RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476502.1

TRBV1-201, Transcript of T cell receptor beta variable 1 (pseudogene), humanhuman

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Gene TRBV1, Length 284 nt, Biotype TR V pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV1-201ENST00000476502 LIMS1P48059 325 aa4.6□□□□□ -1.67
TRBV1-201ENST00000476502 MAPKAPK2P49137 400 aa4.6□□□□□ -1.67
TRBV1-201ENST00000476502 RBM10P98175 930 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
TRBV1-201ENST00000476502 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
TRBV1-201ENST00000476502 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
TRBV1-201ENST00000476502 STYK1Q6J9G0 422 aa4.6□□□□□ -1.67
TRBV1-201ENST00000476502 NSMFQ6X4W1 530 aa4.6□□□□□ -1.67
TRBV1-201ENST00000476502 RPTNQ6XPR3 784 aa4.6□□□□□ -1.67
TRBV1-201ENST00000476502 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
TRBV1-201ENST00000476502 CPNE8Q86YQ8 564 aa4.6□□□□□ -1.67
TRBV1-201ENST00000476502 SCUBE1Q8IWY4 988 aa4.6□□□□□ -1.67
TRBV1-201ENST00000476502 RCBTB1Q8NDN9 531 aa4.6□□□□□ -1.67
TRBV1-201ENST00000476502 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa4.6□□□□□ -1.67
TRBV1-201ENST00000476502 NLGN2Q8NFZ4 835 aa4.6□□□□□ -1.67
TRBV1-201ENST00000476502 KCTD13Q8WZ19 329 aa4.6□□□□□ -1.67
TRBV1-201ENST00000476502 DHRS4Q9BTZ2 278 aa4.6□□□□□ -1.67
TRBV1-201ENST00000476502 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
TRBV1-201ENST00000476502 ACSL6Q9UKU0 697 aa4.6□□□□□ -1.67
TRBV1-201ENST00000476502 CADPSQ9ULU8 1353 aa4.6□□□□□ -1.67
TRBV1-201ENST00000476502 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
TRBV1-201ENST00000476502 TBC1D8O95759 1140 aa4.59□□□□□ -1.67
TRBV1-201ENST00000476502 GJA9P57773 515 aa4.59□□□□□ -1.67
TRBV1-201ENST00000476502 MVKQ03426 396 aa4.59□□□□□ -1.67
TRBV1-201ENST00000476502 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
TRBV1-201ENST00000476502 RTP5Q14D33 572 aa4.59□□□□□ -1.67
TRBV1-201ENST00000476502 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
TRBV1-201ENST00000476502 PAQR3Q6TCH7 311 aa4.59□□□□□ -1.67
TRBV1-201ENST00000476502 KCNT2Q6UVM3 1135 aa4.59□□□□□ -1.67
TRBV1-201ENST00000476502 IGDCC3Q8IVU1 814 aa4.59□□□□□ -1.67
TRBV1-201ENST00000476502 PPIL6Q8IXY8 311 aa4.59□□□□□ -1.67
TRBV1-201ENST00000476502 TMEFF1Q8IYR6 380 aa4.59□□□□□ -1.67
TRBV1-201ENST00000476502 SLC7A14Q8TBB6 771 aa4.59□□□□□ -1.67
TRBV1-201ENST00000476502 SCLYQ96I15 445 aa4.59□□□□□ -1.67
TRBV1-201ENST00000476502 CLUHP3Q96NS8 147 aa4.59□□□□□ -1.67
TRBV1-201ENST00000476502 SLC52A2Q9HAB3 445 aa4.59□□□□□ -1.67
TRBV1-201ENST00000476502 TRIM39Q9HCM9 518 aa4.59□□□□□ -1.67
TRBV1-201ENST00000476502 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
TRBV1-201ENST00000476502 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
TRBV1-201ENST00000476502 F8W031 263 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
TRBV1-201ENST00000476502 CYBBP04839 570 aa4.58□□□□□ -1.68
TRBV1-201ENST00000476502 PAMP19021 973 aa4.58□□□□□ -1.68
TRBV1-201ENST00000476502 SEPHS1P49903 392 aa4.58□□□□□ -1.68
TRBV1-201ENST00000476502 CORO7P57737 925 aa4.58□□□□□ -1.68
TRBV1-201ENST00000476502 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
TRBV1-201ENST00000476502 FOXO4P98177 505 aa4.58□□□□□ -1.68
TRBV1-201ENST00000476502 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
TRBV1-201ENST00000476502 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa4.58□□□□□ -1.68
TRBV1-201ENST00000476502 NT5DC1Q5TFE4 455 aa4.58□□□□□ -1.68
TRBV1-201ENST00000476502 SDE2Q6IQ49 451 aa4.58□□□□□ -1.68
