RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574234.1

TRIM25-208, Transcript of tripartite motif containing 25, humanhuman

TSL 2

Gene TRIM25, Length 471 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25-208ENST00000574234 PICALMQ13492 652 aa6.34□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP6.34□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 CCDC116Q8IYX3 515 aa6.34□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 SHCBP1Q8NEM2 672 aa6.34□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 GPR152Q8TDT2 470 aa6.34□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 DNAAF4Q8WXU2 420 aa6.34□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa6.34□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa6.34□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 STK31Q9BXU1 1019 aa6.34□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa6.34□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 OSBPL7Q9BZF2 842 aa6.34□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 C12orf49Q9H741 205 aa6.34□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 CERS4Q9HA82 394 aa6.34□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 IFT57Q9NWB7 429 aa6.34□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 BTBD7Q9P203 1132 aa6.34□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa6.34□□□□□ -1.39
TRIM25-208ENST00000574234 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa6.34□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 COBLO75128 1261 aa6.33□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 IRS1P35568 1242 aa6.33□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 NBL1P41271 181 aa6.33□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 GNAI1P63096 354 aa6.33□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 KCTD2Q14681 263 aa6.33□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 TCEAL1Q15170 157 aa6.33□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 KCNA10Q16322 511 aa6.33□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 METTL24Q5JXM2 366 aa6.33□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa6.33□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 TREML1Q86YW5 311 aa6.33□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 FBXL6Q8N531 539 aa6.33□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 C8orf58Q8NAV2 365 aa6.33□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 EHBP1Q8NDI1 1231 aa6.33□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 TET1Q8NFU7 2136 aa6.33□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 SPACA7Q96KW9 195 aa6.33□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 FSD1Q9BTV5 496 aa6.33□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa6.33□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 PHACTR1Q9C0D0 580 aa6.33□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 HIPK3Q9H422 1215 aa6.33□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 ZNF232Q9UNY5 417 aa6.33□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 ATRXP46100 2492 aa6.33□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa6.32□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 ASPMQ8IZT6 3477 aa6.32□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 ACACBO00763 2458 aa6.32□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa6.32□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 TMEM221A6NGB7 291 aa6.32□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 A6NHS1 94 aa6.32□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 KIF28PB7ZC32 967 aa6.32□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 M0R296 226 aa6.32□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 GRM8O00222 908 aa6.32□□□□□ -1.4
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TRIM25-208ENST00000574234 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 RHBDL3P58872 404 aa6.32□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 PAK2Q13177 524 aa6.32□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 C8orf34Q49A92 452 aa6.32□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 PLA2G2CQ5R387 149 aa6.32□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 TRIM67Q6ZTA4 783 aa6.32□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 G2E3Q7L622 706 aa6.32□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 JAZF1Q86VZ6 243 aa6.32□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 VWCEQ96DN2 955 aa6.32□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 MROH8Q9H579 483 aa6.32□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 PI4KBQ9UBF8 816 aa6.32□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 MUTYHQ9UIF7 546 aa6.32□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 CHD8Q9HCK8 2581 aa6.32□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 TPRP12270 2363 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 POTEMA6NI47 508 aa6.31□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 SIAH2O43255 324 aa6.31□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 ARHGEF15O94989 841 aa6.31□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 ASGR1P07306 291 aa6.31□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 ACTN1P12814 892 aa6.31□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 BTDP43251 543 aa6.31□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 ST13P50502 369 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 USP14P54578 494 aa6.31□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 CENPCQ03188 943 aa6.31□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 NR5A1Q13285 461 aa6.31□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 MEI1Q5TIA1 1274 aa6.31□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 PI16Q6UXB8 463 aa6.31□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa6.31□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 HERC6Q8IVU3 1022 aa6.31□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 GDPD5Q8WTR4 605 aa6.31□□□□□ -1.4
TRIM25-208ENST00000574234 LPIN2Q92539 896 aa6.31□□□□□ -1.4
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