	Q9NR77	195 aa		11.19	□□□□□ -0.62
EFTUD2-206	ENST00000586654	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
EFTUD2-206	ENST00000586654	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		11.19	□□□□□ -0.62
EFTUD2-206	ENST00000586654	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		11.18	□□□□□ -0.62
EFTUD2-206	ENST00000586654	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
EFTUD2-206	ENST00000586654	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
EFTUD2-206	ENST00000586654	FIBP	O43427	364 aa		11.18	□□□□□ -0.62
EFTUD2-206	ENST00000586654	TRAK2	O60296	914 aa		11.18	□□□□□ -0.62
EFTUD2-206	ENST00000586654	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
EFTUD2-206	ENST00000586654	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
EFTUD2-206	ENST00000586654	MBD3	O95983	291 aa		11.18	□□□□□ -0.62
EFTUD2-206	ENST00000586654	NR3C2	P08235	984 aa		11.18	□□□□□ -0.62
EFTUD2-206	ENST00000586654	ACR	P10323	421 aa		11.18	□□□□□ -0.62
EFTUD2-206	ENST00000586654	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
EFTUD2-206	ENST00000586654	TRAF1	Q13077	416 aa		11.18	□□□□□ -0.62
EFTUD2-206	ENST00000586654	KRT40	Q6A162	431 aa		11.18	□□□□□ -0.62
EFTUD2-206	ENST00000586654	ATL3	Q6DD88	541 aa		11.18	□□□□□ -0.62
EFTUD2-206	ENST00000586654	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
EFTUD2-206	ENST00000586654	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		11.18	□□□□□ -0.62
EFTUD2-206	ENST00000586654	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62

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