RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466638.5

PNCK-222, Transcript of pregnancy up-regulated nonubiquitous CaM kinase, human

TSL 2

Gene PNCK, Length 1,204 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PNCK-222	ENST00000466638	ADAMTS3	O15072	1205 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	DTNB	O60941	627 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	GGPS1	O95749	300 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	MMP3	P08254	477 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	ICAM3	P32942	547 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	PSMC6	P62333	389 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	TLE2	Q04725	743 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	LAMC2	Q13753	1193 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	18.88	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	NLRX1	Q86UT6	975 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	18.88	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	BICD2	Q8TD16	824 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	18.88	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	AIFM3	Q96NN9	605 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	18.88	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	ARVCF	O00192	962 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	KPNA6	O60684	536 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	CTDNEP1	O95476	244 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	NLRP5	P59047	1200 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	SEMA3F	Q13275	785 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	ITGA7	Q13683	1181 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	GPRASP2	Q96D09	838 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	SPATA33	Q96N06	139 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	18.87	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	STK36	Q9NRP7	1315 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	CLTB	P09497	229 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	ITGB5	P18084	799 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	SREBF1	P36956	1147 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	CDK7	P50613	346 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	MTMR1	Q13613	665 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	NEDD9	Q14511	834 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	RABEP1	Q15276	862 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	DGKD	Q16760	1214 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	MCTP2	Q6DN12	878 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	PPTC7	Q8NI37	304 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	TOX2	Q96NM4	488 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	GRIN2D	O15399	1336 aa		18.85	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		18.85	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	ARHGAP4	P98171	946 aa		18.85	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		18.85	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		18.85	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	CDHR1	Q96JP9	859 aa		18.85	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		18.85	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		18.85	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	JADE2	Q9NQC1	790 aa		18.85	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	18.85	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	ZNF76	P36508	570 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	FAAP100	Q0VG06	881 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	METTL7B	Q6UX53	244 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	CHRDL2	Q6WN34	429 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	18.84	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	18.84	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PNCK-222	ENST00000466638	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	18.83	■□□□□ 0.6
PNCK-222	ENST00000466638	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	18.83	■□□□□ 0.6
PNCK-222	ENST00000466638	MAFG	O15525	162 aa		18.83	■□□□□ 0.6
PNCK-222	ENST00000466638	ATP9A	O75110	1047 aa		18.83	■□□□□ 0.6
PNCK-222	ENST00000466638	XBP1	P17861	261 aa		18.83	■□□□□ 0.6
PNCK-222	ENST00000466638	CHMP4BP1	P59074	171 aa		18.83	■□□□□ 0.6
PNCK-222	ENST00000466638	ST3GAL1	Q11201	340 aa		18.83	■□□□□ 0.6
PNCK-222	ENST00000466638	CEP55	Q53EZ4	464 aa		18.83	■□□□□ 0.6
PNCK-222	ENST00000466638	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		18.83	■□□□□ 0.6
PNCK-222	ENST00000466638	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		18.83	■□□□□ 0.6
PNCK-222	ENST00000466638	WASF1	Q92558	559 aa		18.83	■□□□□ 0.6
PNCK-222	ENST00000466638	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		18.83	■□□□□ 0.6
PNCK-222	ENST00000466638	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PNCK-222	ENST00000466638	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PNCK-222	ENST00000466638	ST18	O60284	1047 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PNCK-222	ENST00000466638	ZNF286B	P0CG31	522 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PNCK-222	ENST00000466638	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	18.82	■□□□□ 0.6
PNCK-222	ENST00000466638	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	18.82	■□□□□ 0.6
PNCK-222	ENST00000466638	KCNA2	P16389	499 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PNCK-222	ENST00000466638	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	18.82	■□□□□ 0.6
PNCK-222	ENST00000466638	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	18.82	■□□□□ 0.6
PNCK-222	ENST00000466638	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PNCK-222	ENST00000466638	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PNCK-222	ENST00000466638	GALNT17	Q6IS24	598 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PNCK-222	ENST00000466638	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PNCK-222	ENST00000466638	BLID	Q8IZY5	108 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PNCK-222	ENST00000466638	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PNCK-222	ENST00000466638	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	18.82	■□□□□ 0.6
PNCK-222	ENST00000466638	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PNCK-222	ENST00000466638	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		18.82	■□□□□ 0.6

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