RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481600.5

EDRF1-208, Transcript of erythroid differentiation regulatory factor 1, human

TSL 2

Gene EDRF1, Length 4,181 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EDRF1-208	ENST00000481600	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		12.82	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		12.82	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		12.82	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	AK8	Q96MA6	479 aa		12.82	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	BUB1	O43683	1085 aa		12.81	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	RHOBTB3	O94955	611 aa		12.81	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	CCNE1	P24864	410 aa		12.81	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	CASP8	Q14790	479 aa		12.81	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	RETREG2	Q8NC44	543 aa		12.81	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	P2RX5	Q93086	422 aa		12.81	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	FERMT1	Q9BQL6	677 aa		12.81	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	USP17L3	A6NCW0	530 aa		12.81	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	USP17L4	A6NCW7	530 aa		12.81	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		12.81	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	NEK8	Q86SG6	692 aa		12.81	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	NKIRAS1	Q9NYS0	192 aa		12.81	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	L1RE1	Q9UN81	338 aa		12.81	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	CEP83	Q9Y592	693 aa		12.81	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		12.81	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	ABL1	P00519	1130 aa		12.81	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	PLCG1	P19174	1290 aa		12.81	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		12.81	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		12.81	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		12.81	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		12.81	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600		H3BQF6	201 aa		12.81	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	ABCB4	P21439	1286 aa		12.81	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	ZNF365	Q70YC5	407 aa		12.81	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	DNAJC7	Q99615	494 aa		12.81	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	BARHL2	Q9NY43	387 aa		12.81	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		12.81	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		12.81	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	GPBP1	Q86WP2	473 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	TPH2	Q8IWU9	490 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	CCDC63	Q8NA47	563 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	NOA1	Q8NC60	698 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	PSMD14	O00487	310 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	ADAMTS3	O15072	1205 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	SRGN	P10124	158 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	ZBED6	P86452	979 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	NUCKS1	Q9H1E3	243 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	PSD3	Q9NYI0	1048 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	SBDS	Q9Y3A5	250 aa	Known RBP eCLIP	12.8	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	KCNK3	O14649	394 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	ZMYND10	O75800	440 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	STAMBP	O95630	424 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	ATP1A2	P50993	1020 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	SMTN	P53814	917 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	FAM71B	Q8TC56	605 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	KCNQ2	O43526	872 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	STAT1	P42224	750 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	WDR44	Q5JSH3	913 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	USP40	Q9NVE5	1235 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	TTI2	Q6NXR4	508 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	ANKS1A	Q92625	1134 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	PPAN	Q9NQ55	473 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	TSKS	Q9UJT2	592 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600		A6NNZ2	444 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	STXBP3	O00186	592 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	TCP1	P17987	556 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	SETDB1	Q15047	1291 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EDRF1-208	ENST00000481600	GBP6	Q6ZN66	633 aa		12.79	□□□□□ -0.36

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