RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561293.5

MEIS3-212, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene MEIS3, Length 1,918 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-212ENST00000561293 MAF1Q9H063 256 aa24.12■■□□□ 1.45
MEIS3-212ENST00000561293 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
MEIS3-212ENST00000561293 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa24.12■■□□□ 1.45
MEIS3-212ENST00000561293 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
MEIS3-212ENST00000561293 SEPT4O43236 478 aa24.12■■□□□ 1.45
MEIS3-212ENST00000561293 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
MEIS3-212ENST00000561293 KCNH7Q9NS40 1196 aa24.12■■□□□ 1.45
MEIS3-212ENST00000561293 AKR1A1P14550 325 aa24.11■■□□□ 1.45
MEIS3-212ENST00000561293 PDCP20941 246 aa24.11■■□□□ 1.45
MEIS3-212ENST00000561293 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
MEIS3-212ENST00000561293 ZNF174Q15697 407 aa24.11■■□□□ 1.45
MEIS3-212ENST00000561293 LHX8Q68G74 356 aa24.11■■□□□ 1.45
MEIS3-212ENST00000561293 PLA2G4DQ86XP0 818 aa24.11■■□□□ 1.45
MEIS3-212ENST00000561293 ABHD8Q96I13 439 aa24.11■■□□□ 1.45
MEIS3-212ENST00000561293 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
MEIS3-212ENST00000561293 FAM184BQ9ULE4 1060 aa24.11■■□□□ 1.45
MEIS3-212ENST00000561293 B4DLN1 442 aa24.1■■□□□ 1.45
MEIS3-212ENST00000561293 MCM7P33993 719 aa24.1■■□□□ 1.45
MEIS3-212ENST00000561293 BEX3Q00994 111 aa24.1■■□□□ 1.45
MEIS3-212ENST00000561293 CCDC62Q6P9F0 684 aa24.1■■□□□ 1.45
MEIS3-212ENST00000561293 POTEDQ86YR6 584 aa24.1■■□□□ 1.45
MEIS3-212ENST00000561293 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
MEIS3-212ENST00000561293 JADE2Q9NQC1 790 aa24.1■■□□□ 1.45
MEIS3-212ENST00000561293 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
MEIS3-212ENST00000561293 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
MEIS3-212ENST00000561293 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
MEIS3-212ENST00000561293 CYP3A4P08684 503 aa24.1■■□□□ 1.45
MEIS3-212ENST00000561293 SCFD2Q8WU76 684 aa24.1■■□□□ 1.45
MEIS3-212ENST00000561293 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa24.1■■□□□ 1.45
MEIS3-212ENST00000561293 ZDHHC9Q9Y397 364 aa24.1■■□□□ 1.45
MEIS3-212ENST00000561293 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa24.1■■□□□ 1.45
MEIS3-212ENST00000561293 MEIS1O00470 390 aa24.09■■□□□ 1.45
MEIS3-212ENST00000561293 RESTQ13127 1097 aa24.09■■□□□ 1.45
MEIS3-212ENST00000561293 CYFIP1Q7L576 1253 aa24.09■■□□□ 1.45
MEIS3-212ENST00000561293 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
MEIS3-212ENST00000561293 SOX10P56693 466 aa24.08■■□□□ 1.45
MEIS3-212ENST00000561293 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
MEIS3-212ENST00000561293 TTLL4Q14679 1199 aa24.08■■□□□ 1.45
MEIS3-212ENST00000561293 TLK2Q86UE8 772 aa24.08■■□□□ 1.45
MEIS3-212ENST00000561293 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
MEIS3-212ENST00000561293 CCDC85CA6NKD9 419 aa24.08■■□□□ 1.44
MEIS3-212ENST00000561293 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa24.08■■□□□ 1.44
MEIS3-212ENST00000561293 GGPS1O95749 300 aa24.08■■□□□ 1.44
MEIS3-212ENST00000561293 RARBP10826 455 aa24.08■■□□□ 1.44
MEIS3-212ENST00000561293 GNPTABQ3T906 1256 aa24.08■■□□□ 1.44
MEIS3-212ENST00000561293 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
MEIS3-212ENST00000561293 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa24.08■■□□□ 1.44
MEIS3-212ENST00000561293 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa24.08■■□□□ 1.44
MEIS3-212ENST00000561293 DOCK5Q9H7D0 1870 aa24.07■■□□□ 1.44
