RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480038.1

FBXO11-208, Transcript of F-box protein 11, human

TSL 4

Gene FBXO11, Length 600 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO11-208	ENST00000480038	CDR1	P51861	262 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	EPHB3	P54753	998 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	TESK1	Q15569	626 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	DDR2	Q16832	855 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	TMC6	Q7Z403	805 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	LZTR1	Q8N653	840 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	MZB1	Q8WU39	189 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	C20orf173	Q96LM9	149 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	C8orf37	Q96NL8	207 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	CLEC1B	Q9P126	229 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	FBLN5	Q9UBX5	448 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	RGS12	O14924	1447 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	DEPDC5	O75140	1603 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	ARNTL	O00327	626 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	NPHS1	O60500	1241 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	BMP7	P18075	431 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	FBLN1	P23142	703 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	TACR1	P25103	407 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	RAB33A	Q14088	237 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	MBLAC2	Q68D91	279 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	IQCE	Q6IPM2	695 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	BTN2A2	Q8WVV5	523 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	DPF3	Q92784	378 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	RELT	Q969Z4	430 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	GULP1	Q9UBP9	304 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	KCTD3	Q9Y597	815 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	IRAK3	Q9Y616	596 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038		F8W031	263 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	CP	P00450	1065 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	PRR5	P85299	388 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	SSPN	Q14714	243 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	INF2	Q27J81	1249 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	ZNF385B	Q569K4	471 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	NETO2	Q8NC67	525 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	ST7	Q9NRC1	585 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	ABCC1	P33527	1531 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038		A0A1W2PQU0	124 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	ZC3H12D	A2A288	527 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	RFXAP	O00287	272 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	GFRA1	P56159	465 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	SF1	Q15637	639 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	CABP7	Q86V35	215 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	CCDC103	Q8IW40	242 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	C1orf159	Q96HA4	380 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	SGSM3	Q96HU1	749 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	AFF2	P51816	1311 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	IQGAP1	P46940	1657 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	AGRP	O00253	132 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	FUCA1	P04066	466 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	PI3	P19957	117 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	ECI1	P42126	302 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	GRIA2	P42262	883 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	PPP2R2A	P63151	447 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	KCNAB2	Q13303	367 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	SLC9A5	Q14940	896 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	SLC35F1	Q5T1Q4	408 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	TMEM151B	Q8IW70	566 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038		Q8N1Y9	231 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FBXO11-208	ENST00000480038	PANK1	Q8TE04	598 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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