RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482597.5

PTPRVP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRVP, Length 3,999 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-201ENST00000482597 PPARDQ03181 441 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRVP-201ENST00000482597 TAX1BP1Q86VP1 789 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRVP-201ENST00000482597 HINFPQ9BQA5 517 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRVP-201ENST00000482597 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
PTPRVP-201ENST00000482597 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRVP-201ENST00000482597 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
PTPRVP-201ENST00000482597 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
PTPRVP-201ENST00000482597 DGKZQ13574 1117 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRVP-201ENST00000482597 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
PTPRVP-201ENST00000482597 EMILIN3Q9NT22 766 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRVP-201ENST00000482597 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
PTPRVP-201ENST00000482597 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRVP-201ENST00000482597 ATP2C2O75185 946 aa10.65□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 KRT31Q15323 416 aa10.65□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 DYDC2Q96IM9 177 aa10.65□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 IFT74Q96LB3 600 aa10.65□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa10.65□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 LRRIQ4A6NIV6 560 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 KRT86O43790 486 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 DLATP10515 647 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 PAFAH1B1P43034 410 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 OR8K1Q8NGG5 319 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 CYP2W1Q8TAV3 490 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 CEP170P1Q96L14 293 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 FNBP1Q96RU3 617 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 STRCP1A6NGW2 1772 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 YDJCA8MPS7 323 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 CALUO43852 315 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 RHOXF2BP0C7M4 288 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 GJC1P36383 396 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 IREB2P48200 963 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 MTMR1Q13613 665 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 KCTD2Q14681 263 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 MTERF2Q49AM1 385 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 GRIPAP1Q4V328 841 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 FBXL16Q8N461 479 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 AGBL3Q8NEM8 1001 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 ATG4CQ96DT6 458 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 RHOXF2Q9BQY4 288 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 RABEP2Q9H5N1 569 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 FEM1BQ9UK73 627 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 TRPC6Q9Y210 931 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 CAP2P40123 477 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 STK4Q13043 487 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 ALS2CR12Q96Q35 445 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 CARD6Q9BX69 1037 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 CTAGE9A4FU28 777 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 GAKO14976 1311 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 KRT5P13647 590 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 KRT83P78385 493 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 CYP26C1Q6V0L0 522 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 TXLNBQ8N3L3 684 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 KIAA1524Q8TCG1 905 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 CAMKK2Q96RR4 588 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 STK17AQ9UEE5 414 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 SOWAHDA6NJG2 315 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 CCNE1P24864 410 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 PPP1R2P41236 205 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 DNM2P50570 870 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 AP3B2Q13367 1082 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 LRP6O75581 1613 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 SLU7O95391 586 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 MYCP01106 439 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 MAGEA1P43355 309 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 TERF1P54274 439 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 TGFB2P61812 414 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 DPP9Q86TI2 863 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 SFR1Q86XK3 245 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 FBXO41Q8TF61 875 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 GOLGA8IPA6NC78 632 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 GOLGA8JA6NMD2 632 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 CYP27A1Q02318 531 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 KLHL30Q0D2K2 578 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 WDR11Q9BZH6 1224 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 TRIM9Q9C026 710 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 CUEDC2Q9H467 287 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 TNNI1P19237 187 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 NT5C2P49902 561 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 CEP55Q53EZ4 464 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 TMTC1Q8IUR5 882 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRVP-201ENST00000482597 ZNF280CQ8ND82 737 aa10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms