RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569223.1

EHD4-202, Transcript of EH domain containing 4, humanhuman

TSL 2

Gene EHD4, Length 2,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4-202ENST00000569223 ARHGAP4P98171 946 aa25.76■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 FAM26FQ5R3K3 315 aa25.76■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 POTEBQ6S5H4 581 aa25.76■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 ZNF662Q6ZS27 426 aa25.76■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 SLFN12Q8IYM2 578 aa25.76■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 CCDC170Q8IYT3 715 aa25.76■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 PARD6BQ9BYG5 372 aa25.76■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 GH2P01242 217 aa25.75■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 PLA2G4BP0C869 781 aa25.75■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 STAT3P40763 770 aa25.75■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 CDK17Q00537 523 aa25.75■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 MCTP2Q6DN12 878 aa25.75■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 AMPD2Q01433 879 aa25.75■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 ZCWPW2Q504Y3 356 aa25.75■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa25.74■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 PSME4Q14997 1843 aa25.74■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 YDJCA8MPS7 323 aa25.74■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 MMP14P50281 582 aa25.74■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 IKQ13123 557 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa25.74■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 USH1GQ495M9 461 aa25.74■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 ETNPPLQ8TBG4 499 aa25.74■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 MED24O75448 989 aa25.73■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 BMP3P12645 472 aa25.73■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 CCDC122Q5T0U0 273 aa25.73■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa25.73■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 KIAA1328Q86T90 577 aa25.73■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 GPBP1Q86WP2 473 aa25.73■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 TFR2Q9UP52 801 aa25.73■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 PSMD14O00487 310 aa25.73■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 DMTNQ08495 405 aa25.73■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 Q4G0T1 1027 aa25.73■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 BTNL9Q6UXG8 535 aa25.73■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 CCDC65Q8IXS2 484 aa25.73■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 JAKMIP2Q96AA8 810 aa25.73■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 CSRNP1Q96S65 589 aa25.73■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa25.73■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa25.73■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa25.72■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 EPHB6O15197 1021 aa25.72■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 TFRCP02786 760 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 SPIRE1Q08AE8 756 aa25.72■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 PRR16Q569H4 304 aa25.72■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 SUPT20HQ8NEM7 779 aa25.72■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 MYO6Q9UM54 1294 aa25.72■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 PPIP5K2O43314 1243 aa25.71■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 CYP11B2P19099 503 aa25.71■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 SREBF1P36956 1147 aa25.71■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 LENG9Q96B70 501 aa25.71■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 TBC1D7Q9P0N9 293 aa25.71■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 A0A1W2PRG0 241 aa25.71■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 RCCD1A6NED2 376 aa25.71■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 SPDYE3A6NKU9 549 aa25.71■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 TBX3O15119 743 aa25.71■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 FOSP01100 380 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 PLAGL2Q9UPG8 496 aa25.71■■□□□ 1.71
EHD4-202ENST00000569223 POTEFA5A3E0 1075 aa25.7■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 ATP8B1O43520 1251 aa25.7■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 KRT86O43790 486 aa25.7■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 POTEIP0CG38 1075 aa25.7■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 SLC12A3P55017 1021 aa25.7■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 HAUS3Q68CZ6 603 aa25.7■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 POTEGQ6S5H5 508 aa25.7■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 POTEEQ6S8J3 1075 aa25.7■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 MMRN2Q9H8L6 949 aa25.7■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa25.7■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 OPLAHO14841 1288 aa25.7■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 EHBP1Q8NDI1 1231 aa25.7■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 LACRTQ9GZZ8 138 aa25.7■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa25.7■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 FRMD3A2A2Y4 597 aa25.69■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 TRAF5O00463 557 aa25.69■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 PLA2G4AP47712 749 aa25.69■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 TUBB4BP68371 445 aa25.69■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa25.69■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa25.69■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 FAM86B1E9PN63 330 aa25.68■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 FAM86B2P0C5J1 330 aa25.68■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 ARSHQ5FYA8 562 aa25.68■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
EHD4-202ENST00000569223 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms