RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464518.1

SLC13A3-208, Transcript of solute carrier family 13 member 3, humanhuman

TSL 5

Gene SLC13A3, Length 792 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A3-208ENST00000464518 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa14.82□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 POTEMA6NI47 508 aa14.82□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 H3BNC9 293 aa14.82□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 FOXP2O15409 715 aa14.82□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 ZP2Q05996 745 aa14.82□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 ZNF543Q08ER8 600 aa14.82□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 ALX1Q15699 326 aa14.82□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 TRAF7Q6Q0C0 670 aa14.82□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 TICAM2Q86XR7 235 aa14.82□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 BANK1Q8NDB2 785 aa14.82□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 PPTC7Q8NI37 304 aa14.82□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 MFSD14AQ96MC6 490 aa14.82□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 C17orf80Q9BSJ5 609 aa14.82□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 FSD1Q9BTV5 496 aa14.82□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 DCTPP1Q9H773 170 aa14.82□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 HDAC6Q9UBN7 1215 aa14.82□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 ZMYM6O95789 1325 aa14.82□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 MICAL3Q7RTP6 2002 aa14.82□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa14.81□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 PIEZO1Q92508 2521 aa14.81□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 CAND2O75155 1236 aa14.81□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 PSEN2P49810 448 aa14.81□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 CTDSPL2Q05D32 466 aa14.81□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 LAMC2Q13753 1193 aa14.81□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 MFSD10Q14728 455 aa14.81□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 STXBP2Q15833 593 aa14.81□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 EPC2Q52LR7 807 aa14.81□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa14.81□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 ZNF618Q5T7W0 954 aa14.81□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 PI4K2BQ8TCG2 481 aa14.81□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa14.81□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 CHMP4CQ96CF2 233 aa14.81□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 SNX27Q96L92 541 aa14.81□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 PRRX2Q99811 253 aa14.81□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 MTMR7Q9Y216 660 aa14.81□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 PYGBP11216 843 aa14.8□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 CHMP4BP1P59074 171 aa14.8□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 PKN1Q16512 942 aa14.8□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 LY6KQ17RY6 165 aa14.8□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 KIAA0753Q2KHM9 967 aa14.8□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 TCTN1Q2MV58 587 aa14.8□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa14.8□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 MCF2L2Q86YR7 1114 aa14.8□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 MYOCDQ8IZQ8 938 aa14.8□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 TOP1MTQ969P6 601 aa14.8□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 LMAN2LQ9H0V9 348 aa14.8□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 ABCB11O95342 1321 aa14.8□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 BRWD1Q9NSI6 2320 aa14.8□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 PPFIA4O75335 1185 aa14.79□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 VASPP50552 380 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 MBTPS1Q14703 1052 aa14.79□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 TSHZ3Q63HK5 1081 aa14.79□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 KCNV1Q6PIU1 500 aa14.79□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 SEPT14Q6ZU15 432 aa14.79□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa14.79□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 FBXO11Q86XK2 927 aa14.79□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 DBF4BQ8NFT6 615 aa14.79□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 CCDC136Q96JN2 1154 aa14.79□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 GPCPD1Q9NPB8 672 aa14.79□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 PLSCR2Q9NRY7 297 aa14.79□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 RWDD3Q9Y3V2 267 aa14.79□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 RSPH10B2B2RC85 870 aa14.78□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 C5orf67F2Z3F1 127 aa14.78□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 H3BQ06 376 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 RB1P06400 928 aa14.78□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 RSPH10BP0C881 870 aa14.78□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 HOXC8P31273 242 aa14.78□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 GPM6BQ13491 265 aa14.78□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 CTC1Q2NKJ3 1217 aa14.78□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 TCEAL5Q5H9L2 206 aa14.78□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP14.78□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 SERINC5Q86VE9 423 aa14.78□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 TMEM192Q8IY95 271 aa14.78□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 EXOC6Q8TAG9 804 aa14.78□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 APBB2Q92870 758 aa14.78□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 YME1L1Q96TA2 773 aa14.78□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 RMDN3Q96TC7 470 aa14.78□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
SLC13A3-208ENST00000464518 GHRHRQ02643 423 aa14.77□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 USH1GQ495M9 461 aa14.77□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 FAM117BQ6P1L5 589 aa14.77□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 POTEGQ6S5H5 508 aa14.77□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 HFE2Q6ZVN8 426 aa14.77□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 SAMD3Q8N6K7 520 aa14.77□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 SEPT8Q92599 483 aa14.77□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 ALG1Q9BT22 464 aa14.77□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 INCENPQ9NQS7 918 aa14.77□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 HELLSQ9NRZ9 838 aa14.77□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 TOMM22Q9NS69 142 aa14.77□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.6 ms