RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464280.5

NISCH-204, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 3

Gene NISCH, Length 833 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-204ENST00000464280 PKN1Q16512 942 aa13.36□□□□□ -0.27
NISCH-204ENST00000464280 DGKDQ16760 1214 aa13.36□□□□□ -0.27
NISCH-204ENST00000464280 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
NISCH-204ENST00000464280 MYSM1Q5VVJ2 828 aa13.36□□□□□ -0.27
NISCH-204ENST00000464280 MCTP2Q6DN12 878 aa13.36□□□□□ -0.27
NISCH-204ENST00000464280 NLRX1Q86UT6 975 aa13.36□□□□□ -0.27
NISCH-204ENST00000464280 SLC43A3Q8NBI5 491 aa13.36□□□□□ -0.27
NISCH-204ENST00000464280 CCDC148Q8NFR7 591 aa13.36□□□□□ -0.27
NISCH-204ENST00000464280 PPTC7Q8NI37 304 aa13.36□□□□□ -0.27
NISCH-204ENST00000464280 AFG1LQ8WV93 481 aa13.36□□□□□ -0.27
NISCH-204ENST00000464280 CDHR1Q96JP9 859 aa13.36□□□□□ -0.27
NISCH-204ENST00000464280 GDF15Q99988 308 aa13.36□□□□□ -0.27
NISCH-204ENST00000464280 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
NISCH-204ENST00000464280 ZMYND12Q9H0C1 365 aa13.36□□□□□ -0.27
NISCH-204ENST00000464280 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
NISCH-204ENST00000464280 C6orf50Q9HD87 102 aa13.36□□□□□ -0.27
NISCH-204ENST00000464280 TMEM39AQ9NV64 488 aa13.36□□□□□ -0.27
NISCH-204ENST00000464280 RTEL1Q9NZ71 1219 aa13.36□□□□□ -0.27
NISCH-204ENST00000464280 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
NISCH-204ENST00000464280 A0A1W2PPC1 479 aa13.35□□□□□ -0.27
NISCH-204ENST00000464280 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa13.35□□□□□ -0.27
NISCH-204ENST00000464280 MAFGO15525 162 aa13.35□□□□□ -0.27
NISCH-204ENST00000464280 CDKL5O76039 1030 aa13.35□□□□□ -0.27
NISCH-204ENST00000464280 DEXIO95424 95 aa13.35□□□□□ -0.27
NISCH-204ENST00000464280 GGPS1O95749 300 aa13.35□□□□□ -0.27
NISCH-204ENST00000464280 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
NISCH-204ENST00000464280 AK2P54819 239 aa13.35□□□□□ -0.27
NISCH-204ENST00000464280 SP2Q02086 613 aa13.35□□□□□ -0.27
NISCH-204ENST00000464280 FAAP100Q0VG06 881 aa13.35□□□□□ -0.27
NISCH-204ENST00000464280 NEDD9Q14511 834 aa13.35□□□□□ -0.27
NISCH-204ENST00000464280 FAM126BQ8IXS8 530 aa13.35□□□□□ -0.27
NISCH-204ENST00000464280 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
NISCH-204ENST00000464280 BICD2Q8TD16 824 aa13.35□□□□□ -0.27
NISCH-204ENST00000464280 GPRASP2Q96D09 838 aa13.35□□□□□ -0.27
NISCH-204ENST00000464280 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
NISCH-204ENST00000464280 PRO3102Q9H379 93 aa13.35□□□□□ -0.27
NISCH-204ENST00000464280 MLXIPQ9HAP2 919 aa13.35□□□□□ -0.27
NISCH-204ENST00000464280 SH3GLB2Q9NR46 395 aa13.35□□□□□ -0.27
NISCH-204ENST00000464280 TPCN1Q9ULQ1 816 aa13.35□□□□□ -0.27
NISCH-204ENST00000464280 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
NISCH-204ENST00000464280 TRIM43BA6NCK2 446 aa13.34□□□□□ -0.27
NISCH-204ENST00000464280 KIAA0355O15063 1070 aa13.34□□□□□ -0.27
NISCH-204ENST00000464280 PFKFB2O60825 505 aa13.34□□□□□ -0.27
NISCH-204ENST00000464280 CLK2P49760 499 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
NISCH-204ENST00000464280 PSMC6P62333 389 aa13.34□□□□□ -0.27
NISCH-204ENST00000464280 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
NISCH-204ENST00000464280 SCRN1Q12765 414 aa13.34□□□□□ -0.27
NISCH-204ENST00000464280 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
NISCH-204ENST00000464280 NFRKBQ6P4R8 1299 aa13.34□□□□□ -0.27
NISCH-204ENST00000464280 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa13.34□□□□□ -0.27
NISCH-204ENST00000464280 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
NISCH-204ENST00000464280 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
