RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546160.5

PDE4D-226, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 7,690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-226ENST00000546160 TRIM62Q9BVG3 475 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 M0R2C6 588 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 USP17L8P0C7I0 530 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 ELF1P32519 619 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 ADCY8P40145 1251 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 BFSP1Q12934 665 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 TRPV6Q9H1D0 765 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 HAUS4Q9H6D7 363 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 PPFIA4O75335 1185 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 TTC39CQ8N584 583 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 NLRC4Q9NPP4 1024 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 MYO3AQ8NEV4 1616 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 ESYT2A0FGR8 921 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 KIF3CO14782 793 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 LIFRP42702 1097 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 RCAN1P53805 252 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 USP17L2Q6R6M4 530 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 CCDC13Q8IYE1 715 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 SEPT12Q8IYM1 358 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 RNF139Q8WU17 664 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 SCYL1Q96KG9 808 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 TTC25Q96NG3 672 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 NDUFAB1O14561 156 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 ADORA1P30542 326 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 IGBP1P78318 339 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 MAN2A1Q16706 1144 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 PDXDC2PQ6P474 469 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 NME8Q8N427 588 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 CEP170P1Q96L14 293 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 VPS37BQ9H9H4 285 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 LRRC4Q9HBW1 653 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 RNF14Q9UBS8 474 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 MMP1P03956 469 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 GSTA1P08263 222 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 GSTA2P09210 222 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 PI4K2BQ8TCG2 481 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 PBKQ96KB5 322 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 SLF1Q9BQI6 1058 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 SEPT10Q9P0V9 454 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 CLRN2A0PK11 232 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 H2AFZP0C0S5 128 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 ECE1P42892 770 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 LRMPQ12912 555 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 SEPT6Q14141 434 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 H2AFVQ71UI9 128 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 CCDC170Q8IYT3 715 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 NEK9Q8TD19 979 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 BRIP1Q9BX63 1249 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 LMBRD1Q9NUN5 540 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 COL15A1P39059 1388 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 STAG1Q8WVM7 1258 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 VCX3AQ9NNX9 186 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 EPS15L1Q9UBC2 864 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 NARFQ9UHQ1 456 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 SLC26A4O43511 780 aa6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 PAMP19021 973 aa6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 NR2F2P24468 414 aa6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 MECOMQ03112 1051 aa6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 PPP2R5CQ13362 524 aa6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 APOA5Q6Q788 366 aa6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 KLHL7Q8IXQ5 586 aa6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 FAM186BQ8IYM0 893 aa6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 RWDD2AQ9UIY3 292 aa6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 ABCB4P21439 1286 aa6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 ADD1P35611 737 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 CDC42EP1Q00587 391 aa6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 PTH1RQ03431 593 aa6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 SLC39A14Q15043 492 aa6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 RNF207Q6ZRF8 634 aa6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 PODNQ7Z5L7 613 aa6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 MXD3Q9BW11 206 aa6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 DBNDD1Q9H9R9 158 aa6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 BAG5Q9UL15 447 aa6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 PALD1Q9ULE6 856 aa6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 STK36Q9NRP7 1315 aa6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 WDR64B1ANS9 1081 aa6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 KCNQ3O43525 872 aa6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-226ENST00000546160 CDK8P49336 464 aa6.94□□□□□ -1.3
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