RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530579.6

NEDD8-MDP1-201, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 2

Gene NEDD8-MDP1, Length 471 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GPR25O00155 361 aa9.6□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MAFGO15525 162 aa9.6□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TRAK2O60296 914 aa9.6□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GAS7O60861 476 aa9.6□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MBD3O95983 291 aa9.6□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CMA1P23946 247 aa9.6□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 UBA7P41226 1012 aa9.6□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP9.6□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LRCH2Q5VUJ6 765 aa9.6□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RESP18Q5W5W9 173 aa9.6□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SHC4Q6S5L8 630 aa9.6□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RASSF8Q8NHQ8 419 aa9.6□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NPLOC4Q8TAT6 608 aa9.6□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ETNPPLQ8TBG4 499 aa9.6□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SOCS4Q8WXH5 440 aa9.6□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC5A5Q92911 643 aa9.6□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GPRASP2Q96D09 838 aa9.6□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MAML3Q96JK9 1138 aa9.6□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CDHR1Q96JP9 859 aa9.6□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TRIM47Q96LD4 638 aa9.6□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FGD4Q96M96 766 aa9.6□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TEKT3Q9BXF9 490 aa9.6□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PANK2Q9BZ23 570 aa9.6□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa9.6□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TBC1D22BQ9NU19 505 aa9.6□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SAGE1Q9NXZ1 904 aa9.6□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LRWD1Q9UFC0 647 aa9.6□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GJD2Q9UKL4 321 aa9.6□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PP2D1A8MPX8 630 aa9.59□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa9.59□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CHMP2AO43633 222 aa9.59□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FKTNO75072 461 aa9.59□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 EDNRBP24530 442 aa9.59□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HOXD10P28358 340 aa9.59□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CTGFP29279 349 aa9.59□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CDC25AP30304 524 aa9.59□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TXLNAP40222 546 aa9.59□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PDIA5Q14554 519 aa9.59□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ARHGEF6Q15052 776 aa9.59□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NCAPH2Q6IBW4 605 aa9.59□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 USP49Q70CQ1 688 aa9.59□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ARMCX2Q7L311 632 aa9.59□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CD99L2Q8TCZ2 262 aa9.59□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GPT2Q8TD30 523 aa9.59□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 EPSTI1Q96J88 318 aa9.59□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AK8Q96MA6 479 aa9.59□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RIT2Q99578 217 aa9.59□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SDF4Q9BRK5 362 aa9.59□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TINF2Q9BSI4 451 aa9.59□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa9.59□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa9.59□□□□□ -0.87
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PARP14Q460N5 1801 aa9.59□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SORBS3O60504 671 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ATP9AO75110 1047 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PSMD10O75832 226 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RGS20O76081 388 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HOXC6P09630 235 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PFKFB1P16118 471 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LIG1P18858 919 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ICAM3P32942 547 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NDUFA8P51970 172 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KRT79Q5XKE5 535 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KCNV1Q6PIU1 500 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OTOP1Q7RTM1 612 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CABP7Q86V35 215 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGSF22Q8N9C0 903 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ERMNQ8TAM6 284 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MORC4Q8TE76 937 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 USP6NLQ92738 828 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ERO1AQ96HE7 468 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 APBA2Q99767 749 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CCDC39Q9UFE4 941 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TSKSQ9UJT2 592 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KCNH3Q9ULD8 1083 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GABRQQ9UN88 632 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 POTEMA6NI47 508 aa9.57□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KINO60870 393 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TGFB3P10600 412 aa9.57□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SYKP43405 635 aa9.57□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FLT3LGP49771 235 aa9.57□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PRKCZQ05513 592 aa9.57□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM160A1Q05DH4 1040 aa9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms