RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577760.1

RPL23-208, Transcript of ribosomal protein L23, human

Gene RPL23, Length 3,081 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPL23-208	ENST00000577760	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		12	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	KCNMA1	Q12791	1236 aa		12	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		12	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		12	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		12	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	TLDC2	A0PJX2	215 aa		12	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	SMCO2	A6NFE2	343 aa		12	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	PDE6B	P35913	854 aa		12	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	CDK17	Q00537	523 aa		12	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	AMPD3	Q01432	767 aa		12	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		12	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	SMIM5	Q71RC9	77 aa		12	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	TBCK	Q8TEA7	893 aa		12	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		12	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		12	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		12	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		12	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		12	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	DISP2	A7MBM2	1401 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	GMNC	A6NCL1	334 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	EPS15	P42566	896 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	MAGOH	P61326	146 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	ITIH3	Q06033	890 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	KRT71	Q3SY84	523 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	MAGOHB	Q96A72	148 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	GOPC	Q9HD26	462 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	AMACR	Q9UHK6	382 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	11.99	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	DAPK3	O43293	454 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	MARCH6	O60337	910 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	TSPY3	P0CV98	308 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	TSPY8	P0CW00	308 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	ACTN1	P12814	892 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	ITGA4	P13612	1032 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	COPB2	P35606	906 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	TNNC1	P63316	161 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	RPS6KA1	Q15418	735 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	FIGN	Q5HY92	759 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	CENPP	Q6IPU0	288 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	TMBIM4	Q9HC24	238 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	BAIAP2L1	Q9UHR4	511 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	CEP83	Q9Y592	693 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	SNCB	Q16143	134 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	UAP1	Q16222	522 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	KCNK18	Q7Z418	384 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	GGT7	Q9UJ14	662 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	KLRF2	D3W0D1	207 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	STXBP3	O00186	592 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	ELF1	P32519	619 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	NEDD9	Q14511	834 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	11.98	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	PARP9	Q8IXQ6	854 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	HNRNPH3	P31942	346 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	SMTN	P53814	917 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	ZNF844	Q08AG5	666 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	GRB10	Q13322	594 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	USP38	Q8NB14	1042 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	WHAMM	Q8TF30	809 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	RAPGEF5	Q92565	580 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	DDX12P	Q92771	950 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	TSG101	Q99816	390 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RPL23-208	ENST00000577760	SELENOS	Q9BQE4	189 aa		11.97	□□□□□ -0.49

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