RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482785.1

SHQ1-208, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, human

TSL 3

Gene SHQ1, Length 502 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SHQ1-208	ENST00000482785	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	CELA3A	P09093	270 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	ITPKA	P23677	461 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	MSX1	P28360	303 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	SEZ6	Q53EL9	994 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	SAMD5	Q5TGI4	173 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	PRICKLE2	Q7Z3G6	844 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	TMEM105	Q8N8V8	129 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	RNF217	Q8TC41	542 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	FERD3L	Q96RJ6	166 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	CRISPLD1	Q9H336	500 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	BRD7	Q9NPI1	651 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	AAAS	Q9NRG9	546 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	PPT2	Q9UMR5	302 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	FIGNL2	A6NMB9	653 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	ENC1	O14682	589 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	ST8SIA5	O15466	376 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	SASH1	O94885	1247 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	CETP	P11597	493 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	IMPDH2	P12268	514 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	RHOQ	P17081	205 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	ZNF165	P49910	485 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	FXN	Q16595	210 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	TMEM240	Q5SV17	173 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	ZNF787	Q6DD87	383 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	LYSMD3	Q7Z3D4	306 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	NLRP8	Q86W28	1048 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	THAP3	Q8WTV1	239 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	RUBCN	Q92622	972 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	TIMMDC1	Q9NPL8	285 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	FANCM	Q8IYD8	2048 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	PLXNB2	O15031	1838 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	AXIN1	O15169	862 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	LPXN	O60711	386 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	MMP20	O60882	483 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	SASH3	O75995	380 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	KIF4A	O95239	1232 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	PDGFRB	P09619	1106 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	RAG1	P15918	1043 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	SOX18	P35713	384 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	MASP1	P48740	699 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	GRB10	Q13322	594 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	SQSTM1	Q13501	440 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	CCIN	Q13939	588 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	MPP2	Q14168	576 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	C2orf27A	Q580R0	203 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	C19orf48	Q6RUI8	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	OSMR	Q99650	979 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	ST7	Q9NRC1	585 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	LRRK2	Q5S007	2527 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	NBPF19	A0A087WUL8	3843 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	FAM221A	A4D161	298 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	TTLL8	A6PVC2	850 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	PDHX	O00330	501 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	C1QL1	O75973	258 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	F13A1	P00488	732 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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