RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566243.5

EDC3-211, Transcript of enhancer of mRNA decapping 3, humanhuman

TSL 3

Gene EDC3, Length 711 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3-211ENST00000566243 MYSM1Q5VVJ2 828 aa21.87■■□□□ 1.09
EDC3-211ENST00000566243 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
EDC3-211ENST00000566243 MROH7Q68CQ1 1323 aa21.86■■□□□ 1.09
EDC3-211ENST00000566243 KIAA0355O15063 1070 aa21.86■■□□□ 1.09
EDC3-211ENST00000566243 KPNA6O60684 536 aa21.86■■□□□ 1.09
EDC3-211ENST00000566243 BMP8BP34820 402 aa21.86■■□□□ 1.09
EDC3-211ENST00000566243 CLK2P49760 499 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
EDC3-211ENST00000566243 SCRN1Q12765 414 aa21.86■■□□□ 1.09
EDC3-211ENST00000566243 TEX2Q8IWB9 1127 aa21.86■■□□□ 1.09
EDC3-211ENST00000566243 PPTC7Q8NI37 304 aa21.86■■□□□ 1.09
EDC3-211ENST00000566243 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa21.86■■□□□ 1.09
EDC3-211ENST00000566243 TMEM39AQ9NV64 488 aa21.86■■□□□ 1.09
EDC3-211ENST00000566243 TBX21Q9UL17 535 aa21.86■■□□□ 1.09
EDC3-211ENST00000566243 ESYT2A0FGR8 921 aa21.85■■□□□ 1.09
EDC3-211ENST00000566243 CPLX1O14810 134 aa21.85■■□□□ 1.09
EDC3-211ENST00000566243 FIBPO43427 364 aa21.85■■□□□ 1.09
EDC3-211ENST00000566243 CD4P01730 458 aa21.85■■□□□ 1.09
EDC3-211ENST00000566243 ITGB5P18084 799 aa21.85■■□□□ 1.09
EDC3-211ENST00000566243 HSDL1Q3SXM5 330 aa21.85■■□□□ 1.09
EDC3-211ENST00000566243 BADQ92934 168 aa21.85■■□□□ 1.09
EDC3-211ENST00000566243 SPATA33Q96N06 139 aa21.85■■□□□ 1.09
EDC3-211ENST00000566243 ANO3Q9BYT9 981 aa21.85■■□□□ 1.09
EDC3-211ENST00000566243 ZMYND12Q9H0C1 365 aa21.85■■□□□ 1.09
EDC3-211ENST00000566243 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa21.85■■□□□ 1.09
EDC3-211ENST00000566243 PFKFB2O60825 505 aa21.84■■□□□ 1.09
EDC3-211ENST00000566243 NEK4P51957 841 aa21.84■■□□□ 1.09
EDC3-211ENST00000566243 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
EDC3-211ENST00000566243 ANKRD1Q15327 319 aa21.84■■□□□ 1.09
EDC3-211ENST00000566243 NBPF20Q3BBV1 942 aa21.84■■□□□ 1.09
EDC3-211ENST00000566243 KAT2BQ92831 832 aa21.84■■□□□ 1.09
EDC3-211ENST00000566243 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
EDC3-211ENST00000566243 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
EDC3-211ENST00000566243 GLT8D2Q9H1C3 349 aa21.84■■□□□ 1.09
EDC3-211ENST00000566243 TRPV6Q9H1D0 765 aa21.84■■□□□ 1.09
EDC3-211ENST00000566243 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
EDC3-211ENST00000566243 VPS54Q9P1Q0 977 aa21.84■■□□□ 1.09
EDC3-211ENST00000566243 LAMA3Q16787 3333 aa21.83■■□□□ 1.09
EDC3-211ENST00000566243 DTNBO60941 627 aa21.83■■□□□ 1.09
EDC3-211ENST00000566243 FOSP01100 380 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
EDC3-211ENST00000566243 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
EDC3-211ENST00000566243 AP3B2Q13367 1082 aa21.83■■□□□ 1.09
EDC3-211ENST00000566243 DGKDQ16760 1214 aa21.83■■□□□ 1.09
EDC3-211ENST00000566243 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa21.83■■□□□ 1.09
EDC3-211ENST00000566243 NLRX1Q86UT6 975 aa21.83■■□□□ 1.09
EDC3-211ENST00000566243 TRIM22Q8IYM9 498 aa21.83■■□□□ 1.09
EDC3-211ENST00000566243 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
EDC3-211ENST00000566243 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa21.83■■□□□ 1.09
