RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546248.5

TRDN-205, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-205ENST00000546248 GNAI1P63096 354 aa6.88□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 DCTN1Q14203 1278 aa6.88□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 ZPBP2Q6X784 338 aa6.88□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 CCDC81Q6ZN84 652 aa6.88□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 SKAP1Q86WV1 359 aa6.88□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 DAGLBQ8NCG7 672 aa6.88□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 CPLX3Q8WVH0 158 aa6.88□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 MAP6Q96JE9 813 aa6.88□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 FERD3LQ96RJ6 166 aa6.88□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP6.88□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 TANGO6Q9C0B7 1094 aa6.88□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 EHMT1Q9H9B1 1298 aa6.88□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 IFT57Q9NWB7 429 aa6.88□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 ZMYM5Q9UJ78 669 aa6.88□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 TCFL5Q9UL49 500 aa6.88□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa6.87□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa6.87□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa6.87□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 CHL1O00533 1208 aa6.87□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 NRDCO43847 1150 aa6.87□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 ATE1O95260 518 aa6.87□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 RAG1P15918 1043 aa6.87□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 CHMP4BP1P59074 171 aa6.87□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 RNF4P78317 190 aa6.87□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 NBPF9Q3BBW0 867 aa6.87□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 ALDH1L2Q3SY69 923 aa6.87□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 BBS9Q3SYG4 887 aa6.87□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa6.87□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.87□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 TSPYL6Q8N831 410 aa6.87□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 HHIPL1Q96JK4 782 aa6.87□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 KCNC2Q96PR1 638 aa6.87□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 GMLQ99445 158 aa6.87□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 MON2Q7Z3U7 1717 aa6.87□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 FLT4P35916 1363 aa6.86□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 IGSF1Q8N6C5 1336 aa6.86□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 FKTNO75072 461 aa6.86□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 PI3P19957 117 aa6.86□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 SDHBP21912 280 aa6.86□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 LMOD3Q0VAK6 560 aa6.86□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 ZNF385BQ569K4 471 aa6.86□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 OVOS1Q6IE37 1185 aa6.86□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 CEP128Q6ZU80 1094 aa6.86□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 MCF2L2Q86YR7 1114 aa6.86□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 C8orf58Q8NAV2 365 aa6.86□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 IP6K1Q92551 441 aa6.86□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 PLCD4Q9BRC7 762 aa6.86□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa6.86□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 ANTXR1Q9H6X2 564 aa6.86□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 SMC4Q9NTJ3 1288 aa6.86□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 MINPP1Q9UNW1 487 aa6.86□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 NRKQ7Z2Y5 1582 aa6.86□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 LRRC7Q96NW7 1537 aa6.86□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 LMTK3Q96Q04 1460 aa6.85□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 AKAP12Q02952 1782 aa6.85□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 ARHGEF10O15013 1369 aa6.85□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 KIF24Q5T7B8 1368 aa6.85□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 TRIM13O60858 407 aa6.85□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 SYPP08247 313 aa6.85□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 FGRP09769 529 aa6.85□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 TRIM27P14373 513 aa6.85□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 CANXP27824 592 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 HSPA2P54652 639 aa6.85□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 EPHB3P54753 998 aa6.85□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 MVPQ14764 893 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 SLC14A2Q15849 920 aa6.85□□□□□ -1.31
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TRDN-205ENST00000546248 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa6.85□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 KRT28Q7Z3Y7 464 aa6.85□□□□□ -1.31
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TRDN-205ENST00000546248 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 CRTAC1Q9NQ79 661 aa6.85□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 GMIPQ9P107 970 aa6.85□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 ZNRF3Q9ULT6 936 aa6.85□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 MRVI1Q9Y6F6 885 aa6.85□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 KIF20BQ96Q89 1820 aa6.85□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 KDRP35968 1356 aa6.84□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 HRKO00198 91 aa6.84□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
TRDN-205ENST00000546248 PRAMEF1O95521 474 aa6.84□□□□□ -1.31
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