RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466245.1

TTLL3-223, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 3

Gene TTLL3, Length 616 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-223	ENST00000466245	AMN	Q9BXJ7	453 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-223	ENST00000466245	USP26	Q9BXU7	913 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-223	ENST00000466245	SENP2	Q9HC62	589 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-223	ENST00000466245	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-223	ENST00000466245	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTLL3-223	ENST00000466245	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		11.65	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	GRIN2D	O15399	1336 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245		B4DLN1	442 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	EVC	P57679	992 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	ANAPC15	P60006	121 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	APOA5	Q6Q788	366 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	CHST3	Q7LGC8	479 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	KCNH6	Q9H252	994 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	FAM50B	Q9Y247	325 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	SI	P14410	1827 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	NFIB	O00712	420 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	CYTH3	O43739	400 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	EFCAB14	O75071	495 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	EDNRB	P24530	442 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	SNAP25	P60880	206 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	GJD3	Q8N144	294 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	CAGE1	Q8TC20	777 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	TET1	Q8NFU7	2136 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	EPOP	A6NHQ4	379 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	IQCF3	P0C7M6	154 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	HSD17B4	P51659	736 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	KRT40	Q6A162	431 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	FANCB	Q8NB91	859 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	CPVL	Q9H3G5	476 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	OPLAH	O14841	1288 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	RPS6KB1	P23443	525 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	MRE11	P49959	708 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	PDE4D	Q08499	809 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	PTPRO	Q16827	1216 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	SCFD2	Q8WU76	684 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	IWS1	Q96ST2	819 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	ZBTB43	O43298	467 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	KCNA5	P22460	613 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	CHMP4BP1	P59074	171 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	FUT2	Q10981	343 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	USH1G	Q495M9	461 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	RUFY3	Q7L099	469 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	PIGS	Q96S52	555 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	RAD9A	Q99638	391 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TTLL3-223	ENST00000466245	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		11.6	□□□□□ -0.55

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