EDC3-211ENST00000566243 EHMT1Q9H9B1 1298 aa21.83■■□□□ 1.09
EDC3-211ENST00000566243 MLXIPQ9HAP2 919 aa21.83■■□□□ 1.09
EDC3-211ENST00000566243 C6orf50Q9HD87 102 aa21.83■■□□□ 1.09
EDC3-211ENST00000566243 TLR3O15455 904 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
EDC3-211ENST00000566243 B4GALT4O60513 344 aa21.82■■□□□ 1.08
EDC3-211ENST00000566243 LARGE1O95461 756 aa21.82■■□□□ 1.08
EDC3-211ENST00000566243 ZNF286BP0CG31 522 aa21.82■■□□□ 1.08
EDC3-211ENST00000566243 RAG1P15918 1043 aa21.82■■□□□ 1.08
EDC3-211ENST00000566243 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
EDC3-211ENST00000566243 CYFIP1Q7L576 1253 aa21.82■■□□□ 1.08
EDC3-211ENST00000566243 GPRASP2Q96D09 838 aa21.82■■□□□ 1.08
EDC3-211ENST00000566243 JADE2Q9NQC1 790 aa21.82■■□□□ 1.08
EDC3-211ENST00000566243 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
EDC3-211ENST00000566243 TELO2Q9Y4R8 837 aa21.82■■□□□ 1.08
EDC3-211ENST00000566243 ATP9AO75110 1047 aa21.81■■□□□ 1.08
EDC3-211ENST00000566243 DEXIO95424 95 aa21.81■■□□□ 1.08
EDC3-211ENST00000566243 SREBF1P36956 1147 aa21.81■■□□□ 1.08
EDC3-211ENST00000566243 CHMP4BP1P59074 171 aa21.81■■□□□ 1.08
EDC3-211ENST00000566243 NEDD9Q14511 834 aa21.81■■□□□ 1.08
EDC3-211ENST00000566243 ME3Q16798 604 aa21.81■■□□□ 1.08
EDC3-211ENST00000566243 FAM47CQ5HY64 1035 aa21.81■■□□□ 1.08
EDC3-211ENST00000566243 METTL7BQ6UX53 244 aa21.81■■□□□ 1.08
EDC3-211ENST00000566243 CYP2W1Q8TAV3 490 aa21.81■■□□□ 1.08
EDC3-211ENST00000566243 RASGRP4Q8TDF6 673 aa21.81■■□□□ 1.08
EDC3-211ENST00000566243 AIFM3Q96NN9 605 aa21.81■■□□□ 1.08
EDC3-211ENST00000566243 KIF2CQ99661 725 aa21.81■■□□□ 1.08
EDC3-211ENST00000566243 SENP7Q9BQF6 1050 aa21.81■■□□□ 1.08
EDC3-211ENST00000566243 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa21.8■■□□□ 1.08
EDC3-211ENST00000566243 A0A1W2PPC1 479 aa21.8■■□□□ 1.08
EDC3-211ENST00000566243 PPFIA4O75335 1185 aa21.8■■□□□ 1.08
EDC3-211ENST00000566243 CTDNEP1O95476 244 aa21.8■■□□□ 1.08
EDC3-211ENST00000566243 TIMP1P01033 207 aa21.8■■□□□ 1.08
EDC3-211ENST00000566243 KCNA2P16389 499 aa21.8■■□□□ 1.08
EDC3-211ENST00000566243 GNA11P29992 359 aa21.8■■□□□ 1.08
EDC3-211ENST00000566243 MTMR1Q13613 665 aa21.8■■□□□ 1.08
EDC3-211ENST00000566243 NFRKBQ6P4R8 1299 aa21.8■■□□□ 1.08
EDC3-211ENST00000566243 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
EDC3-211ENST00000566243 NECAB1Q8N987 351 aa21.8■■□□□ 1.08
EDC3-211ENST00000566243 CCDC148Q8NFR7 591 aa21.8■■□□□ 1.08
EDC3-211ENST00000566243 MXRA8Q9BRK3 442 aa21.8■■□□□ 1.08
EDC3-211ENST00000566243 SH3GLB2Q9NR46 395 aa21.8■■□□□ 1.08
EDC3-211ENST00000566243 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa21.8■■□□□ 1.08
EDC3-211ENST00000566243 F2P00734 622 aa21.79■■□□□ 1.08
EDC3-211ENST00000566243 ARHGAP4P98171 946 aa21.79■■□□□ 1.08
EDC3-211ENST00000566243 CRYGNQ8WXF5 182 aa21.79■■□□□ 1.08
EDC3-211ENST00000566243 CDHR1Q96JP9 859 aa21.79■■□□□ 1.08
EDC3-211ENST00000566243 GPR20Q99678 358 aa21.79■■□□□ 1.08
EDC3-211ENST00000566243 C22orf23Q9BZE7 217 aa21.79■■□□□ 1.08
EDC3-211ENST00000566243 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa21.79■■□□□ 1.08
EDC3-211ENST00000566243 PKD2L1Q9P0L9 805 aa21.79■■□□□ 1.08
EDC3-211ENST00000566243 HAS3O00219 553 aa21.78■■□□□ 1.08
EDC3-211ENST00000566243 CDKL5O76039 1030 aa21.78■■□□□ 1.08
EDC3-211ENST00000566243 PSEN2P49810 448 aa21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms