RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 SPDYE3A6NKU9 549 aa19.64■□□□□ 0.73
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CCNDBP1-211ENST00000567434 CDC27P30260 824 aa19.64■□□□□ 0.73
CCNDBP1-211ENST00000567434 EVCP57679 992 aa19.64■□□□□ 0.73
CCNDBP1-211ENST00000567434 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP19.64■□□□□ 0.73
CCNDBP1-211ENST00000567434 SHHQ15465 462 aa19.64■□□□□ 0.73
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CCNDBP1-211ENST00000567434 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
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CCNDBP1-211ENST00000567434 MAFGO15525 162 aa19.59■□□□□ 0.73
CCNDBP1-211ENST00000567434 SCG2P13521 617 aa19.59■□□□□ 0.73
CCNDBP1-211ENST00000567434 PSEN2P49810 448 aa19.59■□□□□ 0.73
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CCNDBP1-211ENST00000567434 AP3B2Q13367 1082 aa19.59■□□□□ 0.73
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CCNDBP1-211ENST00000567434 CCDC155Q8N6L0 562 aa19.59■□□□□ 0.73
CCNDBP1-211ENST00000567434 C7orf31Q8N865 590 aa19.59■□□□□ 0.73
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
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CCNDBP1-211ENST00000567434 NOD1Q9Y239 953 aa19.59■□□□□ 0.73
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CCNDBP1-211ENST00000567434 SMCO2A6NFE2 343 aa19.58■□□□□ 0.72
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.72
CCNDBP1-211ENST00000567434 PFKMP08237 780 aa19.58■□□□□ 0.72
CCNDBP1-211ENST00000567434 IFNAR1P17181 557 aa19.58■□□□□ 0.72
CCNDBP1-211ENST00000567434 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.72
CCNDBP1-211ENST00000567434 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.72
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CCNDBP1-211ENST00000567434 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.72
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.72
CCNDBP1-211ENST00000567434 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP19.58■□□□□ 0.721e-6■■■■□ 20.1
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CCNDBP1-211ENST00000567434 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa19.58■□□□□ 0.72
CCNDBP1-211ENST00000567434 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa19.58■□□□□ 0.72
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF286BP0CG31 522 aa19.57■□□□□ 0.72
CCNDBP1-211ENST00000567434 CYP2C9P11712 490 aa19.57■□□□□ 0.72
CCNDBP1-211ENST00000567434 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP19.57■□□□□ 0.72
CCNDBP1-211ENST00000567434 PTGISQ16647 500 aa19.57■□□□□ 0.72
CCNDBP1-211ENST00000567434 KIAA0753Q2KHM9 967 aa19.57■□□□□ 0.72
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMEM240Q5SV17 173 aa19.57■□□□□ 0.72
CCNDBP1-211ENST00000567434 CAGE1Q8TC20 777 aa19.57■□□□□ 0.72
CCNDBP1-211ENST00000567434 WNT8AQ9H1J5 351 aa19.57■□□□□ 0.72
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CCNDBP1-211ENST00000567434 ITGB5P18084 799 aa19.56■□□□□ 0.72
CCNDBP1-211ENST00000567434 RFC2P35250 354 aa19.56■□□□□ 0.72
CCNDBP1-211ENST00000567434 CLK2P49760 499 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
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