NISCH-204ENST00000464280 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
NISCH-204ENST00000464280 SPATA33Q96N06 139 aa13.34□□□□□ -0.27
NISCH-204ENST00000464280 SENP7Q9BQF6 1050 aa13.34□□□□□ -0.27
NISCH-204ENST00000464280 KATNAL1Q9BW62 490 aa13.34□□□□□ -0.27
NISCH-204ENST00000464280 ANO3Q9BYT9 981 aa13.34□□□□□ -0.27
NISCH-204ENST00000464280 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
NISCH-204ENST00000464280 GRIN2DO15399 1336 aa13.34□□□□□ -0.27
NISCH-204ENST00000464280 PPFIA3O75145 1194 aa13.33□□□□□ -0.28
NISCH-204ENST00000464280 PPFIA4O75335 1185 aa13.33□□□□□ -0.28
NISCH-204ENST00000464280 CD4P01730 458 aa13.33□□□□□ -0.28
NISCH-204ENST00000464280 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa13.33□□□□□ -0.28
NISCH-204ENST00000464280 RAG1P15918 1043 aa13.33□□□□□ -0.28
NISCH-204ENST00000464280 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
NISCH-204ENST00000464280 MTMR1Q13613 665 aa13.33□□□□□ -0.28
NISCH-204ENST00000464280 NBPF20Q3BBV1 942 aa13.33□□□□□ -0.28
NISCH-204ENST00000464280 METTL7BQ6UX53 244 aa13.33□□□□□ -0.28
NISCH-204ENST00000464280 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
NISCH-204ENST00000464280 JADE2Q9NQC1 790 aa13.33□□□□□ -0.28
NISCH-204ENST00000464280 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa13.33□□□□□ -0.28
NISCH-204ENST00000464280 TANC1Q9C0D5 1861 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-204ENST00000464280 NOP56O00567 594 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
NISCH-204ENST00000464280 TIMP1P01033 207 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-204ENST00000464280 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
NISCH-204ENST00000464280 ITGB5P18084 799 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-204ENST00000464280 SREBF1P36956 1147 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-204ENST00000464280 SEMA3FQ13275 785 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-204ENST00000464280 HSDL1Q3SXM5 330 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-204ENST00000464280 FAM47CQ5HY64 1035 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-204ENST00000464280 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-204ENST00000464280 CYFIP1Q7L576 1253 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-204ENST00000464280 BADQ92934 168 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-204ENST00000464280 MXRA8Q9BRK3 442 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-204ENST00000464280 C22orf23Q9BZE7 217 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-204ENST00000464280 TMEM260Q9NX78 707 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-204ENST00000464280 VPS54Q9P1Q0 977 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-204ENST00000464280 TBX21Q9UL17 535 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-204ENST00000464280 STK36Q9NRP7 1315 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-204ENST00000464280 SCN5AQ14524 2016 aa13.31□□□□□ -0.28
NISCH-204ENST00000464280 SORBS3O60504 671 aa13.31□□□□□ -0.28
NISCH-204ENST00000464280 B4GALT4O60513 344 aa13.31□□□□□ -0.28
NISCH-204ENST00000464280 XBP1P17861 261 aa13.31□□□□□ -0.28
NISCH-204ENST00000464280 ZNF76P36508 570 aa13.31□□□□□ -0.28
NISCH-204ENST00000464280 NLRP5P59047 1200 aa13.31□□□□□ -0.28
NISCH-204ENST00000464280 ARHGAP4P98171 946 aa13.31□□□□□ -0.28
NISCH-204ENST00000464280 CEP55Q53EZ4 464 aa13.31□□□□□ -0.28
NISCH-204ENST00000464280 GALNT17Q6IS24 598 aa13.31□□□□□ -0.28
NISCH-204ENST00000464280 TDHQ8IZJ6 230 aa13.31□□□□□ -0.28
NISCH-204ENST00000464280 PGBD1Q96JS3 809 aa13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.6 ms