RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554292.1

PCNX1-206, Transcript of pecanex 1, human

TSL 4

Gene PCNX1, Length 402 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCNX1-206	ENST00000554292	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		32.48	■■■□□ 2.79
PCNX1-206	ENST00000554292	GPRASP2	Q96D09	838 aa		32.48	■■■□□ 2.79
PCNX1-206	ENST00000554292	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	32.48	■■■□□ 2.79
PCNX1-206	ENST00000554292	TMEM260	Q9NX78	707 aa		32.48	■■■□□ 2.79
PCNX1-206	ENST00000554292		A6NJR5	290 aa		32.47	■■■□□ 2.79
PCNX1-206	ENST00000554292	CTDNEP1	O95476	244 aa		32.47	■■■□□ 2.79
PCNX1-206	ENST00000554292	SREBF1	P36956	1147 aa		32.47	■■■□□ 2.79
PCNX1-206	ENST00000554292	RTP1	P59025	263 aa		32.47	■■■□□ 2.79
PCNX1-206	ENST00000554292	ARHGAP1	Q07960	439 aa		32.47	■■■□□ 2.79
PCNX1-206	ENST00000554292	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		32.47	■■■□□ 2.79
PCNX1-206	ENST00000554292	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		32.46	■■■□□ 2.79
PCNX1-206	ENST00000554292	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	32.46	■■■□□ 2.79
PCNX1-206	ENST00000554292	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		32.46	■■■□□ 2.79
PCNX1-206	ENST00000554292	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	32.46	■■■□□ 2.79
PCNX1-206	ENST00000554292	PGBD1	Q96JS3	809 aa		32.46	■■■□□ 2.79
PCNX1-206	ENST00000554292		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	32.45	■■■□□ 2.79
PCNX1-206	ENST00000554292	GGPS1	O95749	300 aa		32.45	■■■□□ 2.79
PCNX1-206	ENST00000554292	NEDD9	Q14511	834 aa		32.45	■■■□□ 2.79
PCNX1-206	ENST00000554292	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	32.45	■■■□□ 2.79
PCNX1-206	ENST00000554292	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		32.45	■■■□□ 2.79
PCNX1-206	ENST00000554292	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		32.45	■■■□□ 2.79
PCNX1-206	ENST00000554292	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		32.45	■■■□□ 2.79
PCNX1-206	ENST00000554292	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		32.45	■■■□□ 2.79
PCNX1-206	ENST00000554292	ARHGAP4	P98171	946 aa		32.44	■■■□□ 2.78
PCNX1-206	ENST00000554292	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	32.44	■■■□□ 2.78
PCNX1-206	ENST00000554292	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		32.44	■■■□□ 2.78
PCNX1-206	ENST00000554292	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	32.44	■■■□□ 2.78
PCNX1-206	ENST00000554292	AFG1L	Q8WV93	481 aa		32.44	■■■□□ 2.78
PCNX1-206	ENST00000554292	AIFM3	Q96NN9	605 aa		32.44	■■■□□ 2.78
PCNX1-206	ENST00000554292	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		32.44	■■■□□ 2.78
PCNX1-206	ENST00000554292	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		32.44	■■■□□ 2.78
PCNX1-206	ENST00000554292	MAFG	O15525	162 aa		32.43	■■■□□ 2.78
PCNX1-206	ENST00000554292	MYL3	P08590	195 aa		32.43	■■■□□ 2.78
PCNX1-206	ENST00000554292	MTMR1	Q13613	665 aa		32.43	■■■□□ 2.78
PCNX1-206	ENST00000554292	PPTC7	Q8NI37	304 aa		32.43	■■■□□ 2.78
PCNX1-206	ENST00000554292	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		32.43	■■■□□ 2.78
PCNX1-206	ENST00000554292	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	32.43	■■■□□ 2.78
PCNX1-206	ENST00000554292	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	32.43	■■■□□ 2.78
PCNX1-206	ENST00000554292	ALG1	Q9BT22	464 aa		32.43	■■■□□ 2.78
PCNX1-206	ENST00000554292	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		32.43	■■■□□ 2.78
PCNX1-206	ENST00000554292	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		32.42	■■■□□ 2.78
PCNX1-206	ENST00000554292	MMP3	P08254	477 aa		32.42	■■■□□ 2.78
PCNX1-206	ENST00000554292	ITGB5	P18084	799 aa		32.42	■■■□□ 2.78
PCNX1-206	ENST00000554292	ZNF76	P36508	570 aa		32.42	■■■□□ 2.78
PCNX1-206	ENST00000554292	MCM2	P49736	904 aa		32.42	■■■□□ 2.78
PCNX1-206	ENST00000554292	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	32.42	■■■□□ 2.78
PCNX1-206	ENST00000554292	TRIM60	Q495X7	471 aa		32.42	■■■□□ 2.78
PCNX1-206	ENST00000554292	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		32.42	■■■□□ 2.78
PCNX1-206	ENST00000554292	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		32.42	■■■□□ 2.78
