RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463022.1

SP110-208, Transcript of SP110 nuclear body protein, human

TSL 2

Gene SP110, Length 405 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SP110-208	ENST00000463022	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	ANO1	Q5XXA6	986 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022		Q6ZUG5	572 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	RUFY3	Q7L099	469 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	TLK2	Q86UE8	772 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	MICU3	Q86XE3	530 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	HOMER1	Q86YM7	354 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	CUL5	Q93034	780 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	TOX2	Q96NM4	488 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	MYL10	Q9BUA6	226 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	REPIN1	Q9BWE0	567 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	PXMP2	Q9NR77	195 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	COL20A1	Q9P218	1284 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	RABGEF1	Q9UJ41	708 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SP110-208	ENST00000463022		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022		A6NJR5	290 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	MEIS2	O14770	477 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	ADCY6	O43306	1168 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	ASGR1	P07306	291 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	TGFB3	P10600	412 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	CCND2	P30279	289 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	BMP8B	P34820	402 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	CPT1A	P50416	773 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	RTP1	P59025	263 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	PGM5	Q15124	567 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	MCTP2	Q6DN12	878 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	IL27	Q8NEV9	243 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	TBC1D5	Q92609	795 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	BRF1	Q92994	677 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	PRO3102	Q9H379	93 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	BARHL2	Q9NY43	387 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	ESYT2	A0FGR8	921 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	MYADML2	A6NDP7	307 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	ARVCF	O00192	962 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	KIAA0355	O15063	1070 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	RGS20	O76081	388 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	GH1	P01241	217 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	CPA1	P15085	419 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	IFNAR1	P17181	557 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	RXRA	P19793	462 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	CDC27	P30260	824 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	ICAM3	P32942	547 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	CDK7	P50613	346 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62

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