RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530005.5

SLC43A3-217, Transcript of solute carrier family 43 member 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SLC43A3, Length 1,434 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC43A3-217ENST00000530005 PCDHA6Q9UN73 950 aa22.23■■□□□ 1.15
SLC43A3-217ENST00000530005 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa22.23■■□□□ 1.15
SLC43A3-217ENST00000530005 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa22.22■■□□□ 1.15
SLC43A3-217ENST00000530005 CCT2P78371 535 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SLC43A3-217ENST00000530005 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SLC43A3-217ENST00000530005 TDHQ8IZJ6 230 aa22.22■■□□□ 1.15
SLC43A3-217ENST00000530005 KAT2BQ92831 832 aa22.22■■□□□ 1.15
SLC43A3-217ENST00000530005 PHKBQ93100 1093 aa22.22■■□□□ 1.15
SLC43A3-217ENST00000530005 BCAS3Q9H6U6 928 aa22.22■■□□□ 1.15
SLC43A3-217ENST00000530005 B4GALT4O60513 344 aa22.21■■□□□ 1.15
SLC43A3-217ENST00000530005 GGPS1O95749 300 aa22.21■■□□□ 1.15
SLC43A3-217ENST00000530005 CLK2P49760 499 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SLC43A3-217ENST00000530005 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SLC43A3-217ENST00000530005 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SLC43A3-217ENST00000530005 SMCO2A6NFE2 343 aa22.2■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 FIBPO43427 364 aa22.2■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 RAG1P15918 1043 aa22.2■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 ITGB5P18084 799 aa22.2■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 ADCY7P51828 1080 aa22.2■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 NBPF20Q3BBV1 942 aa22.2■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 HSDL1Q3SXM5 330 aa22.2■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 GNPTABQ3T906 1256 aa22.2■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 TRPV6Q9H1D0 765 aa22.2■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 ESYT2A0FGR8 921 aa22.19■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 SPDYE3A6NKU9 549 aa22.19■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 ADAMTS3O15072 1205 aa22.19■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 TLR3O15455 904 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 PPFIA3O75145 1194 aa22.19■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 TIMP1P01033 207 aa22.19■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 DGKDQ16760 1214 aa22.19■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 C8orf34Q49A92 452 aa22.19■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 NFRKBQ6P4R8 1299 aa22.19■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 ZMYND12Q9H0C1 365 aa22.19■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa22.19■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 EPHB4P54760 987 aa22.18■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa22.18■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 SPATA33Q96N06 139 aa22.18■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 SLC26A6Q9BXS9 759 aa22.18■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 GLT8D2Q9H1C3 349 aa22.18■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 DOCK5Q9H7D0 1870 aa22.18■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 SORBS3O60504 671 aa22.17■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 F2P00734 622 aa22.17■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 FOSP01100 380 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 GPRASP2Q96D09 838 aa22.17■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 SENP7Q9BQF6 1050 aa22.17■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 ANO3Q9BYT9 981 aa22.17■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 TMEM260Q9NX78 707 aa22.17■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 HAS3O00219 553 aa22.16■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 PPFIA4O75335 1185 aa22.16■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 LRIT3Q3SXY7 679 aa22.16■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 MFSD5Q6N075 450 aa22.16■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 METTL7BQ6UX53 244 aa22.16■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 SESTD1Q86VW0 696 aa22.16■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 PGBD1Q96JS3 809 aa22.16■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 TPCN1Q9ULQ1 816 aa22.16■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 ATP9AO75110 1047 aa22.15■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 SLC34A2O95436 690 aa22.15■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 KCNA2P16389 499 aa22.15■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 SREBF1P36956 1147 aa22.15■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 STK3Q13188 491 aa22.15■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 AP3B2Q13367 1082 aa22.15■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 NEDD9Q14511 834 aa22.15■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 NLRX1Q86UT6 975 aa22.15■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 MLXIPQ9HAP2 919 aa22.15■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 JADE2Q9NQC1 790 aa22.15■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 TELO2Q9Y4R8 837 aa22.15■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 UMODL1Q5DID0 1318 aa22.15■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 ZNF286BP0CG31 522 aa22.14■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 AK2P54819 239 aa22.14■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 SCRN1Q12765 414 aa22.14■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 SHHQ15465 462 aa22.14■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 C9orf50Q5SZB4 431 aa22.14■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 CYFIP1Q7L576 1253 aa22.14■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 CRYGNQ8WXF5 182 aa22.14■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 CTAGE1Q96RT6 745 aa22.14■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 C16orf70Q9BSU1 422 aa22.14■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa22.14■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 HIPK3Q9H422 1215 aa22.14■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 EHMT1Q9H9B1 1298 aa22.14■■□□□ 1.14
SLC43A3-217ENST00000530005 CYP2C18P33260 490 aa22.14■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 PSEN2P49810 448 aa22.14■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 FPGSQ05932 587 aa22.14■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 CYP2W1Q8TAV3 490 aa22.14■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 CDHR1Q96JP9 859 aa22.14■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 GPR20Q99678 358 aa22.14■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 PFKFB2O60825 505 aa22.13■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa22.13■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 CYP2C9P11712 490 aa22.13■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 MTMR1Q13613 665 aa22.13■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 FAM47CQ5HY64 1035 aa22.13■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa22.13■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 MXRA8Q9BRK3 442 aa22.13■■□□□ 1.13
SLC43A3-217ENST00000530005 WNT8AQ9H1J5 351 aa22.13■■□□□ 1.13
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