RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 TECP42680 631 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 TXKP42681 527 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 STX17P56962 302 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 SNAP25P60880 206 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 ATP2B2Q01814 1243 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 STK4Q13043 487 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 PAK1Q13153 545 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 RASA3Q14644 834 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 TNIP1Q15025 636 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 FAM83BQ5T0W9 1011 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 CENPPQ6IPU0 288 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 UNC13DQ70J99 1090 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 REXO1L1PQ8IX06 675 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 DRC7Q8IY82 874 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 OGFOD1Q8N543 542 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC112Q8NEF3 446 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 MYRIPQ8NFW9 859 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 NELFBQ8WX92 580 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 PRIMPOLQ96LW4 560 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 LRWD1Q9UFC0 647 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 CTNND2Q9UQB3 1225 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 LRRC37A2A6NM11 1700 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 ABCB11O95342 1321 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF541Q9H0D2 1346 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 A0A1W2PQC6 194 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 TRIM49BA6NDI0 452 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 RASSF10A6NK89 507 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 H7C1D1 291 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 TK2O00142 265 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 MSH4O15457 936 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 CTIFO43310 598 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 SERPINC1P01008 464 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 GYPCP04921 128 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 TPM2P07951 284 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 ASNSP08243 561 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 CCNE1P24864 410 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 POLD1P28340 1107 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 INPP5BP32019 993 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 PPP1R2P41236 205 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 HSD17B4P51659 736 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 STAT2P52630 851 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 COPB1P53618 953 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 SLC12A3P55017 1021 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 RASSF7Q02833 373 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 SPAG1Q07617 926 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 TRAF1Q13077 416 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 MCM6Q14566 821 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 ARSHQ5FYA8 562 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 TCP11X2Q5H9J9 407 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 CEP135Q66GS9 1140 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 LRRC55Q6ZSA7 311 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 FAM160B2Q86V87 743 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 KCTD17Q8N5Z5 321 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 CLEC4DQ8WXI8 215 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 TBC1D5Q92609 795 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 SLC5A5Q92911 643 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 P2RX5Q93086 422 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 GJA10Q969M2 543 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 CALML4Q96GE6 196 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 FAM20AQ96MK3 541 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 PANX2Q96RD6 677 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 PLIN2Q99541 437 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 WDR18Q9BV38 432 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 TRIM34Q9BYJ4 488 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 TTYH3Q9C0H2 523 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 SEMA6BQ9H3T3 888 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 THAP9Q9H5L6 903 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 SPON1Q9HCB6 807 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 GOPCQ9HD26 462 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 FEM1BQ9UK73 627 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 ARID2Q68CP9 1835 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 LGALS16A8MUM7 142 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 KCNJ18B7U540 433 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 PSMA7O14818 248 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 WDR46O15213 610 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 STX10O60499 249 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 MED24O75448 989 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 PSMD10O75832 226 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 RGS20O76081 388 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 FCER1AP12319 257 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 CYP11B2P19099 503 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP6.32□□□□□ -1.4
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