RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533897.1

CTSC-208, Transcript of cathepsin C, human

TSL 2

Gene CTSC, Length 4,344 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTSC-208	ENST00000533897	STIM2	Q9P246	746 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	PAEP	P09466	180 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	CDK8	P49336	464 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	MMP14	P50281	582 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	GPS2	Q13227	327 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	TRADD	Q15628	312 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	TNFAIP8L3	Q5GJ75	292 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	SMIM5	Q71RC9	77 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	ZIM3	Q96PE6	472 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	CPVL	Q9H3G5	476 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	RLF	Q13129	1914 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	KLRF2	D3W0D1	207 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	RPS6KA4	O75676	772 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	PRKCI	P41743	596 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	EPHB4	P54760	987 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	PDE4D	Q08499	809 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	TCEAL1	Q15170	157 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	SWT1	Q5T5J6	900 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	CNPY4	Q8N129	248 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	TBCK	Q8TEA7	893 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	SCFD1	Q8WVM8	642 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	TRIM47	Q96LD4	638 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	TSPY2	A6NKD2	308 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	NCK2	O43639	380 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	TDP2	O95551	362 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	TCP1	P17987	556 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	PPFIA1	Q13136	1202 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	NFIX	Q14938	502 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	SEPT2	Q15019	361 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	NFIL3	Q16649	462 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	GBP6	Q6ZN66	633 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	CEP95	Q96GE4	821 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	CEP63	Q96MT8	703 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	FIZ1	Q96SL8	496 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	RNF14	Q9UBS8	474 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	HYOU1	Q9Y4L1	999 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	C5orf60	A6NFR6	353 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	ZSCAN5C	A6NGD5	496 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	GOLGA8K	D6RF30	607 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	IDE	P14735	1019 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	POLD1	P28340	1107 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	TEC	P42680	631 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	APBA1	Q02410	837 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	COASY	Q13057	564 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	DDB1	Q16531	1140 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	SLC18A3	Q16572	532 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	DGCR8	Q8WYQ5	773 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	MS4A14	Q96JA4	679 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	STRA6	Q9BX79	667 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	NEUROG2	Q9H2A3	272 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	TOMM22	Q9NS69	142 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	SMCO2	A6NFE2	343 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	USP17L5	A8MUK1	530 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	OPLAH	O14841	1288 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	FSBP	O95073	299 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	DDX12P	Q92771	950 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	PIGS	Q96S52	555 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	SWAP70	Q9UH65	585 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms