RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564630.5

CCNDBP1-205, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 2,079 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-205ENST00000564630 MYO6Q9UM54 1294 aa22.57■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 hCG_1984214I3L0E3 225 aa22.56■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 CORO7P57737 925 aa22.56■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 STK4Q13043 487 aa22.56■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 ANKRD40Q6AI12 368 aa22.56■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 POTEDQ86YR6 584 aa22.56■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 FAM114A1Q8IWE2 563 aa22.56■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 PLIN4Q96Q06 1357 aa22.56■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 CPP00450 1065 aa22.56■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 COBLL1Q53SF7 1204 aa22.56■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa22.56■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 CALML4Q96GE6 196 aa22.56■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 NUP58Q9BVL2 599 aa22.56■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 TTYH3Q9C0H2 523 aa22.56■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 UBA5Q9GZZ9 404 aa22.56■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 HDAC9Q9UKV0 1011 aa22.56■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 USP14P54578 494 aa22.55■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 MEA1Q16626 185 aa22.55■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 MAP9Q49MG5 647 aa22.55■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 LRRC31Q6UY01 552 aa22.55■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 LDHDQ86WU2 507 aa22.55■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 TMEM260Q9NX78 707 aa22.55■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 PPFIA4O75335 1185 aa22.54■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 PDHBP11177 359 aa22.54■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 FCER1AP12319 257 aa22.54■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 RETREG2Q8NC44 543 aa22.54■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 HAUS4Q9H6D7 363 aa22.54■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 YY1AP1Q9H869 796 aa22.54■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 HERVK_113P62684 666 aa22.54■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 NBPF9Q3BBW0 867 aa22.54■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 CNNM4Q6P4Q7 775 aa22.54■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 MTMR9Q96QG7 549 aa22.54■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 SUGCTQ9HAC7 445 aa22.54■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 TRIM10Q9UDY6 481 aa22.54■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 GUCA1BQ9UMX6 200 aa22.54■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 RASSF10A6NK89 507 aa22.53■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 TFRCP02786 760 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP22.53■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa22.53■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 RHOXF2BP0C7M4 288 aa22.53■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 TXKP42681 527 aa22.53■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 GRB10Q13322 594 aa22.53■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 ASPRV1Q53RT3 343 aa22.53■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 KIAA0895Q8NCT3 520 aa22.53■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 RHOXF2Q9BQY4 288 aa22.53■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa22.53■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 MTMR4Q9NYA4 1195 aa22.53■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa22.53■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP22.52■■□□□ 1.22e-6■□□□□ 9.9
CCNDBP1-205ENST00000564630 KRT83P78385 493 aa22.52■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 CALCRLQ16602 461 aa22.52■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 MIIPQ5JXC2 388 aa22.52■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 CHADLQ6NUI6 762 aa22.52■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 SV2BQ7L1I2 683 aa22.52■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 PPM1EQ8WY54 764 aa22.52■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 EEF2KMTQ96G04 330 aa22.52■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 STK17AQ9UEE5 414 aa22.52■■□□□ 1.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.19
CCNDBP1-205ENST00000564630 WNT10BO00744 389 aa22.51■■□□□ 1.19
CCNDBP1-205ENST00000564630 KLK7P49862 253 aa22.51■■□□□ 1.19
CCNDBP1-205ENST00000564630 ADCY7P51828 1080 aa22.51■■□□□ 1.19
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZBED6P86452 979 aa22.51■■□□□ 1.19
CCNDBP1-205ENST00000564630 SMC1BQ8NDV3 1235 aa22.51■■□□□ 1.19
CCNDBP1-205ENST00000564630 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
CCNDBP1-205ENST00000564630 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa22.51■■□□□ 1.19
CCNDBP1-205ENST00000564630 LRWD1Q9UFC0 647 aa22.51■■□□□ 1.19
CCNDBP1-205ENST00000564630 SYF2O95926 243 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
CCNDBP1-205ENST00000564630 GABPAQ06546 454 aa22.51■■□□□ 1.19
CCNDBP1-205ENST00000564630 DLGAP5Q15398 846 aa22.51■■□□□ 1.19
CCNDBP1-205ENST00000564630 RUBCNQ92622 972 aa22.51■■□□□ 1.19
CCNDBP1-205ENST00000564630 CCDC102AQ96A19 550 aa22.51■■□□□ 1.19
CCNDBP1-205ENST00000564630 COA7Q96BR5 231 aa22.51■■□□□ 1.19
CCNDBP1-205ENST00000564630 ERGIC2Q96RQ1 377 aa22.51■■□□□ 1.19
CCNDBP1-205ENST00000564630 FAM107BQ9H098 131 aa22.51■■□□□ 1.19
CCNDBP1-205ENST00000564630 SEMA6BQ9H3T3 888 aa22.51■■□□□ 1.19
CCNDBP1-205ENST00000564630 FAM204AQ9H8W3 233 aa22.51■■□□□ 1.19
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
CCNDBP1-205ENST00000564630 GGA3Q9NZ52 723 aa22.51■■□□□ 1.19
CCNDBP1-205ENST00000564630 SNHG28P0DPA3 235 aa22.5■■□□□ 1.19
CCNDBP1-205ENST00000564630 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
CCNDBP1-205ENST00000564630 CRKP46108 304 aa22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72 ms