PCNX1-206	ENST00000554292	BLID	Q8IZY5	108 aa		32.42	■■■□□ 2.78
PCNX1-206	ENST00000554292	JADE2	Q9NQC1	790 aa		32.42	■■■□□ 2.78
PCNX1-206	ENST00000554292	SEMA3F	Q13275	785 aa		32.41	■■■□□ 2.78
PCNX1-206	ENST00000554292	DGKD	Q16760	1214 aa		32.41	■■■□□ 2.78
PCNX1-206	ENST00000554292	SPATA33	Q96N06	139 aa		32.41	■■■□□ 2.78
PCNX1-206	ENST00000554292	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		32.41	■■■□□ 2.78
PCNX1-206	ENST00000554292	SP2	Q02086	613 aa		32.4	■■■□□ 2.78
PCNX1-206	ENST00000554292	CEP55	Q53EZ4	464 aa		32.4	■■■□□ 2.78
PCNX1-206	ENST00000554292	METTL7B	Q6UX53	244 aa		32.4	■■■□□ 2.78
PCNX1-206	ENST00000554292	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		32.4	■■■□□ 2.78
PCNX1-206	ENST00000554292	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		32.4	■■■□□ 2.78
PCNX1-206	ENST00000554292		H0YGN5	161 aa		32.39	■■■□□ 2.78
PCNX1-206	ENST00000554292	ARVCF	O00192	962 aa		32.39	■■■□□ 2.78
PCNX1-206	ENST00000554292	CYP3A4	P08684	503 aa		32.39	■■■□□ 2.78
PCNX1-206	ENST00000554292	ST3GAL1	Q11201	340 aa		32.39	■■■□□ 2.78
PCNX1-206	ENST00000554292	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		32.39	■■■□□ 2.78
PCNX1-206	ENST00000554292	TOX2	Q96NM4	488 aa		32.39	■■■□□ 2.78
PCNX1-206	ENST00000554292	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		32.39	■■■□□ 2.78
PCNX1-206	ENST00000554292	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	32.38	■■■□□ 2.77
PCNX1-206	ENST00000554292	JAK2	O60674	1132 aa		32.38	■■■□□ 2.77
PCNX1-206	ENST00000554292	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	32.38	■■■□□ 2.77
PCNX1-206	ENST00000554292	TLE2	Q04725	743 aa		32.38	■■■□□ 2.77
PCNX1-206	ENST00000554292	ITGA7	Q13683	1181 aa		32.38	■■■□□ 2.77
PCNX1-206	ENST00000554292	TRIM29	Q14134	588 aa		32.38	■■■□□ 2.77
PCNX1-206	ENST00000554292	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		32.38	■■■□□ 2.77
PCNX1-206	ENST00000554292	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		32.38	■■■□□ 2.77
PCNX1-206	ENST00000554292	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		32.37	■■■□□ 2.77
PCNX1-206	ENST00000554292	ADAMTS3	O15072	1205 aa		32.37	■■■□□ 2.77
PCNX1-206	ENST00000554292	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	32.37	■■■□□ 2.77
PCNX1-206	ENST00000554292	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		32.37	■■■□□ 2.77
PCNX1-206	ENST00000554292	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		32.37	■■■□□ 2.77
PCNX1-206	ENST00000554292	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	32.36	■■■□□ 2.77
PCNX1-206	ENST00000554292	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	32.36	■■■□□ 2.77
PCNX1-206	ENST00000554292	PPFIA4	O75335	1185 aa		32.36	■■■□□ 2.77
PCNX1-206	ENST00000554292	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		32.36	■■■□□ 2.77
PCNX1-206	ENST00000554292	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		32.36	■■■□□ 2.77
PCNX1-206	ENST00000554292	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		32.36	■■■□□ 2.77
PCNX1-206	ENST00000554292	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		32.35	■■■□□ 2.77
PCNX1-206	ENST00000554292	MEIS1	O00470	390 aa		32.35	■■■□□ 2.77
PCNX1-206	ENST00000554292	SORBS3	O60504	671 aa		32.35	■■■□□ 2.77
PCNX1-206	ENST00000554292	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	32.35	■■■□□ 2.77
PCNX1-206	ENST00000554292	KCNA2	P16389	499 aa		32.35	■■■□□ 2.77
PCNX1-206	ENST00000554292	CDK7	P50613	346 aa		32.35	■■■□□ 2.77
PCNX1-206	ENST00000554292	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	32.35	■■■□□ 2.77
PCNX1-206	ENST00000554292	NPY5R	Q15761	445 aa		32.35	■■■□□ 2.77
PCNX1-206	ENST00000554292	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		32.35	■■■□□ 2.77
PCNX1-206	ENST00000554292	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		32.35	■■■□□ 2.77
PCNX1-206	ENST00000554292	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		32.35	■■■□□ 2.77
PCNX1-206	ENST00000554292	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	32.35	■■■□□ 2.77
PCNX1-206	ENST00000554292		M0R2N6	131 aa		32.34	■■■□□ 2.77
PCNX1-206	ENST00000554292	DTNB	O60941	627 aa		32.34	■■■□□ 2.77

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