RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548567.5

CS-212, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 3,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-212ENST00000548567 CUL5Q93034 780 aa8.65□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 PLIN2Q99541 437 aa8.65□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa8.65□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 RNPEPQ9H4A4 650 aa8.65□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 LCHNA4D1U4 455 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 ASB14A6NK59 587 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 ARP10275 920 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 CYP4A11Q02928 519 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 RNF20Q5VTR2 975 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 MCTP1Q6DN14 999 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 C16orf59Q7L2K0 433 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 DCAF4Q8WV16 495 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 ATP6V0A1Q93050 837 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 PDCD2LQ9BRP1 358 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 CNNM2Q9H8M5 875 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 ARHGEF15O94989 841 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 FOSL2P15408 326 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 NLRP5P59047 1200 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 SEC23AQ15436 765 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 APOA5Q6Q788 366 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 LRRC71Q8N4P6 559 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 USP38Q8NB14 1042 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 TTC16Q8NEE8 873 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 SCFD2Q8WU76 684 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 GDF15Q99988 308 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 HCSTQ9UBK5 93 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 SNX14Q9Y5W7 946 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 RRP9O43818 475 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 RGS20O76081 388 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 HOXC6P09630 235 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 COPB2P35606 906 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 FPGSQ05932 587 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 F5P12259 2224 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 PHIPQ8WWQ0 1821 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 JAK2O60674 1132 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 DEFB103AP81534 67 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 HIC1Q14526 733 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 LETM2Q2VYF4 491 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 WWC2Q6AWC2 1192 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 DBF4BQ8NFT6 615 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 DNAJB3Q8WWF6 145 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 GBP3Q9H0R5 595 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 PXMP2Q9NR77 195 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 H3BQ06 376 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 ZBTB39O15060 712 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 CDC25AP30304 524 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 GLYCTKQ8IVS8 523 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 OSBPL3Q9H4L5 887 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 ASPMQ8IZT6 3477 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 H3BRB1 525 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 ARVCFO00192 962 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 MSCO60682 206 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 LARGE1O95461 756 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 GATMP50440 423 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 NECTIN1Q15223 517 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 ALX1Q15699 326 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 ZNF697Q5TEC3 545 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP8.62□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 FGBP02675 491 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 RBM10P98175 930 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 PGM5Q15124 567 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 DUSP28Q4G0W2 176 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 CCDC83Q8IWF9 413 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 RETREG2Q8NC44 543 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 TTC14Q96N46 770 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 PBX4Q9BYU1 374 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 DOCK2Q92608 1830 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 NR5A1Q13285 461 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 INF2Q27J81 1249 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 KIZQ2M2Z5 673 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 ASPRV1Q53RT3 343 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 ZNF618Q5T7W0 954 aa8.61□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms