RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566135.1

TMX3-208, Transcript of thioredoxin related transmembrane protein 3, human

TSL 3

Gene TMX3, Length 395 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMX3-208	ENST00000566135	ZNF552	Q9H707	407 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	TRIM39	Q9HCM9	518 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	BTG4	Q9NY30	223 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	GULP1	Q9UBP9	304 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	PCDHA9	Q9Y5H5	950 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	IRAK3	Q9Y616	596 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	MYOCOS	A0A1B0GUC4	107 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	OR14I1	A6ND48	311 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	NRDC	O43847	1150 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	TRIM13	O60858	407 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	CRTAM	O95727	393 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	ADRB1	P08588	477 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	LSAMP	Q13449	338 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	NR0B2	Q15466	257 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	TM4SF20	Q53R12	229 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	GALNT18	Q6P9A2	607 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	LBX2	Q6XYB7	198 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	FGD2	Q7Z6J4	655 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	SP8	Q8IXZ3	490 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	4.36	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	TCRBV16S1A1N1	A0A5B0	115 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	NOTO	A8MTQ0	251 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	OPA1	O60313	960 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	DNAJC8	O75937	253 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	RASGRP1	O95267	797 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	FUCA1	P04066	466 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	APP	P05067	770 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	MSL3P1	P0C860	447 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	MYCLP1	P12525	358 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	PRKCA	P17252	672 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	NAT1	P18440	290 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	PI3	P19957	117 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	MASP1	P48740	699 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	AFF3	P51826	1226 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	GTF2A2	P52657	109 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	MVK	Q03426	396 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	KIR3DS1	Q14943	382 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	NUP43	Q8NFH3	380 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	SGPP1	Q9BX95	441 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	SP110	Q9HB58	689 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	SIRT5	Q9NXA8	310 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	CLDND1	Q9NY35	253 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	ACSL6	Q9UKU0	697 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	TNPO3	Q9Y5L0	923 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	PSPN	O60542	156 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	DNAJC6	O75061	913 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	SOD2	P04179	222 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	ASL	P04424	464 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	TACR1	P25103	407 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	IGFALS	P35858	605 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	GALK1	P51570	392 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	CORO7	P57737	925 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	PAK1	Q13153	545 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	SSPN	Q14714	243 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	CEP68	Q76N32	757 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	NLRX1	Q86UT6	975 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	NLRP10	Q86W26	655 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	LZTR1	Q8N653	840 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	USP33	Q8TEY7	942 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	TRMT2B	Q96GJ1	504 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	TMEM169	Q96HH4	297 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	ALG1	Q9BT22	464 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	MTA3	Q9BTC8	594 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	IPPK	Q9H8X2	491 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	SPC25	Q9HBM1	224 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TMX3-208	ENST00000566135	IFT57	Q9NWB7	429 aa		4.34	□□□□□ -1.71

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