RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486539.1

CACNA2D1-211, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1, humanhuman

TSL 5

Gene CACNA2D1, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1-211ENST00000486539 CDK4P11802 303 aa5.86□□□□□ -1.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF568Q3ZCX4 644 aa5.86□□□□□ -1.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 SYCE2Q6PIF2 218 aa5.86□□□□□ -1.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa5.86□□□□□ -1.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 Q6ZUG5 572 aa5.86□□□□□ -1.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLITRK4Q8IW52 837 aa5.86□□□□□ -1.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 CLIP3Q96DZ5 547 aa5.86□□□□□ -1.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 CHGBP05060 677 aa5.85□□□□□ -1.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 C21orf58P58505 322 aa5.85□□□□□ -1.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 TCEAL1Q15170 157 aa5.85□□□□□ -1.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 PRIMA1Q86XR5 153 aa5.85□□□□□ -1.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 RNF34Q969K3 372 aa5.85□□□□□ -1.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 C2orf71A6NGG8 1288 aa5.84□□□□□ -1.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 PEX11BO96011 259 aa5.84□□□□□ -1.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF165P49910 485 aa5.84□□□□□ -1.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 MROH9Q5TGP6 573 aa5.84□□□□□ -1.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 GK5Q6ZS86 529 aa5.84□□□□□ -1.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 RIOX2Q8IUF8 465 aa5.84□□□□□ -1.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 AJUBAQ96IF1 538 aa5.84□□□□□ -1.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 DTLQ9NZJ0 730 aa5.84□□□□□ -1.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 MARCH2Q9P0N8 246 aa5.84□□□□□ -1.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa5.84□□□□□ -1.47
CACNA2D1-211ENST00000486539 STXBP3O00186 592 aa5.83□□□□□ -1.48
CACNA2D1-211ENST00000486539 GREM1O60565 184 aa5.83□□□□□ -1.48
CACNA2D1-211ENST00000486539 KLHL18O94889 574 aa5.83□□□□□ -1.48
CACNA2D1-211ENST00000486539 ONECUT2O95948 504 aa5.83□□□□□ -1.48
CACNA2D1-211ENST00000486539 KRT4P19013 534 aa5.83□□□□□ -1.48
CACNA2D1-211ENST00000486539 CLCQ05315 142 aa5.83□□□□□ -1.48
CACNA2D1-211ENST00000486539 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
CACNA2D1-211ENST00000486539 FBXL19Q6PCT2 694 aa5.83□□□□□ -1.48
CACNA2D1-211ENST00000486539 REXO1L1PQ8IX06 675 aa5.83□□□□□ -1.48
CACNA2D1-211ENST00000486539 NUDT10Q8NFP7 164 aa5.83□□□□□ -1.48
CACNA2D1-211ENST00000486539 NUDT11Q96G61 164 aa5.83□□□□□ -1.48
CACNA2D1-211ENST00000486539 RHOBTB3O94955 611 aa5.82□□□□□ -1.48
CACNA2D1-211ENST00000486539 COL6A1P12109 1028 aa5.82□□□□□ -1.48
CACNA2D1-211ENST00000486539 RAC3P60763 192 aa5.82□□□□□ -1.48
CACNA2D1-211ENST00000486539 LAIR1Q6GTX8 287 aa5.82□□□□□ -1.48
CACNA2D1-211ENST00000486539 MCMBPQ9BTE3 642 aa5.82□□□□□ -1.48
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF652Q9Y2D9 606 aa5.82□□□□□ -1.48
CACNA2D1-211ENST00000486539 C22orf46C9J442 243 aa5.81□□□□□ -1.48
CACNA2D1-211ENST00000486539 NUDT3O95989 172 aa5.81□□□□□ -1.48
CACNA2D1-211ENST00000486539 THBDP07204 575 aa5.81□□□□□ -1.48
CACNA2D1-211ENST00000486539 PSMD2Q13200 908 aa5.81□□□□□ -1.48
CACNA2D1-211ENST00000486539 PPP2R5DQ14738 602 aa5.81□□□□□ -1.48
CACNA2D1-211ENST00000486539 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