TRBV1-201ENST00000476502 TTLL7Q6ZT98 887 aa4.58□□□□□ -1.68
TRBV1-201ENST00000476502 PLEKHO2Q8TD55 490 aa4.58□□□□□ -1.68
TRBV1-201ENST00000476502 ALG3Q92685 438 aa4.58□□□□□ -1.68
TRBV1-201ENST00000476502 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa4.58□□□□□ -1.68
TRBV1-201ENST00000476502 FANCLQ9NW38 375 aa4.58□□□□□ -1.68
TRBV1-201ENST00000476502 NUDT5Q9UKK9 219 aa4.58□□□□□ -1.68
TRBV1-201ENST00000476502 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa4.58□□□□□ -1.68
TRBV1-201ENST00000476502 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa4.57□□□□□ -1.68
TRBV1-201ENST00000476502 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
TRBV1-201ENST00000476502 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
TRBV1-201ENST00000476502 GLI4P10075 376 aa4.57□□□□□ -1.68
TRBV1-201ENST00000476502 NCAM1P13591 858 aa4.57□□□□□ -1.68
TRBV1-201ENST00000476502 TNFRSF1AP19438 455 aa4.57□□□□□ -1.68
TRBV1-201ENST00000476502 LTBRP36941 435 aa4.57□□□□□ -1.68
TRBV1-201ENST00000476502 SLURP1P55000 103 aa4.57□□□□□ -1.68
TRBV1-201ENST00000476502 KCNAB2Q13303 367 aa4.57□□□□□ -1.68
TRBV1-201ENST00000476502 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa4.57□□□□□ -1.68
TRBV1-201ENST00000476502 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
TRBV1-201ENST00000476502 USP33Q8TEY7 942 aa4.57□□□□□ -1.68
TRBV1-201ENST00000476502 PHF20Q9BVI0 1012 aa4.57□□□□□ -1.68
TRBV1-201ENST00000476502 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
TRBV1-201ENST00000476502 GPR27Q9NS67 375 aa4.57□□□□□ -1.68
TRBV1-201ENST00000476502 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
TRBV1-201ENST00000476502 TRAF6Q9Y4K3 522 aa4.57□□□□□ -1.68
TRBV1-201ENST00000476502 ARVCFO00192 962 aa4.56□□□□□ -1.68
TRBV1-201ENST00000476502 WNT9AO14904 365 aa4.56□□□□□ -1.68
TRBV1-201ENST00000476502 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
TRBV1-201ENST00000476502 KCNA6P17658 529 aa4.56□□□□□ -1.68
TRBV1-201ENST00000476502 KCNJ6P48051 423 aa4.56□□□□□ -1.68
TRBV1-201ENST00000476502 CAP1Q01518 475 aa4.56□□□□□ -1.68
TRBV1-201ENST00000476502 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa4.56□□□□□ -1.68
TRBV1-201ENST00000476502 ABHD17CQ6PCB6 329 aa4.56□□□□□ -1.68
TRBV1-201ENST00000476502 USP53Q70EK8 1073 aa4.56□□□□□ -1.68
TRBV1-201ENST00000476502 FGD2Q7Z6J4 655 aa4.56□□□□□ -1.68
TRBV1-201ENST00000476502 SLC16A11Q8NCK7 471 aa4.56□□□□□ -1.68
TRBV1-201ENST00000476502 CHST13Q8NET6 341 aa4.56□□□□□ -1.68
TRBV1-201ENST00000476502 DCAF4Q8WV16 495 aa4.56□□□□□ -1.68
TRBV1-201ENST00000476502 DIO2Q92813 273 aa4.56□□□□□ -1.68
TRBV1-201ENST00000476502 RNF38Q9H0F5 515 aa4.56□□□□□ -1.68
TRBV1-201ENST00000476502 PDLIM7Q9NR12 457 aa4.56□□□□□ -1.68
TRBV1-201ENST00000476502 X6R8D5 127 aa4.56□□□□□ -1.68
TRBV1-201ENST00000476502 ERCC6Q03468 1493 aa4.56□□□□□ -1.68
TRBV1-201ENST00000476502 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa4.56□□□□□ -1.68
TRBV1-201ENST00000476502 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa4.55□□□□□ -1.68
TRBV1-201ENST00000476502 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa4.55□□□□□ -1.68
TRBV1-201ENST00000476502 PLD2O14939 933 aa4.55□□□□□ -1.68
TRBV1-201ENST00000476502 SRGAP3O43295 1099 aa4.55□□□□□ -1.68
TRBV1-201ENST00000476502 RFPL3O75679 317 aa4.55□□□□□ -1.68
TRBV1-201ENST00000476502 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
TRBV1-201ENST00000476502 RAPGEF3O95398 923 aa4.55□□□□□ -1.68
TRBV1-201ENST00000476502 FSHBP01225 129 aa4.55□□□□□ -1.68
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