RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-205ENST00000514178 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 NXNQ6DKJ4 435 aa10.21□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 OSTM1Q86WC4 334 aa10.21□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF281Q9Y2X9 895 aa10.21□□□□□ -0.77
PGGT1B-205ENST00000514178 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
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PGGT1B-205ENST00000514178 RFPL1O75677 317 aa10.2□□□□□ -0.78
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PGGT1B-205ENST00000514178 NETO1Q8TDF5 533 aa10.2□□□□□ -0.78
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PGGT1B-205ENST00000514178 SNX11Q9Y5W9 270 aa10.2□□□□□ -0.78
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PGGT1B-205ENST00000514178 SLC12A8A0AV02 714 aa10.19□□□□□ -0.78
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PGGT1B-205ENST00000514178 GNAT1P11488 350 aa10.19□□□□□ -0.78
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PGGT1B-205ENST00000514178 MLC1Q15049 377 aa10.19□□□□□ -0.78
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PGGT1B-205ENST00000514178 SLC13A1Q9BZW2 595 aa10.19□□□□□ -0.78
PGGT1B-205ENST00000514178 MARCH2Q9P0N8 246 aa10.19□□□□□ -0.78
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PGGT1B-205ENST00000514178 ADGRE2Q9UHX3 823 aa10.19□□□□□ -0.78
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PGGT1B-205ENST00000514178 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa10.19□□□□□ -0.78
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PGGT1B-205ENST00000514178 RGL3Q3MIN7 710 aa10.18□□□□□ -0.78
PGGT1B-205ENST00000514178 FSTL4Q6MZW2 842 aa10.18□□□□□ -0.78
PGGT1B-205ENST00000514178 CERS3Q8IU89 383 aa10.18□□□□□ -0.78
PGGT1B-205ENST00000514178 MAGEB6Q8N7X4 407 aa10.18□□□□□ -0.78
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PGGT1B-205ENST00000514178 PSMD1Q99460 953 aa10.18□□□□□ -0.78
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PGGT1B-205ENST00000514178 TERF2Q15554 542 aa10.17□□□□□ -0.78
PGGT1B-205ENST00000514178 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
PGGT1B-205ENST00000514178 HHIPL2Q6UWX4 724 aa10.17□□□□□ -0.78
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PGGT1B-205ENST00000514178 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
PGGT1B-205ENST00000514178 SPO11Q9Y5K1 396 aa10.17□□□□□ -0.78
PGGT1B-205ENST00000514178 PLEKHD1A6NEE1 506 aa10.16□□□□□ -0.78
PGGT1B-205ENST00000514178 DVL2O14641 736 aa10.16□□□□□ -0.78
PGGT1B-205ENST00000514178 CYP26A1O43174 497 aa10.16□□□□□ -0.78
PGGT1B-205ENST00000514178 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
PGGT1B-205ENST00000514178 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
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PGGT1B-205ENST00000514178 CCND1P24385 295 aa10.16□□□□□ -0.78
PGGT1B-205ENST00000514178 RHBDL3P58872 404 aa10.16□□□□□ -0.78
PGGT1B-205ENST00000514178 SPIRE1Q08AE8 756 aa10.16□□□□□ -0.78
PGGT1B-205ENST00000514178 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP10.16□□□□□ -0.78
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PGGT1B-205ENST00000514178 PMM1Q92871 262 aa10.16□□□□□ -0.78
PGGT1B-205ENST00000514178 TPSG1Q9NRR2 321 aa10.16□□□□□ -0.78
PGGT1B-205ENST00000514178 C22orf46C9J442 243 aa10.15□□□□□ -0.78
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PGGT1B-205ENST00000514178 GSC2O15499 205 aa10.15□□□□□ -0.78
PGGT1B-205ENST00000514178 KRT18P05783 430 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
PGGT1B-205ENST00000514178 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF174Q15697 407 aa10.15□□□□□ -0.78
PGGT1B-205ENST00000514178 NOSTRINQ8IVI9 506 aa10.15□□□□□ -0.78
PGGT1B-205ENST00000514178 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
PGGT1B-205ENST00000514178 EPB41L1Q9H4G0 881 aa10.15□□□□□ -0.78
PGGT1B-205ENST00000514178 TCF7L1Q9HCS4 588 aa10.15□□□□□ -0.78
PGGT1B-205ENST00000514178 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa10.15□□□□□ -0.78
PGGT1B-205ENST00000514178 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
PGGT1B-205ENST00000514178 X6R8D5 127 aa10.15□□□□□ -0.78
PGGT1B-205ENST00000514178 GOLGA6CA6NDK9 693 aa10.14□□□□□ -0.79
PGGT1B-205ENST00000514178 GOLGA6BA6NDN3 693 aa10.14□□□□□ -0.79
PGGT1B-205ENST00000514178 MAN2B1O00754 1011 aa10.14□□□□□ -0.79
PGGT1B-205ENST00000514178 GOLGA6DP0CG33 693 aa10.14□□□□□ -0.79
PGGT1B-205ENST00000514178 FSTP19883 344 aa10.14□□□□□ -0.79
PGGT1B-205ENST00000514178 PHC1P78364 1004 aa10.14□□□□□ -0.79
PGGT1B-205ENST00000514178 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
PGGT1B-205ENST00000514178 TCIRG1Q13488 830 aa10.14□□□□□ -0.79
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