CACNA2D1-211ENST00000486539 TEPPQ6URK8 271 aa5.81□□□□□ -1.48
CACNA2D1-211ENST00000486539 Q6ZPA2 131 aa5.81□□□□□ -1.48
CACNA2D1-211ENST00000486539 PPFIBP1Q86W92 1011 aa5.81□□□□□ -1.48
CACNA2D1-211ENST00000486539 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
CACNA2D1-211ENST00000486539 BRD1O95696 1058 aa5.8□□□□□ -1.48
CACNA2D1-211ENST00000486539 CTSHP09668 335 aa5.8□□□□□ -1.48
CACNA2D1-211ENST00000486539 CTGFP29279 349 aa5.8□□□□□ -1.48
CACNA2D1-211ENST00000486539 CSF2RBP32927 897 aa5.8□□□□□ -1.48
CACNA2D1-211ENST00000486539 CHRNA2Q15822 529 aa5.8□□□□□ -1.48
CACNA2D1-211ENST00000486539 BRIP1Q9BX63 1249 aa5.8□□□□□ -1.48
CACNA2D1-211ENST00000486539 MSL2Q9HCI7 577 aa5.8□□□□□ -1.48
CACNA2D1-211ENST00000486539 PARPBPQ9NWS1 579 aa5.8□□□□□ -1.48
CACNA2D1-211ENST00000486539 WHRNQ9P202 907 aa5.8□□□□□ -1.48
CACNA2D1-211ENST00000486539 CR2P20023 1033 aa5.79□□□□□ -1.48
CACNA2D1-211ENST00000486539 MMP19Q99542 508 aa5.79□□□□□ -1.48
CACNA2D1-211ENST00000486539 RNF19AQ9NV58 838 aa5.79□□□□□ -1.48
CACNA2D1-211ENST00000486539 FAM86C2PA6NEL3 165 aa5.78□□□□□ -1.48
CACNA2D1-211ENST00000486539 CD38P28907 300 aa5.78□□□□□ -1.48
CACNA2D1-211ENST00000486539 MCM4P33991 863 aa5.78□□□□□ -1.48
CACNA2D1-211ENST00000486539 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
CACNA2D1-211ENST00000486539 HSPBP1Q9NZL4 362 aa5.78□□□□□ -1.48
CACNA2D1-211ENST00000486539 OAZ3Q9UMX2 235 aa5.78□□□□□ -1.48
CACNA2D1-211ENST00000486539 LMNAP02545 664 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
CACNA2D1-211ENST00000486539 TP53P04637 393 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
CACNA2D1-211ENST00000486539 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
CACNA2D1-211ENST00000486539 AMPD2Q01433 879 aa5.77□□□□□ -1.49
CACNA2D1-211ENST00000486539 GRB10Q13322 594 aa5.77□□□□□ -1.49
CACNA2D1-211ENST00000486539 USP10Q14694 798 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
CACNA2D1-211ENST00000486539 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
CACNA2D1-211ENST00000486539 SEZ6Q53EL9 994 aa5.77□□□□□ -1.49
CACNA2D1-211ENST00000486539 COLEC12Q5KU26 742 aa5.77□□□□□ -1.49
CACNA2D1-211ENST00000486539 TEX2Q8IWB9 1127 aa5.77□□□□□ -1.49
CACNA2D1-211ENST00000486539 KATNBL1Q9H079 304 aa5.77□□□□□ -1.49
CACNA2D1-211ENST00000486539 RIOX1Q9H6W3 641 aa5.77□□□□□ -1.49
CACNA2D1-211ENST00000486539 RPS19P39019 145 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
CACNA2D1-211ENST00000486539 CRKP46108 304 aa5.76□□□□□ -1.49
CACNA2D1-211ENST00000486539 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
CACNA2D1-211ENST00000486539 FSTL1Q12841 308 aa5.76□□□□□ -1.49
CACNA2D1-211ENST00000486539 DPY19L1Q2PZI1 675 aa5.76□□□□□ -1.49
CACNA2D1-211ENST00000486539 MICALCLQ6ZW33 695 aa5.76□□□□□ -1.49
CACNA2D1-211ENST00000486539 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
CACNA2D1-211ENST00000486539 DPF3Q92784 378 aa5.76□□□□□ -1.49
CACNA2D1-211ENST00000486539 KBTBD4Q9NVX7 518 aa5.76□□□□□ -1.49
CACNA2D1-211ENST00000486539 CEP72Q9P209 647 aa5.76□□□□□ -1.49
CACNA2D1-211ENST00000486539 PARP2Q9UGN5 583 aa5.76□□□□□ -1.49
CACNA2D1-211ENST00000486539 GCP02774 474 aa5.75□□□□□ -1.49
CACNA2D1-211ENST00000486539 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
CACNA2D1-211ENST00000486539 GPR155Q7Z3F1 870 aa5.75□□□□□ -1.49
CACNA2D1-211ENST00000486539 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR14A2Q96R54 314 aa5.75□□□□□ -1.49
CACNA2D1-211ENST00000486539 GBP3Q9H0R5 595 aa5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.7 ms