RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480273.5

RTEL1-TNFRSF6B-201, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,751 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MMS19Q96T76 1030 aa18.64■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TXLNGQ9NUQ3 528 aa18.64■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RNF14Q9UBS8 474 aa18.64■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ANAPC5Q9UJX4 755 aa18.64■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa18.63■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa18.63■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa18.63■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa18.63■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa18.63■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GDAP1Q8TB36 358 aa18.63■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FBXO41Q8TF61 875 aa18.63■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SDCCAG3Q96C92 435 aa18.63■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RESTQ13127 1097 aa18.63■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP18.63■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NOD1Q9Y239 953 aa18.63■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TNS3Q68CZ2 1445 aa18.63■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 WDR46O15213 610 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLFN14P0C7P3 912 aa18.63■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CYP4F22Q6NT55 531 aa18.63■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NME8Q8N427 588 aa18.63■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GLG1Q92896 1179 aa18.63■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HAUS8Q9BT25 410 aa18.63■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP18.63■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ADORA1P30542 326 aa18.63■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CHRNDQ07001 517 aa18.63■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP18.63■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP18.63■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PLA2G4DQ86XP0 818 aa18.63■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RASGRP4Q8TDF6 673 aa18.63■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 WHAMMQ8TF30 809 aa18.63■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HEG1Q9ULI3 1381 aa18.63■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 E9PCH4 1651 aa18.63■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CYP27B1O15528 508 aa18.62■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CNGA1P29973 690 aa18.62■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PTK2Q05397 1052 aa18.62■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FBXO11Q86XK2 927 aa18.62■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF653Q96CK0 615 aa18.62■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP18.62■□□□□ 0.573e-8■■■■■ 96.4
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RNF8O76064 485 aa18.62■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TBK1Q9UHD2 729 aa18.62■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SCOCQ9UIL1 159 aa18.62■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ATP2B4P23634 1241 aa18.62■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MAPK4P31152 587 aa18.62■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ECE1P42892 770 aa18.62■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PDE1BQ01064 536 aa18.62■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TTC4O95801 387 aa18.62■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MMP1P03956 469 aa18.62■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ARID5BQ14865 1188 aa18.62■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CAPN9O14815 690 aa18.62■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PRKG1Q13976 671 aa18.62■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DLGAP5Q15398 846 aa18.62■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 AOC3Q16853 763 aa18.62■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DOK7Q18PE1 504 aa18.62■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 METTL13Q8N6R0 699 aa18.62■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ITKQ08881 620 aa18.61■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PPP2R5AQ15172 486 aa18.61■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ODR4Q5SWX8 454 aa18.61■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa18.61■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 THAP9Q9H5L6 903 aa18.61■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SERPINB2P05120 415 aa18.61■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MSH2P43246 934 aa18.61■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TRIM42Q8IWZ5 723 aa18.61■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HDAC11Q96DB2 347 aa18.61■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 AK8Q96MA6 479 aa18.61■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GPC4O75487 556 aa18.61■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 COPRSQ9NQ92 184 aa18.61■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MAP3K7O43318 606 aa18.61■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZBED6P86452 979 aa18.61■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NT5C1BQ96P26 610 aa18.61■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SMYD2Q9NRG4 433 aa18.61■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PALLDQ8WX93 1383 aa18.61■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 H0YCG3 227 aa18.61■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 POLE2P56282 527 aa18.61■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CNKSR1Q969H4 720 aa18.61■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KIF11P52732 1056 aa18.6■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa18.6■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LMTK2Q8IWU2 1503 aa18.6■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ATP1A3P13637 1013 aa18.6■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PHKA1P46020 1223 aa18.6■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP18.6■□□□□ 0.574e-6■■■■□ 26.1
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GPR162Q16538 588 aa18.6■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 POMGNT1Q8WZA1 660 aa18.6■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 AP1M1Q9BXS5 423 aa18.6■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MIS12Q9H081 205 aa18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.4 ms