RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	MASTL	Q96GX5	879 aa		6.43	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	6.43	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	MAP3K14	Q99558	947 aa		6.43	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		6.43	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	MRI	Q9BWK5	157 aa		6.43	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	6.43	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	COA1	Q9GZY4	146 aa		6.43	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	6.43	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	CHRD	Q9H2X0	955 aa		6.43	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		6.43	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	6.43	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	POLL	Q9UGP5	575 aa		6.43	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		6.42	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		6.42	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A1W2PQ27	194 aa		6.42	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A1W2PQ64	194 aa		6.42	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A1W2PQD8	194 aa		6.42	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		6.42	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	GNB5	O14775	395 aa		6.42	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	CPLX1	O14810	134 aa		6.42	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	FIBP	O43427	364 aa		6.42	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	6.42	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	YEATS4	O95619	227 aa		6.42	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	BAG3	O95817	575 aa		6.42	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	6.42	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	6.42	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	MMP10	P09238	476 aa		6.42	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	6.42	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	NID1	P14543	1247 aa		6.42	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	ACPP	P15309	386 aa		6.42	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	6.42	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	CDC27	P30260	824 aa		6.42	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	6.42	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	6.42	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	6.42	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	WTAP	Q15007	396 aa		6.42	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC15A2	Q16348	729 aa		6.42	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	GRIK5	Q16478	980 aa		6.42	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		6.42	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		6.42	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	FERMT3	Q86UX7	667 aa		6.42	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	6.42	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	6.42	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	6.42	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	TTC16	Q8NEE8	873 aa		6.42	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	WASF1	Q92558	559 aa		6.42	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	DDX11	Q96FC9	970 aa		6.42	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		6.42	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	PLVAP	Q9BX97	442 aa		6.42	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	6.42	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		6.42	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		6.42	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	6.42	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		6.41	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	ERICH2	A1L162	156 aa		6.41	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	CCDC69	A6NI79	296 aa		6.41	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	LILRB5	O75023	590 aa		6.41	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	TNFRSF21	O75509	655 aa		6.41	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	RGS9	O75916	674 aa	Predicted RBP	6.41	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	DEXI	O95424	95 aa		6.41	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	CALM1	P0DP23	149 aa		6.41	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	CALM2	P0DP24	149 aa		6.41	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	CALM3	P0DP25	149 aa		6.41	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	RHBDL3	P58872	404 aa		6.41	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	ATP11A	P98196	1134 aa		6.41	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	PDE4B	Q07343	736 aa		6.41	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	TROAP	Q12815	778 aa		6.41	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	6.41	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	ORC1	Q13415	861 aa		6.41	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	DOC2B	Q14184	412 aa		6.41	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	COL19A1	Q14993	1142 aa		6.41	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	PCSK7	Q16549	785 aa		6.41	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	UVSSA	Q2YD98	709 aa		6.41	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		6.41	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC51A	Q86UW1	340 aa		6.41	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	IQCA1	Q86XH1	822 aa		6.41	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	DGKH	Q86XP1	1220 aa		6.41	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		6.41	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	6.41	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	PLD4	Q96BZ4	506 aa		6.41	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	PGBD1	Q96JS3	809 aa		6.41	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		6.41	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	C8orf76	Q96K31	380 aa		6.41	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	SPATA32	Q96LK8	384 aa		6.41	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		6.41	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	6.41	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	INCENP	Q9NQS7	918 aa		6.41	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		6.41	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	6.41	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	6.41	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	6.41	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	TNKS	O95271	1327 aa		6.41	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		6.41	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		6.41	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		6.41	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	6.41	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	EP400	Q96L91	3159 aa		6.4	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	6.4	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM229A	H3BQW9	127 aa		6.4	□□□□□ -1.38
ATG4A-208	ENST00000489247	EREG	O14944	169 aa		6.4	□□□□□ -1.38

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