RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462721.5

DMKN-222, Transcript of dermokine, human

TSL 1 (best)

Gene DMKN, Length 970 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DMKN-222	ENST00000462721	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	12.91	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	12.91	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	CCL23	P55773	120 aa		12.91	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		12.91	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		12.91	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	RUFY3	Q7L099	469 aa		12.91	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	NLRX1	Q86UT6	975 aa		12.91	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	DEFB123	Q8N688	67 aa		12.91	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		12.91	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		12.91	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		12.91	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		12.9	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		12.9	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	SMCO2	A6NFE2	343 aa		12.9	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		12.9	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	FIBP	O43427	364 aa		12.9	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	ACR	P10323	421 aa		12.9	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	12.9	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	NAPA	P54920	295 aa		12.9	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	EVC	P57679	992 aa		12.9	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	NEDD9	Q14511	834 aa		12.9	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	UBE2S	Q16763	222 aa		12.9	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	TMEM240	Q5SV17	173 aa		12.9	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		12.9	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	ZNF365	Q70YC5	407 aa		12.9	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721		Q7L0L9	218 aa		12.9	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	SESTD1	Q86VW0	696 aa		12.9	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		12.9	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	12.9	□□□□□ -0.34	2e-7	■■□□□ 12.5
DMKN-222	ENST00000462721	ALG1	Q9BT22	464 aa		12.9	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		12.9	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	IL23A	Q9NPF7	189 aa		12.9	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		12.9	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	BARHL2	Q9NY43	387 aa		12.9	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		12.9	□□□□□ -0.34
DMKN-222	ENST00000462721	STXBP3	O00186	592 aa		12.89	□□□□□ -0.35
DMKN-222	ENST00000462721	HAS3	O00219	553 aa		12.89	□□□□□ -0.35
DMKN-222	ENST00000462721	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	12.89	□□□□□ -0.35
DMKN-222	ENST00000462721	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	12.89	□□□□□ -0.35
DMKN-222	ENST00000462721	FGB	P02675	491 aa		12.89	□□□□□ -0.35
DMKN-222	ENST00000462721	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	12.89	□□□□□ -0.35
DMKN-222	ENST00000462721	PSEN2	P49810	448 aa		12.89	□□□□□ -0.35
DMKN-222	ENST00000462721	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	12.89	□□□□□ -0.35
DMKN-222	ENST00000462721	SEMA3F	Q13275	785 aa		12.89	□□□□□ -0.35
DMKN-222	ENST00000462721	PTGIS	Q16647	500 aa		12.89	□□□□□ -0.35
DMKN-222	ENST00000462721	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		12.89	□□□□□ -0.35
DMKN-222	ENST00000462721	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	12.89	□□□□□ -0.35
DMKN-222	ENST00000462721	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		12.89	□□□□□ -0.35
DMKN-222	ENST00000462721	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	12.89	□□□□□ -0.35
DMKN-222	ENST00000462721	C7orf31	Q8N865	590 aa		12.89	□□□□□ -0.35
DMKN-222	ENST00000462721	RETREG2	Q8NC44	543 aa		12.89	□□□□□ -0.35
DMKN-222	ENST00000462721	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		12.89	□□□□□ -0.35
DMKN-222	ENST00000462721	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		12.89	□□□□□ -0.35
DMKN-222	ENST00000462721	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		12.89	□□□□□ -0.35
DMKN-222	ENST00000462721	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		12.89	□□□□□ -0.35
DMKN-222	ENST00000462721	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		12.89	□□□□□ -0.35
DMKN-222	ENST00000462721	NOD1	Q9Y239	953 aa		12.89	□□□□□ -0.35
DMKN-222	ENST00000462721	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
DMKN-222	ENST00000462721	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
DMKN-222	ENST00000462721	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		12.88	□□□□□ -0.35
DMKN-222	ENST00000462721	MAFG	O15525	162 aa		12.88	□□□□□ -0.35
DMKN-222	ENST00000462721	ATP9A	O75110	1047 aa		12.88	□□□□□ -0.35
DMKN-222	ENST00000462721	F2	P00734	622 aa		12.88	□□□□□ -0.35
DMKN-222	ENST00000462721	ZNF286B	P0CG31	522 aa		12.88	□□□□□ -0.35
DMKN-222	ENST00000462721	ITGB5	P18084	799 aa		12.88	□□□□□ -0.35
DMKN-222	ENST00000462721	ADCY7	P51828	1080 aa		12.88	□□□□□ -0.35
DMKN-222	ENST00000462721	MFSD10	Q14728	455 aa		12.88	□□□□□ -0.35
DMKN-222	ENST00000462721	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
DMKN-222	ENST00000462721	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
DMKN-222	ENST00000462721	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		12.88	□□□□□ -0.35
DMKN-222	ENST00000462721	METTL7B	Q6UX53	244 aa		12.88	□□□□□ -0.35
DMKN-222	ENST00000462721	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
DMKN-222	ENST00000462721	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
DMKN-222	ENST00000462721	SCLY	Q96I15	445 aa		12.88	□□□□□ -0.35
DMKN-222	ENST00000462721	CDHR1	Q96JP9	859 aa		12.88	□□□□□ -0.35
DMKN-222	ENST00000462721	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		12.88	□□□□□ -0.35
DMKN-222	ENST00000462721	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		12.88	□□□□□ -0.35
DMKN-222	ENST00000462721	JADE2	Q9NQC1	790 aa		12.88	□□□□□ -0.35
DMKN-222	ENST00000462721	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		12.88	□□□□□ -0.35
DMKN-222	ENST00000462721	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		12.88	□□□□□ -0.35
DMKN-222	ENST00000462721		H3BRB1	525 aa		12.87	□□□□□ -0.35
DMKN-222	ENST00000462721	PITPNM1	O00562	1244 aa		12.87	□□□□□ -0.35
DMKN-222	ENST00000462721	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
DMKN-222	ENST00000462721	IQCF3	P0C7M6	154 aa		12.87	□□□□□ -0.35
DMKN-222	ENST00000462721	SCG2	P13521	617 aa		12.87	□□□□□ -0.35
DMKN-222	ENST00000462721	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
DMKN-222	ENST00000462721	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
DMKN-222	ENST00000462721	BFSP2	Q13515	415 aa		12.87	□□□□□ -0.35
DMKN-222	ENST00000462721	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
DMKN-222	ENST00000462721	NTRK3	Q16288	839 aa		12.87	□□□□□ -0.35
DMKN-222	ENST00000462721	PKN1	Q16512	942 aa		12.87	□□□□□ -0.35
DMKN-222	ENST00000462721	RASIP1	Q5U651	963 aa		12.87	□□□□□ -0.35
DMKN-222	ENST00000462721	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
DMKN-222	ENST00000462721	HERVK_113	Q902F9	699 aa		12.87	□□□□□ -0.35
DMKN-222	ENST00000462721	GPRASP2	Q96D09	838 aa		12.87	□□□□□ -0.35
DMKN-222	ENST00000462721	VWCE	Q96DN2	955 aa		12.87	□□□□□ -0.35
DMKN-222	ENST00000462721	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
DMKN-222	ENST00000462721	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		12.87	□□□□□ -0.35
DMKN-222	ENST00000462721	GPR20	Q99678	358 aa		12.87	□□□□□ -0.35

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