RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490914.1

SSB-211, Transcript of Sjogren syndrome antigen B, humanhuman

TSL 5

Gene SSB, Length 754 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSB-211ENST00000490914 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SSB-211ENST00000490914 MCTP2Q6DN12 878 aa7.13□□□□□ -1.27
SSB-211ENST00000490914 EEPD1Q7L9B9 569 aa7.13□□□□□ -1.27
SSB-211ENST00000490914 TTLL6Q8N841 843 aa7.13□□□□□ -1.27
SSB-211ENST00000490914 ST7Q9NRC1 585 aa7.13□□□□□ -1.27
SSB-211ENST00000490914 CLDND1Q9NY35 253 aa7.13□□□□□ -1.27
SSB-211ENST00000490914 A0A1W2PQU0 124 aa7.12□□□□□ -1.27
SSB-211ENST00000490914 TCRBV5S2A0A599 114 aa7.12□□□□□ -1.27
SSB-211ENST00000490914 H7BY64 318 aa7.12□□□□□ -1.27
SSB-211ENST00000490914 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
SSB-211ENST00000490914 ARID5AQ03989 594 aa7.12□□□□□ -1.27
SSB-211ENST00000490914 STEAP3Q658P3 488 aa7.12□□□□□ -1.27
SSB-211ENST00000490914 ZSWIM3Q96MP5 696 aa7.12□□□□□ -1.27
SSB-211ENST00000490914 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
SSB-211ENST00000490914 YIPF4Q9BSR8 244 aa7.12□□□□□ -1.27
SSB-211ENST00000490914 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SSB-211ENST00000490914 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa7.12□□□□□ -1.27
SSB-211ENST00000490914 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa7.12□□□□□ -1.27
SSB-211ENST00000490914 HGSO14964 777 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
SSB-211ENST00000490914 TADA3O75528 432 aa7.11□□□□□ -1.27
SSB-211ENST00000490914 ITGB3P05106 788 aa7.11□□□□□ -1.27
SSB-211ENST00000490914 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
SSB-211ENST00000490914 ZNF827Q17R98 1081 aa7.11□□□□□ -1.27
SSB-211ENST00000490914 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
SSB-211ENST00000490914 EMC4Q5J8M3 183 aa7.11□□□□□ -1.27
SSB-211ENST00000490914 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
SSB-211ENST00000490914 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP7.11□□□□□ -1.27
SSB-211ENST00000490914 CDIP1Q9H305 208 aa7.11□□□□□ -1.27
SSB-211ENST00000490914 DTLQ9NZJ0 730 aa7.11□□□□□ -1.27
SSB-211ENST00000490914 WASF3Q9UPY6 502 aa7.11□□□□□ -1.27
SSB-211ENST00000490914 MSCO60682 206 aa7.1□□□□□ -1.27
SSB-211ENST00000490914 INSRRP14616 1297 aa7.1□□□□□ -1.27
SSB-211ENST00000490914 NKX3-2P78367 333 aa7.1□□□□□ -1.27
SSB-211ENST00000490914 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
SSB-211ENST00000490914 FAM26FQ5R3K3 315 aa7.1□□□□□ -1.27
SSB-211ENST00000490914 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
SSB-211ENST00000490914 GPR20Q99678 358 aa7.1□□□□□ -1.27
SSB-211ENST00000490914 IER2Q9BTL4 223 aa7.1□□□□□ -1.27
SSB-211ENST00000490914 EPN3Q9H201 632 aa7.1□□□□□ -1.27
SSB-211ENST00000490914 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
SSB-211ENST00000490914 MROH6A6NGR9 719 aa7.09□□□□□ -1.27
SSB-211ENST00000490914 DLX3O60479 287 aa7.09□□□□□ -1.27
SSB-211ENST00000490914 ZNF28P17035 718 aa7.09□□□□□ -1.27
SSB-211ENST00000490914 MAP4K2Q12851 820 aa7.09□□□□□ -1.27
SSB-211ENST00000490914 CHRNA2Q15822 529 aa7.09□□□□□ -1.27
SSB-211ENST00000490914 TEPPQ6URK8 271 aa7.09□□□□□ -1.27
SSB-211ENST00000490914 ANKS3Q6ZW76 656 aa7.09□□□□□ -1.27
SSB-211ENST00000490914 KCTD13Q8WZ19 329 aa7.09□□□□□ -1.27
SSB-211ENST00000490914 EPB41L1Q9H4G0 881 aa7.09□□□□□ -1.27