MEIS3-212ENST00000561293 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa24.07■■□□□ 1.44
MEIS3-212ENST00000561293 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa24.07■■□□□ 1.44
MEIS3-212ENST00000561293 MSH4O15457 936 aa24.07■■□□□ 1.44
MEIS3-212ENST00000561293 FIBPO43427 364 aa24.07■■□□□ 1.44
MEIS3-212ENST00000561293 USP11P51784 963 aa24.07■■□□□ 1.44
MEIS3-212ENST00000561293 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
MEIS3-212ENST00000561293 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
MEIS3-212ENST00000561293 DUSP28Q4G0W2 176 aa24.07■■□□□ 1.44
MEIS3-212ENST00000561293 NLRX1Q86UT6 975 aa24.07■■□□□ 1.44
MEIS3-212ENST00000561293 TMEM60Q9H2L4 133 aa24.07■■□□□ 1.44
MEIS3-212ENST00000561293 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
MEIS3-212ENST00000561293 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
MEIS3-212ENST00000561293 KCNA2P16389 499 aa24.06■■□□□ 1.44
MEIS3-212ENST00000561293 CIITAP33076 1130 aa24.06■■□□□ 1.44
MEIS3-212ENST00000561293 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
MEIS3-212ENST00000561293 EN2P19622 333 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
MEIS3-212ENST00000561293 HSDL1Q3SXM5 330 aa24.06■■□□□ 1.44
MEIS3-212ENST00000561293 TTC38Q5R3I4 469 aa24.06■■□□□ 1.44
MEIS3-212ENST00000561293 MCTP2Q6DN12 878 aa24.06■■□□□ 1.44
MEIS3-212ENST00000561293 IQSEC1Q6DN90 963 aa24.06■■□□□ 1.44
MEIS3-212ENST00000561293 XRRA1Q6P2D8 792 aa24.06■■□□□ 1.44
MEIS3-212ENST00000561293 OR6J1Q8NGC5 347 aa24.06■■□□□ 1.44
MEIS3-212ENST00000561293 GPRASP2Q96D09 838 aa24.06■■□□□ 1.44
MEIS3-212ENST00000561293 ZNF577Q9BSK1 485 aa24.06■■□□□ 1.44
MEIS3-212ENST00000561293 ARHGAP1Q07960 439 aa24.05■■□□□ 1.44
MEIS3-212ENST00000561293 AFG1LQ8WV93 481 aa24.05■■□□□ 1.44
MEIS3-212ENST00000561293 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa24.04■■□□□ 1.44
MEIS3-212ENST00000561293 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
MEIS3-212ENST00000561293 MYSM1Q5VVJ2 828 aa24.04■■□□□ 1.44
MEIS3-212ENST00000561293 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
MEIS3-212ENST00000561293 NRBP1Q9UHY1 535 aa24.04■■□□□ 1.44
MEIS3-212ENST00000561293 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
MEIS3-212ENST00000561293 CTAGE5O15320 804 aa24.04■■□□□ 1.44
MEIS3-212ENST00000561293 CHMP2AO43633 222 aa24.04■■□□□ 1.44
MEIS3-212ENST00000561293 STAM2O75886 525 aa24.04■■□□□ 1.44
MEIS3-212ENST00000561293 TFRCP02786 760 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
MEIS3-212ENST00000561293 ICAM3P32942 547 aa24.04■■□□□ 1.44
MEIS3-212ENST00000561293 TEX2Q8IWB9 1127 aa24.04■■□□□ 1.44
MEIS3-212ENST00000561293 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
MEIS3-212ENST00000561293 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
MEIS3-212ENST00000561293 CHMP4BP1P59074 171 aa24.03■■□□□ 1.44
MEIS3-212ENST00000561293 HAS1Q92839 578 aa24.03■■□□□ 1.44
MEIS3-212ENST00000561293 SPATA33Q96N06 139 aa24.03■■□□□ 1.44
MEIS3-212ENST00000561293 TMEM106CQ9BVX2 250 aa24.03■■□□□ 1.44
MEIS3-212ENST00000561293 MLXIPQ9HAP2 919 aa24.03■■□□□ 1.44
MEIS3-212ENST00000561293 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa24.02■■□□□ 1.44
MEIS3-212ENST00000561293 ADAMTS4O75173 837 aa24.02■■□□□ 1.44
MEIS3-212ENST00000561293 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
MEIS3-212ENST00000561293 F13A1P00488 732 aa24.02■■□□□ 1.44
MEIS3-212ENST00000561293 GJB1P08034 283 aa24.02■■□□□ 1.44
MEIS3-212ENST00000561293 CYP3A7P24462 503 aa24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.9 ms