RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	SEMA3F	Q13275	785 aa		25.07	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200	RTN1	Q16799	776 aa		25.07	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		25.07	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		25.06	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		25.06	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200	HAS3	O00219	553 aa		25.06	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200	PPFIA4	O75335	1185 aa		25.06	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		25.06	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		25.06	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200	FBXL16	Q8N461	479 aa		25.06	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200	SPATA33	Q96N06	139 aa		25.06	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	25.06	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		25.06	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		25.05	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200	CDC27	P30260	824 aa		25.05	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200	HERVK_113	Q902F9	699 aa		25.05	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200	SCLY	Q96I15	445 aa		25.05	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200	GUCD1	Q96NT3	240 aa		25.05	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		25.05	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	25.05	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		25.05	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200	SCN5A	Q14524	2016 aa		25.05	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	25.04	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	25.04	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200	PITPNM1	O00562	1244 aa		25.04	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	25.04	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF286B	P0CG31	522 aa		25.04	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		25.04	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		25.04	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	25.04	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		25.04	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		25.04	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		25.04	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		25.03	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		25.03	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200	FIBP	O43427	364 aa		25.03	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200	SORBS3	O60504	671 aa		25.03	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200	PSEN2	P49810	448 aa		25.03	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200	CHMP4BP1	P59074	171 aa		25.03	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200	PTGIS	Q16647	500 aa		25.03	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		25.03	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200		Q6ZUG5	572 aa		25.03	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		25.03	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		25.03	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	25.03	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		25.03	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		25.03	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		25.03	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200	MFSD10	Q14728	455 aa		25.03	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200	UBE2S	Q16763	222 aa		25.03	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		25.03	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		25.03	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		25.03	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		25.03	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		25.03	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	25.03	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	25.03	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200	NID2	Q14112	1375 aa		25.02	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200	FGB	P02675	491 aa		25.02	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200	RPS6KB1	P23443	525 aa		25.02	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200	APOBR	Q0VD83	1088 aa		25.02	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200	NEDD9	Q14511	834 aa		25.02	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200	METTL7B	Q6UX53	244 aa		25.02	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	25.02	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM161B	Q96MY7	647 aa		25.02	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		25.02	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		25.02	■■□□□ 1.6
PPP4C-205	ENST00000563200	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		25.01	■■□□□ 1.59
PPP4C-205	ENST00000563200	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		25.01	■■□□□ 1.59
PPP4C-205	ENST00000563200	TET1	Q8NFU7	2136 aa		25.01	■■□□□ 1.59
PPP4C-205	ENST00000563200	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		25.01	■■□□□ 1.59
PPP4C-205	ENST00000563200	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		25.01	■■□□□ 1.59
PPP4C-205	ENST00000563200	BRF1	Q92994	677 aa		25.01	■■□□□ 1.59
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		25	■■□□□ 1.59
PPP4C-205	ENST00000563200	IQCF3	P0C7M6	154 aa		25	■■□□□ 1.59
PPP4C-205	ENST00000563200	ITGB5	P18084	799 aa		25	■■□□□ 1.59
PPP4C-205	ENST00000563200	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	25	■■□□□ 1.59
PPP4C-205	ENST00000563200	FGD1	P98174	961 aa		25	■■□□□ 1.59
PPP4C-205	ENST00000563200	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		25	■■□□□ 1.59
PPP4C-205	ENST00000563200	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		25	■■□□□ 1.59
PPP4C-205	ENST00000563200	C7orf31	Q8N865	590 aa		25	■■□□□ 1.59
PPP4C-205	ENST00000563200	ALG1	Q9BT22	464 aa		25	■■□□□ 1.59
PPP4C-205	ENST00000563200	USP26	Q9BXU7	913 aa		25	■■□□□ 1.59
PPP4C-205	ENST00000563200	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		25	■■□□□ 1.59
PPP4C-205	ENST00000563200	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		25	■■□□□ 1.59
PPP4C-205	ENST00000563200	NOD1	Q9Y239	953 aa		25	■■□□□ 1.59
PPP4C-205	ENST00000563200	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		25	■■□□□ 1.59
PPP4C-205	ENST00000563200	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		24.99	■■□□□ 1.59
PPP4C-205	ENST00000563200	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		24.99	■■□□□ 1.59
PPP4C-205	ENST00000563200	STXBP3	O00186	592 aa		24.99	■■□□□ 1.59
PPP4C-205	ENST00000563200	PFKM	P08237	780 aa		24.99	■■□□□ 1.59
PPP4C-205	ENST00000563200	DNAJB2	P25686	324 aa		24.99	■■□□□ 1.59
PPP4C-205	ENST00000563200	PSMA5	P28066	241 aa		24.99	■■□□□ 1.59
PPP4C-205	ENST00000563200	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	24.99	■■□□□ 1.59
PPP4C-205	ENST00000563200	RBL2	Q08999	1139 aa		24.99	■■□□□ 1.59
PPP4C-205	ENST00000563200	BFSP2	Q13515	415 aa		24.99	■■□□□ 1.59
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	24.99	■■□□□ 1.59
PPP4C-205	ENST00000563200	CAGE1	Q8TC20	777 aa		24.99	■■□□□ 1.59
PPP4C-205	ENST00000563200	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	24.99	■■□□□ 1.59
PPP4C-205	ENST00000563200	GPRASP2	Q96D09	838 aa		24.99	■■□□□ 1.59

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