SSB-211ENST00000490914 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
SSB-211ENST00000490914 INVSQ9Y283 1065 aa7.09□□□□□ -1.27
SSB-211ENST00000490914 AGRPO00253 132 aa7.08□□□□□ -1.28
SSB-211ENST00000490914 DGKIO75912 1065 aa7.08□□□□□ -1.28
SSB-211ENST00000490914 LRG1P02750 347 aa7.08□□□□□ -1.28
SSB-211ENST00000490914 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP7.08□□□□□ -1.28
SSB-211ENST00000490914 DDR2Q16832 855 aa7.08□□□□□ -1.28
SSB-211ENST00000490914 JAM3Q9BX67 310 aa7.08□□□□□ -1.28
SSB-211ENST00000490914 MYOTQ9UBF9 498 aa7.08□□□□□ -1.28
SSB-211ENST00000490914 RBPJLQ9UBG7 517 aa7.08□□□□□ -1.28
SSB-211ENST00000490914 PLATP00750 562 aa7.07□□□□□ -1.28
SSB-211ENST00000490914 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
SSB-211ENST00000490914 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
SSB-211ENST00000490914 KIAA2012Q0VF49 1180 aa7.07□□□□□ -1.28
SSB-211ENST00000490914 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa7.07□□□□□ -1.28
SSB-211ENST00000490914 USP53Q70EK8 1073 aa7.07□□□□□ -1.28
SSB-211ENST00000490914 PHF20Q9BVI0 1012 aa7.07□□□□□ -1.28
SSB-211ENST00000490914 SMPD4Q9NXE4 827 aa7.07□□□□□ -1.28
SSB-211ENST00000490914 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
SSB-211ENST00000490914 KLF4O43474 513 aa7.06□□□□□ -1.28
SSB-211ENST00000490914 ADAM17P78536 824 aa7.06□□□□□ -1.28
SSB-211ENST00000490914 TMC5Q6UXY8 1006 aa7.06□□□□□ -1.28
SSB-211ENST00000490914 LGI4Q8N135 537 aa7.06□□□□□ -1.28
SSB-211ENST00000490914 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa7.06□□□□□ -1.28
SSB-211ENST00000490914 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa7.06□□□□□ -1.28
SSB-211ENST00000490914 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa7.06□□□□□ -1.28
SSB-211ENST00000490914 SMOC1Q9H4F8 434 aa7.06□□□□□ -1.28
SSB-211ENST00000490914 GPR27Q9NS67 375 aa7.06□□□□□ -1.28
SSB-211ENST00000490914 ASH2LQ9UBL3 628 aa7.06□□□□□ -1.28
SSB-211ENST00000490914 B4GALT3O60512 393 aa7.05□□□□□ -1.28
SSB-211ENST00000490914 BORAQ6PGQ7 559 aa7.05□□□□□ -1.28
SSB-211ENST00000490914 KCNT2Q6UVM3 1135 aa7.05□□□□□ -1.28
SSB-211ENST00000490914 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
SSB-211ENST00000490914 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
SSB-211ENST00000490914 MBD6Q96DN6 1003 aa7.05□□□□□ -1.28
SSB-211ENST00000490914 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
SSB-211ENST00000490914 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
SSB-211ENST00000490914 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
SSB-211ENST00000490914 ARHGEF4Q9NR80 690 aa7.05□□□□□ -1.28
SSB-211ENST00000490914 CROTQ9UKG9 612 aa7.05□□□□□ -1.28
SSB-211ENST00000490914 MYRFQ9Y2G1 1151 aa7.05□□□□□ -1.28
SSB-211ENST00000490914 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
SSB-211ENST00000490914 SLC27A2O14975 620 aa7.04□□□□□ -1.28
SSB-211ENST00000490914 IL13P35225 146 aa7.04□□□□□ -1.28
SSB-211ENST00000490914 GRIN1Q05586 938 aa7.04□□□□□ -1.28
SSB-211ENST00000490914 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
SSB-211ENST00000490914 NTRK3Q16288 839 aa7.04□□□□□ -1.28
SSB-211ENST00000490914 FAM124AQ86V42 546 aa7.04□□□□□ -1.28
SSB-211ENST00000490914 PROSER1Q86XN7 944 aa7.04□□□□□ -1.28
SSB-211ENST00000490914 SLC43A3Q8NBI5 491 aa7.04□□□□□ -1.28
SSB-211ENST00000490914 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa7.04□□□□□ -1.28
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