RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495292.1

FAM107B-227, Transcript of family with sequence similarity 107 member B, human

TSL 4

Gene FAM107B, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM107B-227	ENST00000495292	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		7.58	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		7.58	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		7.58	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		7.58	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	SCN5A	Q14524	2016 aa		7.57	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	KPNA6	O60684	536 aa		7.57	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	CD4	P01730	458 aa		7.57	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	EDNRB	P24530	442 aa		7.57	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	ITGB8	P26012	769 aa		7.57	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	CALML3	P27482	149 aa		7.57	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	CLCN1	P35523	988 aa		7.57	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	MMP16	P51512	607 aa		7.57	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	PDE4D	Q08499	809 aa		7.57	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	ITGA7	Q13683	1181 aa		7.57	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	PPP2R5B	Q15173	497 aa		7.57	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	PKDCC	Q504Y2	493 aa		7.57	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		7.57	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		7.57	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292		Q7L0L9	218 aa		7.57	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		7.57	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		7.57	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		7.57	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	SCFD2	Q8WU76	684 aa		7.57	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	REPIN1	Q9BWE0	567 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		7.57	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		7.57	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	7.56	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	ERICH2	A1L162	156 aa		7.56	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	HOXA2	O43364	376 aa		7.56	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	7.56	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	PFKM	P08237	780 aa		7.56	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		7.56	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		7.56	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	7.56	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	BEX3	Q00994	111 aa		7.56	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	TTLL4	Q14679	1199 aa		7.56	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	7.56	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	USH1G	Q495M9	461 aa		7.56	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	FBXO11	Q86XK2	927 aa		7.56	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		7.56	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		7.56	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		7.56	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	7.56	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	HLA-C	Q95604	372 aa		7.56	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	IWS1	Q96ST2	819 aa		7.56	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		7.56	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	7.56	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	KAT6A	Q92794	2004 aa		7.56	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		7.55	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		7.55	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	CHML	P26374	656 aa		7.55	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	GHRHR	Q02643	423 aa		7.55	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	FOXC1	Q12948	553 aa		7.55	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	SEC23A	Q15436	765 aa		7.55	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		7.55	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	ZNF787	Q6DD87	383 aa		7.55	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		7.55	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	NCOA7	Q8NI08	942 aa		7.55	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	GUCD1	Q96NT3	240 aa		7.55	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	AMN	Q9BXJ7	453 aa		7.55	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		7.55	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	HIPK3	Q9H422	1215 aa		7.55	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	FAM187A	A6NFU0	413 aa		7.54	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292		A6NJR5	290 aa		7.54	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	KLRF2	D3W0D1	207 aa		7.54	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	ZBTB5	O15062	677 aa		7.54	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	SGSM2	O43147	1006 aa		7.54	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	B4GALT4	O60513	344 aa		7.54	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	ZMYND10	O75800	440 aa		7.54	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	CYP21A2	P08686	494 aa		7.54	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	CSF2RA	P15509	400 aa		7.54	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	HSD17B4	P51659	736 aa		7.54	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	EPHB4	P54760	987 aa		7.54	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	WTAP	Q15007	396 aa		7.54	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	STXBP2	Q15833	593 aa		7.54	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	TMEM240	Q5SV17	173 aa		7.54	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	RASIP1	Q5U651	963 aa		7.54	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		7.54	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
FAM107B-227	ENST00000495292	MTMR8	Q96EF0	704 aa		7.54	□□□□□ -1.2

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